我院合成生物學(xué)課題組碩士研究生宋文江同學(xué)在其導(dǎo)師Mario Andrea Marchisio副教授的指導(dǎo)下，在《Journal of Biological Engineering》（IF: 3.0）上發(fā)表了題為“Can terminators be used as insulators into yeast synthetic gene circuits?”的研究論文，該論文通訊作者為我院外籍教師Mario Andrea Marchisio，哈工大生命學(xué)院為唯一通訊單位。
在細(xì)菌中，轉(zhuǎn)錄單元可以通過在其啟動(dòng)子上游插入終止子而被絕緣。以這種方式，啟動(dòng)子泄露量由于其來自上游基因的通讀或RNA聚合酶與DNA的非特異性結(jié)合而被移除。與細(xì)菌終止子不同的是，釀酒酵母的終止子包含一個(gè)六聚體序列，該效能部分與真核細(xì)胞的TATA盒（能夠被RNA聚合酶II識別并結(jié)合的啟動(dòng)子序列）極為相似。
該課題組通過將不同的酵母終止子（自然的和合成的）插入到去除了上游活化序列和TATA盒的CYC1酵母基本啟動(dòng)子的上游，已經(jīng)證實(shí)該效能部分能夠結(jié)合RNA聚合酶II并發(fā)揮TATA盒的功能。此外，將終止子放置到強(qiáng)或中強(qiáng)度的酵母基本啟動(dòng)子上游能夠顯著降低該啟動(dòng)子的轉(zhuǎn)錄活性。
研究數(shù)據(jù)表明，RNA聚合酶II分子可以通過和絕緣子效能部分結(jié)合從而與啟動(dòng)子增強(qiáng)子的活化蛋白或其他RNA聚合酶II分子結(jié)合TATA盒進(jìn)行競爭，最終干擾蛋白的表達(dá)。因此，在釀酒酵母中構(gòu)建合成基因環(huán)路時(shí)應(yīng)該盡量避免非弱啟動(dòng)子的絕緣。
文章鏈接：https://jbioleng.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13036-016-0040-5
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