高中山教授領(lǐng)銜的研究團(tuán)隊(duì)完成了中國楊梅全基因組測序組裝、基因注釋,并解析了雌雄性別控制遺傳模式。近日,在國際植物生物技術(shù)知名期刊Plant Biotechnology Journal(IF=6.3)以“The red bayberry genome and genetic basis of sex determination”為題發(fā)表。浙江大學(xué)賈慧敏博士、賈惠娟教授、杭州和壹基因公司的蔡慶樂為共同第一作者,高中山教授和王軍一博士為共同通訊作者。
楊梅是我國南方重要的果樹樹種,雌雄異株,有2000多年的栽培歷史。楊梅果實(shí)營養(yǎng)豐富、風(fēng)味獨(dú)特,而且具有獨(dú)特的保健功能。利用二代和三代基因組測序技術(shù)對楊梅雌、雄兩個(gè)品系的全基因組測序。楊梅基因組大小為320Mb,組裝基因組大小313 Mb,占預(yù)測基因組大小的97%,8條染色體,預(yù)測出蛋白編碼基因32493個(gè)。通過雌雄兩個(gè)自然群體混合樣重測序比較發(fā)現(xiàn)了楊梅性別控制區(qū)域在59Kb范圍內(nèi),包含性別決定候選基因,推導(dǎo)出性別決定模式為ZW型,雌性為雜合ZW型,雄性為純合ZZ型。開發(fā)的雌雄性別關(guān)聯(lián)分子標(biāo)記可以直接應(yīng)用于楊梅雜交苗的性別早期鑒定。本研究對于楊梅遺傳育種以及分子生物學(xué)研究具有重要的里程碑意義。
論文主要參加單位還有余姚林業(yè)特產(chǎn)技術(shù)推廣總站,中國農(nóng)科院作物所,中科院上海生命科學(xué)研究院逆境生物學(xué)研究中心,上海農(nóng)科院林果所,寧波農(nóng)科院林業(yè)研究所、慈溪林業(yè)技術(shù)推廣總站和荷蘭瓦赫寧根大學(xué)研究院。研究得到了國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31471843, 31772271)以及余姚市農(nóng)林局、寧波科技項(xiàng)目的資助。
論文鏈接:https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1111/pbi.12985
(果樹科學(xué)研究所)
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