近日,我院周慶華課題組在Science Advances上發(fā)表了題為“N6-methyldeoxyadenine and histone methylation mediate transgenerational survival advantages induced by hormetic heat stress”的研究論文。第一作者為我院博士后萬(wàn)欽黎。
該研究利用秀麗隱桿線蟲為模型,發(fā)現(xiàn)輕度的熱激會(huì)導(dǎo)致線蟲的壽命延長(zhǎng),且這種現(xiàn)象在未經(jīng)熱激的后代中仍然能維持到F5代,進(jìn)一步機(jī)制研究揭示了這種跨代遺傳效應(yīng)被組蛋白H3K9me3和DNA的N6-mA(DNA上的N6-甲基腺嘌呤)的修飾所介導(dǎo)。
溫度是重要的環(huán)境因素,機(jī)體的環(huán)境經(jīng)歷不可避免地包括溫度的影響。已有研究表明,輕度的熱應(yīng)激(包括由輕度的高溫刺激或短期致死性的高溫刺激所引起的熱應(yīng)激)可延長(zhǎng)機(jī)體的壽命和增加其抗逆性。這種對(duì)壓力耐受力的適應(yīng)性誘導(dǎo)被稱為“低毒性興奮效應(yīng)”,該現(xiàn)象已經(jīng)在多種模式生物中有報(bào)道。而已有研究表明,當(dāng)環(huán)境因素影響到生物體生理和行為時(shí),機(jī)體會(huì)以非遺傳信息的形式將這種影響因素傳遞給后代,即為表觀遺傳。那么,溫度作為重要的環(huán)境因素,其誘導(dǎo)的“低毒性興奮效應(yīng)”是否也有有跨代遺傳(TEI)現(xiàn)象呢?如果有,其機(jī)制是什么呢?
在本篇文章中,作者用衰老和跨代遺傳研究的首選模式生物-秀麗隱桿線蟲,發(fā)現(xiàn)熱激的親代和它們的后代(后代未經(jīng)熱激,培養(yǎng)在線蟲正常培養(yǎng)溫度20 ℃)表現(xiàn)出壽命的顯著延長(zhǎng)。且這種效應(yīng)可以一直傳遞到F5代,即使F1-F4代從未經(jīng)歷過熱激,到第六代(F6)恢復(fù)正常壽命。此外,熱激的雄性與非熱激雌雄同體交配,或非熱激的雄性與熱激的雌雄同體交配,得到的F1子代及其F2代都顯示顯著的壽命延長(zhǎng),這表明父系和母系均可以傳遞由熱應(yīng)激誘導(dǎo)的信息,從而導(dǎo)致后代的生存優(yōu)勢(shì)。
進(jìn)一步的機(jī)制研究發(fā)現(xiàn),轉(zhuǎn)錄因子HSF-1、DAF-16和核受體DAF-12參與了這種熱應(yīng)激誘導(dǎo)的壽命延長(zhǎng)的跨代遺傳的調(diào)控。為了解析hsf-1,daf-16和daf-12在該跨代遺傳效應(yīng)中的作用是執(zhí)行熱應(yīng)激反應(yīng),或是傳遞可遺傳的記憶,還是同時(shí)參與兩者,作者通過親代(P0)或者子代(F1)代特異地RNAi沉默分析,發(fā)現(xiàn)hsf-1和daf-12在子代中的作用是執(zhí)行熱壓力應(yīng)答去延長(zhǎng)壽命,而DAF-16不僅參與執(zhí)行熱應(yīng)答,還參與跨代記憶的傳遞。
由于所觀察到的熱壓力誘導(dǎo)的生存優(yōu)勢(shì)會(huì)在有限世代內(nèi)恢復(fù)到正常水平,作者猜測(cè)這一現(xiàn)象可能是受到表觀遺傳的調(diào)控。通過對(duì)參與表觀遺傳調(diào)控的部分基因突變株進(jìn)行檢測(cè),發(fā)現(xiàn)組蛋白H3K9me3修飾參與該跨代遺傳效應(yīng)。除了組蛋白修飾的作用外,DNA甲基化也可以成為可遺傳信息的載體。作者用dot blot分析,發(fā)現(xiàn)DNA的N6-mA修飾在熱激的P0代中顯著升高,且這種DNA的N6-mA修飾的增加在子代中可一直維持四代,即使子代從未受到任何熱激,這一發(fā)現(xiàn)與F6代恢復(fù)正常壽命一致。此外,N6-mA甲基轉(zhuǎn)移酶功能缺失突變體damt-1(tm6887)和damt-1(VC40319)在熱應(yīng)激后均不提高N6-mA的水平。且生存分析發(fā)現(xiàn)damt-1突變體消除了熱應(yīng)激記憶的傳遞。這些結(jié)果表明DNA N6-mA修飾參與熱應(yīng)激誘導(dǎo)壽命延長(zhǎng)的跨代遺傳。
通過采用H3K9me3 ChIP和N6-mA MeDIP技術(shù),作者進(jìn)一步揭示了H3K9me3和N6-mA這兩種修飾在熱應(yīng)激誘導(dǎo)的生存優(yōu)勢(shì)的跨代遺傳中的調(diào)控機(jī)制——在熱壓力下,一些基因的H3K9me3修飾水平降低,同時(shí)伴隨著N6-mA水平的升高,且這種表觀遺傳修飾的標(biāo)記在子代中得以維持,并協(xié)同促進(jìn)應(yīng)激反應(yīng)相關(guān)基因的轉(zhuǎn)錄,最終實(shí)現(xiàn)熱應(yīng)激后代壽命的延長(zhǎng)。有趣的是,在這項(xiàng)研究中作者發(fā)現(xiàn),在參與熱激誘導(dǎo)生存優(yōu)勢(shì)的跨代遺傳調(diào)控的轉(zhuǎn)錄因子HSF-1,DAF-16和DAF-12中,DAF-16參與調(diào)控?zé)釅毫φT導(dǎo)的N6-mA升高以傳遞跨代記憶。
總之,在這項(xiàng)研究中,作者發(fā)現(xiàn)父母代可以傳遞由熱休克誘導(dǎo)的信息,從而導(dǎo)致后代的生存受益,使得后代的壽命和健康壽命得以延長(zhǎng)。而在這個(gè)信息傳遞過程中,涉及H3K9me3和N6-mA依賴性的跨代遺傳網(wǎng)絡(luò),這些遺傳網(wǎng)絡(luò)賦予基因表達(dá)的改變,最終導(dǎo)致后代的生存優(yōu)勢(shì)。這個(gè)跨代遺傳過程還依賴于轉(zhuǎn)錄因子DAF-16和HSF-1以及核受體DAF-12。也就是說(shuō),在環(huán)境壓力下,親代的熱應(yīng)激會(huì)激活DAF-16,HSF-1和DAF-12來(lái)延長(zhǎng)壽命,而其中DAF-16還調(diào)控N6-mA和H3K9me3的水平并在后代中建立這些表觀遺傳標(biāo)記。反過來(lái),子代中的H3K9me3和N6-mA標(biāo)記會(huì)促進(jìn)應(yīng)激反應(yīng)相關(guān)基因(即daf-16,hsf-1和daf-12,daf-16和hsf-1的靶基因)的募集并促進(jìn)熱應(yīng)激反應(yīng)的激活,最終導(dǎo)致由熱應(yīng)激介導(dǎo)的生存優(yōu)勢(shì)的跨代表觀遺傳(下圖)。
原文鏈接:
https://advances.sciencemag.org/lookup/doi/10.1126/sciadv.eabc3026
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