復旦大學生物醫(yī)學研究院周峰團隊合作創(chuàng)建了原位染色質(zhì)互作網(wǎng)絡(luò)，相關(guān)研究成果在《細胞》雜志發(fā)表
近日，德克薩斯州西南醫(yī)學中心的徐劍教授課題組與復旦大學附屬中山醫(yī)院及生物醫(yī)學研究院（IBS）周峰研究員課題組合作，首次利用了“biotinylated dCAS9”的方法建立了高分辨率，位點特異原位DNA-蛋白質(zhì)以及其他元件的互作網(wǎng)絡(luò) “。8月24日，相關(guān)研究成果以通過dcas9原位捕捉染色質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)（“In Situ capture of chromatin interactions by biotinylated dCAS9”）為題在國際頂級學術(shù)期刊《細胞》（Cell）雜志上發(fā)表，徐劍教授和周峰研究員為共同通訊作者。徐劍教授為該文章的Lead Contact。
隨著功能基因組學的飛速發(fā)展，對調(diào)控基因表達的順式（cis-）和反式(trans-)作用元件進行系統(tǒng)研究成為當前急需填補的領(lǐng)域空白。此前也有利用3D基因組圖譜的方法來研究染色質(zhì)結(jié)構(gòu)的組學技術(shù)：染色質(zhì)免疫沉淀技術(shù)CHIA-PET能夠鑒定到全基因組范圍內(nèi)的染色質(zhì)互作水平，最近幾年發(fā)展起來的Hi-C技術(shù)可以在更大范圍內(nèi)捕獲包含各種拓補結(jié)構(gòu)在內(nèi)的與染色體相關(guān)的互作關(guān)聯(lián)信息。但遺憾的是，目前為止，這些技術(shù)都無法得到與基因位點特異性相關(guān)的互作圖譜，同時也缺乏反式作用原件(trans-)參與介導的互作圖譜信息。
據(jù)介紹，此次研究建立的“CAPTURE方法”可以針對感興趣的基因位點進行全面的挖掘，在原位發(fā)現(xiàn)對DNA的轉(zhuǎn)錄起到重要調(diào)控作用的蛋白質(zhì)及其他元件，這種3D互作組學手段有助于科研人員今后就調(diào)控元件與疾病和發(fā)育的關(guān)系作進一步深入研究。
版權(quán)與免責聲明：本網(wǎng)頁的內(nèi)容由收集互聯(lián)網(wǎng)上公開發(fā)布的信息整理獲得。目的在于傳遞信息及分享，并不意味著贊同其觀點或證實其真實性，也不構(gòu)成其他建議。僅提供交流平臺，不為其版權(quán)負責。如涉及侵權(quán)，請聯(lián)系我們及時修改或刪除。郵箱：sales@allpeptide.com