凌飛教授課題組聯(lián)合華大基因李林課題組在mSystems發(fā)表結(jié)直腸癌癌旁組織微生物紊亂研究文章
4月14日，我院凌飛教授課題組聯(lián)合華大基因李林課題組在美國微生物學會旗下的mSystems（IF=6.5）雜志上在線發(fā)表以華南理工大學為第一完成單位的題為Meta-analysis of 16S rRNA Microbial Data Identified Distinctive and Predictive Microbiota Dysbiosis in Colorectal Carcinoma Adjacent Tissue的結(jié)直腸腫瘤腸道微生物研究文章。凌飛老師指導的我院2017級華工-華大聯(lián)合培養(yǎng)碩士生莫宗超和華大基因黃培德博士為本文的共同第一作者（論文鏈接：https://msystems.asm.org/content/5/2/e00138-20）。
結(jié)直腸腫瘤是當前惡性腫瘤當中被證明和腸道微生物有密切關(guān)系的癌種。目前已有大量研究利用宏基因組測序和擴增子測序深入表征結(jié)直腸腫瘤的糞便(Stools)和病灶組織(Onsite Tissue)微生物特性，但對結(jié)直腸腫瘤周邊組織(Adjacent Tissue)微生物特征的研究尚有不足。
該研究首次基于大規(guī)模的公開擴增子數(shù)據(jù)集揭示了結(jié)直腸腫瘤周邊組織的微生物紊亂現(xiàn)象。研究發(fā)現(xiàn)，當以正常結(jié)直腸組織作為對照的時候，結(jié)直腸腫瘤周邊組織與病灶組織的微生物富集和耗竭模式有高度的重疊。進一步的網(wǎng)絡(luò)互作分析表明，結(jié)直腸腫瘤周邊組織與病灶組織的微生物相互作用網(wǎng)絡(luò)高度相關(guān)，并且這種相關(guān)性在去除樣本配對關(guān)系之后依舊成立。
除此之外，運用隨機森林算法，該研究指出結(jié)直腸腫瘤周邊組織的微生物標記物可以有效區(qū)分結(jié)直腸癌和正常對照（曲線下面積AUC=0.958），在性能上和基于結(jié)直腸癌病灶組織微生物標記物的分類器（曲線下面積AUC=0.960）沒有顯著差異（DeLong's 檢驗p= 0.402），提示通過對病灶周邊組織進行取樣，一樣可以有效區(qū)分疾病組和對照組。
該研究為進一步研究腸道微生物在結(jié)直腸腫瘤發(fā)生發(fā)展過程中的生物學機制提供了重要線索，為進一步明確結(jié)直腸腫瘤病灶組織和周邊組織的“微生物-宿主”相互作用奠定基礎(chǔ)。這一發(fā)現(xiàn)亦或可推動未來基于腸道微生物的結(jié)直腸腫瘤檢測研究和應(yīng)用。
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