??? 2019 年1月8日，國際知名學術(shù)期刊Nucleic Acids Research以“SAGD: acomprehensive sex-associated gene database from transcriptomes”為題在線發(fā)表了我院PI陳振夏教授課題組的最新研究成果，文章報道了一個包含眾多物種中性別相關(guān)基因的數(shù)據(jù)庫。
??? 有性生殖的動物通常在形態(tài)、生理和行為等表型上具有顯著的雌雄差異。這種差異是因為存在著大量在雌雄之間具有表達差異的基因，也就是性別相關(guān)基因（SAG）。對性別相關(guān)基因的研究不僅對于理解基因調(diào)控和演化具有重要意義，而且其在動物繁殖和害蟲控制中也具有很重要的應用價值。此外，越來越多的證據(jù)表明，性別相關(guān)基因是影響神經(jīng)退行性疾病、心血管疾病和癌癥等各種疾病風險的關(guān)鍵因素。同時由于精準醫(yī)療的興起，性別作為物種間最大的形態(tài)差異不可避免的成為了精準醫(yī)療的研究重點。雖然目前測序數(shù)據(jù)眾多，但是依然沒有一個是以性別為關(guān)注點，并不適合性別相關(guān)基因的研究。所以為了使跨物種的性別之間的基因表達比較成為可能，陳振夏教授課題組手動收集了目前的測序數(shù)據(jù)用于差異分析，并將結(jié)果整合成一個可供訪問的數(shù)據(jù)庫（SAGD）。
??? 課題組通過整合三個數(shù)據(jù)庫的元數(shù)據(jù)信息，Expression Atlas、NCBI Short Read Archive（SRA）和NCBI Gene Expression Omnibus（GEO），來篩選合適的數(shù)據(jù)集用于差異分析。最后得到了21個物種，共2,828個測序樣本。從這21個物種中鑒定了27,793個雌性偏向的性別相關(guān)基因和64,043個雄性偏向的性別相關(guān)基因，并將表達信息整理成數(shù)據(jù)庫供研究者使用。同時該數(shù)據(jù)庫還整合了drugbank的藥物靶點信息，將作為藥物靶點的基因整合進基因信息中。數(shù)據(jù)庫可以通過多種方式訪問到需要的基因，同時每個基因都提供了較為詳細的基礎信息和分析得到的差異信息。該網(wǎng)站還提供了篩選得到的數(shù)據(jù)集的注釋可供研究者做更進一步的分析。
??? 據(jù)悉，SAGD網(wǎng)站的建立，為探究性別差異的研究提供了極大的便利。生命科學技術(shù)學院2018級碩士研究生石夢威和張納安為本論文的并列第一作者，陳振夏教授和華中科技大學生命科學技術(shù)學院郭安源教授為本文的共同通訊作者。該研究工作得到華中農(nóng)業(yè)大學科技自主創(chuàng)新基金、國家自然科學基金等項目的資助。
??? 相關(guān)鏈接：https://academic.oup.com/nar/article/47/D1/D835/5150230
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