?????? 近日,王連榮和陳實(shí)教授課題組與他人合作在國(guó)際著名期刊Nature Communications上發(fā)表了題為“Genomic mapping of phosphorothioates reveals partial modification of short consensus sequences”的學(xué)術(shù)論文,標(biāo)志著他們?cè)贒NA磷硫?;揎椦芯可嫌秩〉昧诵碌倪M(jìn)展。
??????? 他們課題組應(yīng)用最新發(fā)展起來的單分子實(shí)時(shí)測(cè)序技術(shù),對(duì)一株海洋弧菌中的DNA磷硫?;揎椢稽c(diǎn)進(jìn)行了基因組水平的精細(xì)定位。在基因組檢測(cè)到的21778個(gè)修飾位點(diǎn)中,有19005個(gè)位點(diǎn)分布于基因中,151個(gè)分布于tRNA中,761個(gè)分布于rRNA上,其余1861個(gè)分布于非編碼區(qū)。這項(xiàng)研究發(fā)現(xiàn)了一種與以往完全不一樣的修飾形式:在這種弧菌中,DNA磷硫?;揎棸l(fā)生在CCA序列模塊上,并且是特征性的DNA單鏈修飾。并發(fā)現(xiàn)DNA磷硫?;揎棽煌谝酝募谆揎?,在基因組上的修飾是以部分修飾的狀態(tài)存在,只在約14%的CCA位點(diǎn)上存在修飾,而且在不同分子的同一個(gè)特定位點(diǎn)有時(shí)修飾有時(shí)不修飾。
??????? 在前期工作中,他們與鄧子新院士和Peter Dedon教授發(fā)現(xiàn)了DNA骨架上的磷硫酰化這一新型修飾,即硫原子取代了DNA上磷酸骨架上非橋聯(lián)的氧原子,是迄今為止DNA骨架上發(fā)現(xiàn)的第一例生理修飾,又被稱為DNA上的第六元素,獲評(píng)《環(huán)球科學(xué)》2007年度十大科學(xué)進(jìn)展(2007 Global Science Top10)。王連榮和陳實(shí)教授這次聯(lián)合上海交通大學(xué)、美國(guó)麻省理工學(xué)院和美國(guó)PacBio公司通力合作又取得了這一新進(jìn)展,解決了多年來的一個(gè)科學(xué)難題,為探尋DNA磷硫?;揎椀纳飳W(xué)功能奠定了基礎(chǔ),表明他們?cè)贒NA磷硫?;揎楊I(lǐng)域取得了系統(tǒng)性的創(chuàng)新成果。王連榮教授和陳實(shí)教授為共同通訊作者,研究生陳超、熊嘯林參與了該項(xiàng)研究。該研究得到了國(guó)家重點(diǎn)基礎(chǔ)研究發(fā)展計(jì)劃、國(guó)家自然科學(xué)基金等項(xiàng)目的支持。
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