“華工—華大基因組科學(xué)創(chuàng)新班”的小牛人們——記2013屆碩士畢業(yè)生何偉明
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| 何偉明個(gè)人工作照 | |
何偉明發(fā)表文章雜志一覽 |
? 本著“學(xué)術(shù)無(wú)起點(diǎn)”和“需求為導(dǎo)向”的人才培養(yǎng)理念，在學(xué)校領(lǐng)導(dǎo)的大力支持下，華南理工大學(xué)生物科學(xué)與工程學(xué)院在本科生教學(xué)與人才培養(yǎng)方面進(jìn)行了一系列的嘗試和改革，并與深圳華大基因研究院于2009年3月正式合作組建“華工－華大基因組科學(xué)創(chuàng)新班”。創(chuàng)新班成立以來(lái)碩果累累，先后涌現(xiàn)出一批包括羅銳邦、金鑫、劉石平在內(nèi)“科學(xué)小牛人”，而2013年3月在Nature上發(fā)表的一篇名為《小麥D基因組》的高水平研究成果，使得該文章的并列第一作者何偉明也進(jìn)入了大家關(guān)注的視野。 ?
? 何偉明，華南理工大學(xué)生物科學(xué)與工程學(xué)院2013屆生物化學(xué)與分子生物學(xué)碩士畢業(yè)生，“華工—華大”基因組科學(xué)創(chuàng)新班第一屆學(xué)生，目前擔(dān)任華大科技生物信息分析專家，長(zhǎng)期參與植物育種項(xiàng)目的數(shù)據(jù)分析工作，在分子育種方面具有豐富的項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)，對(duì)作物遺傳育種有深刻的理解和獨(dú)特的見解。從2009年加入基因組科學(xué)創(chuàng)新班至今，他在頂級(jí)雜志發(fā)表論文達(dá)11篇，其中以共同第一作者身份分別在Nature和PNAS雜志上發(fā)表論文兩篇。 ?
? ?2013年3月25日, 在攻讀碩士期間，何偉明以共同第一作者身份在Nature（《自然》）雜志上發(fā)表高水平研究成果Aegilops tauschii draft genome sequence reveals a gene repertoire for wheat adaptation（《小麥D基因組圖譜繪制》）。該課題由中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物研究所、深圳華大基因研究院等單位共同合作完成，研究人員通過(guò)對(duì)粗山羊草進(jìn)行測(cè)序、組裝及注釋，對(duì)其基因組進(jìn)行了深入詳盡的分析，該項(xiàng)研究成果為科研工作者研究小麥進(jìn)化史提供全新的視角，為多倍體小麥遺傳育種提供寶貴資源。作為課題的主要完成人之一，何偉明在項(xiàng)目中主要負(fù)責(zé)完善小麥D的基因組序列的組裝和評(píng)價(jià)，以及一些結(jié)果展示圖表美化。 ?
? ?2013年8月12日，何偉明又以共同第一作者身份在PNAS（《美國(guó)科學(xué)院院報(bào)》）上發(fā)表論文Dissecting yield-associated loci in super hybrid rice by resequencing recombinant inbred lines and improving parental genome sequences（《解析超級(jí)雜交水稻產(chǎn)量相關(guān)遺傳位點(diǎn)》）。課題由中國(guó)水稻研究所、深圳華大基因研究院和中國(guó)科學(xué)院遺傳與發(fā)育研究所等單位合作完成，研究人員通過(guò)長(zhǎng)期努力，構(gòu)建出132個(gè)超級(jí)雜交稻兩優(yōu)培九的核心重組自交系和1709個(gè)用于基因克隆的大規(guī)模重組自交系，并進(jìn)一步成功構(gòu)建了超高分辨率的遺傳連鎖圖譜，該項(xiàng)研究不僅為超級(jí)雜交稻產(chǎn)量相關(guān)位點(diǎn)的解析提供了寶貴的材料和有效的途徑，還為進(jìn)一步闡明超級(jí)稻產(chǎn)量的遺傳基礎(chǔ)以及分子育種應(yīng)用搭建了理想平臺(tái)。課題中，何偉明的主要工作是更新了兩優(yōu)培九的父本品種93-11和新組裝的母本品種培矮64s的基因組序列和基因集注釋。 ?
? 除此之外，近五年來(lái)，何偉明還以第一作者身份開發(fā)了重測(cè)序軟件工具包，提供了用于群體SNP位點(diǎn)檢測(cè)及判斷基因型的新算法和新模型，使之更高效更準(zhǔn)確檢測(cè)出群體SNP位點(diǎn)以及判斷出各個(gè)體在該位點(diǎn)的基因型；并以署名作者身份在Nature 、Science、Cell等頂尖雜志上發(fā)表高水平研究論文共計(jì)8篇。（圖文/通訊員 樊麗 高惠君)
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