繼2013年參與完成了蓮( Nelumbo nucifera Gaertn.)核基因組測定(The Plant Journal 2013,76:557-567)、2014年完成蓮葉綠體基因組測定(BMC plant biology,2014, 14:289)、2016年5月完成了蓮著絲粒蛋白和著絲粒DNA序列的特征研究(The Plant Journal :http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/tpj.13219/full)后,我院雜交水稻國家重點實驗室丁毅教授團隊于2016年7月22日在Scientific Reports( Scientific reports 2016, 6:30158 | DOI: 10.1038/srep30158)上在線發(fā)表題為 “The mitochondrial genome map of Nelumbo nucifera reveals ancient evolutionary features” 的研究論文。該論文首次完成了蓮線粒體基因組的全基因組測序和線粒體基因組物理圖的組裝,并揭示了蓮作為基部雙子葉植物的古老進化特征。該論文共同第一作者為博士生桂松濤和博士吳智華,通訊作者為丁毅教授。
作為孓遺植物的代表之一,對蓮的基因組學的研究對于探索高等被子植物進化具有十分重要的意義。在該項研究中,作者利用第三代基因組單分子測序技術(shù)(SMRT)對蓮的線粒體基因組進行了測序、組裝和注釋,得到了蓮線粒體基因組序列和完整基因組圖譜,并揭示了蓮線粒體基因組具有進化上的保守性特征,即保留著古老的基因簇和基因數(shù)目、高頻率的RNA編輯以及低頻率的葉綠體片段的插入等現(xiàn)象。這是丁毅教授課題組對蓮基因組學研究的系列工作之一,作為國家自然科學基金資助的蓮基因組研究計劃的一部分工作,蓮線粒體基因組圖譜的完成,為全面理解蓮基因組特征以及探索被子植物進化途徑提供了新的線索,也豐富了被子植物基因組進化的數(shù)據(jù)資料。
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