我院發(fā)育生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室博士研究生劉暉同學(xué)在其導(dǎo)師吳瓊教授的指導(dǎo)下，在Nature子刊《scientific reports》（IF: 5.228）在線發(fā)表了題目為“Computational identification of putative lincRNAs in mouse embryonic stem cell”的研究性論文。

該研究報(bào)道了大量在小鼠ES細(xì)胞中表達(dá)的未經(jīng)注釋的長基因間非編碼RNAs（lincRNAs）。作為重要的調(diào)控因子，長非編碼RNAs在胚胎干細(xì)胞中發(fā)揮著關(guān)鍵的作用。然而，目前的lncRNAs注釋并不完善。該研究基于從頭組裝的小鼠ES細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組識別了6701個(gè)新lincRNAs，通過基于機(jī)器學(xué)習(xí)方法構(gòu)建的預(yù)測模型對利用RNA-Seq識別的轉(zhuǎn)錄本5′端缺失進(jìn)行修正，構(gòu)建注釋相對完整的新lincRNAs集合，并對小鼠ES細(xì)胞新lincRNAs進(jìn)行功能注釋的研究。小鼠ES細(xì)胞表達(dá)的lincRNAs的識別為小鼠胚胎發(fā)育相關(guān)的lincRNAs功能的研究奠定了基礎(chǔ)。

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