? 近期，農(nóng)學院關(guān)雪瑩課題組團隊根據(jù)動物細胞中CUT&Tag的方法，以棉花為模型系統(tǒng)，發(fā)展了一套在植物中進行CUT&Tag的方法，為植物染色質(zhì)狀態(tài)的表觀遺傳研究提供了一個比ChIP更加優(yōu)秀可行的方法。相關(guān)研究成果以“Efficient Chromatin Profiling of H3K4me3 Modification in Cotton Using CUT&Tag”為題發(fā)表在《Plant Methods》上。
研究提供了一種使用植物細胞核分離的方式改進的CUT＆Tag方法，并建立了適用于異源四倍體基因組的生物信息分析工作流程。本研究方法也可以廣泛用于其他組織和植物。研究結(jié)果表明，與ChIP-seq相比，CUT＆Tag方法比常規(guī)ChIP的實驗流程更快，并且顯示了更高的分辨率，更低的背景信號和更好的重復性。該成果專門為植物細胞設(shè)計的優(yōu)化的CUT＆Tag方法具有廣泛的植物表觀遺傳研究用途。
關(guān)雪瑩教授、陶曉園博士、馮守禮博士、趙汀博士共同參與了此項研究，該研究項目得到了國家青年基金面上項目和青年項目，國家重點研發(fā)計劃七大農(nóng)作物育種專項（子任務(wù)），中國博士后基金，大北農(nóng)基金，中央高?；究蒲袠I(yè)務(wù)費，江蘇省協(xié)同創(chuàng)新中心的支持。
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? （作物所供稿）
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