Nature再現(xiàn)華工學(xué)子論文 為人類腸道微生物“登記戶口”
? ?人類的腸道是一個(gè)龐大的社區(qū)，這里的居民由大約1000到1150種細(xì)菌構(gòu)成。細(xì)菌不僅種類多，而且數(shù)量極大，是人體細(xì)胞總數(shù)的10倍。這些腸道菌群與人體互利共生，人體為微生物提供生存場所和營養(yǎng)，而微生物則為人體產(chǎn)生有益的物質(zhì)，并保護(hù)人類健康。但是，目前對(duì)這些居民的基因信息“登記”卻顯得很不完善，影響相關(guān)研究的深入進(jìn)行?！ ?/p>
? ?7月7日，由華南理工大學(xué)生物科學(xué)與工程學(xué)院2011級(jí)微生物學(xué)專業(yè)博士研究生李俊樺作為第一作者，華南理工大學(xué)作為第三完成單位，深圳華大基因研究院、丹麥哥本哈根大學(xué)等單位共同合作完成的《人腸道微生物組參考基因集》（An integrated catalog of reference genes in the human gut microbiome）高水平研究成果在《自然?生物技術(shù)》（Nature biotechnology）上公開發(fā)表。這是基因組科學(xué)創(chuàng)新班學(xué)子在國際頂級(jí)學(xué)術(shù)期刊上，以第一作者身份發(fā)表的第二篇文章，也是在《自然》雜志上首次以第一作者而非并列第一作者身份發(fā)表的首篇文章?！ 】蒲腥藛T在該研究中基于249個(gè)新的測(cè)序樣本和之前已公布的1018個(gè)人體腸道微生物樣本，加上511株與人腸道密切相關(guān)的已測(cè)序原核微生物的基因組信息，構(gòu)建了一個(gè)高質(zhì)量、近乎完整的人類腸道微生物基因集數(shù)據(jù)庫。該項(xiàng)目中的樣本來自歐洲、美洲和亞洲，比之前用于構(gòu)建的類似數(shù)據(jù)集的樣品規(guī)模至少大三倍，是迄今為止最具代表性、最高質(zhì)量、近乎完整的人類腸道微生物參考基因集數(shù)據(jù)庫，為進(jìn)一步研究人類腸道微生物提供了全面而精準(zhǔn)的數(shù)據(jù)支持，對(duì)推動(dòng)不同人群之間腸道微生物的遺傳變異研究以及人類健康和疾病相關(guān)研究具有重要意義?！ ?/p>
? ?作為華大基因該項(xiàng)目負(fù)責(zé)人，李俊樺參與了此項(xiàng)研究的全部基礎(chǔ)工作，包括項(xiàng)目設(shè)計(jì)、多個(gè)合作方協(xié)調(diào)溝通、文章各部分分析、文章撰寫及修改定稿等工作。李俊樺表示，“更具代表性和高質(zhì)量的人類腸道微生物參考基因集數(shù)據(jù)庫有利于我們用量化的角度，通過宏基因組，宏轉(zhuǎn)錄組以及宏蛋白組等方法，了解腸道微生物菌群在不同人群中的差異情況，從而理解它們?cè)谌祟惤】岛图膊≈械闹匾饔??！薄 ∵@也是近期華南理工學(xué)生論文第三次登上國際頂級(jí)期刊。5月8日，2012級(jí)博士生劉石平首篇第一作者文章以封面故事于《細(xì)胞》發(fā)表；7月3日，2011級(jí)微生物學(xué)專業(yè)博士生金鑫并列第一作者文章于《自然》發(fā)表。據(jù)悉，自2009年3月“華工—華大”基因組科學(xué)創(chuàng)新班成立以來，創(chuàng)新班同學(xué)在科研上取得豐碩成果，共有55人次分別以第一作者、并列第一作者或署名作者身份在《Nature》、《Science》、《Cell》、《The New England Journal of Medicine》等國際頂尖學(xué)術(shù)雜志上發(fā)表高水平學(xué)術(shù)論文45篇。（圖文/通訊員 樊麗 高惠君 生物科學(xué)與工程學(xué)院 編輯/祝和平）
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