李為民教授、彭勇教授團(tuán)隊(duì)在Molecular Cancer發(fā)表環(huán)狀RNA研究成果
近日，我院李為民教授、彭勇教授團(tuán)隊(duì)在腫瘤學(xué)領(lǐng)域著名期刊Molecular Cancer（IF=10.68）發(fā)表了非小細(xì)胞肺癌中環(huán)狀RNA（circular RNA, circRNA）的最新研究成果，證明了circRNA可作為肺癌診斷的新型標(biāo)志物。
該研究由華西醫(yī)院獨(dú)立完成，通訊作者為呼吸與危重癥醫(yī)學(xué)科李為民教授和生物治療國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室彭勇教授。我院呼吸與危重癥醫(yī)學(xué)科在讀博士研究生王成弟、生物治療國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室在讀博士研究生譚雙燕與劉文榮為并列第一作者。本研究得到了國(guó)家自然科學(xué)基金等項(xiàng)目的支持。
肺癌是發(fā)病率和死亡率最高的惡性腫瘤之一，其中包括肺腺癌(LUAD)和肺鱗癌(LUSC)等病理類型的非小細(xì)胞肺癌（NSCLC）約占為85%。盡管近年來肺癌的診斷和治療取得了一定進(jìn)展，但其5年總生存率仍然很差，例如我國(guó)肺癌患者五年生存率僅為19.8%。因此，尋找靈敏度高、特異性好的新型生物標(biāo)志物，對(duì)于肺癌早期篩查及其治療非常重要。
CircRNA是一類具有閉合環(huán)狀結(jié)構(gòu)的RNA分子，由初始RNA轉(zhuǎn)錄本（primary transcripts）經(jīng)反向剪切（back-splicing）形成，不受核酸外切酶降解。因此，circRNA在細(xì)胞和體液中穩(wěn)定性較高，具有作為新型標(biāo)志物的潛力。最新的研究表明，circRNA參與機(jī)體的正常生理活動(dòng)，在腫瘤等重大疾病中也發(fā)揮著重要作用。但circRNA在肺腺癌和肺鱗癌中的表達(dá)及其作用機(jī)制尚不清楚、有待研究。
該研究團(tuán)隊(duì)通過RNase R消化來富集circRNA，構(gòu)建文庫(kù)進(jìn)行高通量測(cè)序，并整合分析五個(gè)circRNA軟件包，鑒定了circRNA在肺癌及其癌旁組織中的表達(dá)譜。研究表明，不同種類的circRNAs在肺癌組織中廣泛表達(dá)，主要來源于基因的外顯子區(qū)域。肺腺癌和肺鱗癌不僅具有共同的circRNA差異表達(dá)譜，而且還有各自獨(dú)特的circRNA表達(dá)模式，表明circRNA具有作為非小細(xì)胞肺癌診斷標(biāo)志物的潛力。
更多的臨床樣本證明，肺腺癌和肺鱗癌中hsa_circ_0001821的表達(dá)均顯著升高，而hsa_circ_0077837的表達(dá)則顯著降低。更為重要的是，ROC曲線分析表明，hsa_circ_0073837和hsa_circ_0001821可作為肺腺癌和肺鱗癌共同的分子標(biāo)志物；hsa_circ_0001073和hsa_circ_0001495分別作為肺腺癌和肺鱗癌的特異性標(biāo)志物，并且具有較高的診斷效能。
本研究通過對(duì)臨床樣本進(jìn)行高通量測(cè)序，運(yùn)用生物信息學(xué)大數(shù)據(jù)分析，結(jié)合生物學(xué)實(shí)驗(yàn)證明，發(fā)現(xiàn)circRNA具有作為新型分子標(biāo)志物的潛力，為非小細(xì)胞肺癌病理亞型的臨床診斷提供了新思路和新方法。
原文鏈接：https://molecular-cancer.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12943-019-1061-8
作者：蒲劍 白蓓編輯：史杰蔚 周亮來源：雙一流辦公室
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