1月9日 ，我校生命學院吳瓊教授所帶領(lǐng)的發(fā)育生物學課題組在牛津大學出版社旗下的著名生物數(shù)據(jù)庫期刊《Database》上發(fā)表題為《DevMouse,小鼠發(fā)育甲基化組數(shù)據(jù)庫及分析工具》（DevMouse，the mouse developmental methylome database and analysis tools）的研究論文。該項研究首次構(gòu)建了集小鼠各發(fā)育時期的高通量DNA甲基化譜于一體的在線數(shù)據(jù)庫及分析平臺，對幫助科研人員研究小鼠發(fā)育過程中的DNA甲基化動態(tài)及挖掘關(guān)鍵發(fā)育表觀遺傳調(diào)控因子具有非常重要的科學價值。
該數(shù)據(jù)庫是我校繼miR2Disease之后的又一重要的生命科學數(shù)據(jù)庫。目前該數(shù)據(jù)庫已經(jīng)正式在線運行近6個月，先后被包括Scienceness, Sciencescape等在內(nèi)的國內(nèi)外多家媒體報道，已有來自中國、美國等全世界15個國家的科研人員登錄使用，累計訪問量已達2000余次。
DNA甲基化在發(fā)育過程中經(jīng)歷了動態(tài)性變化，對調(diào)控重要的發(fā)育基因具有重要的作用。小鼠是研究發(fā)育過程的最為理想的動物模型之一，基于二代測序技術(shù)人們測定了小鼠發(fā)育過程中多種發(fā)育階段的DNA甲基化譜，對這些甲基化譜的收集整理將有利于人們研究DNA甲基化在小鼠發(fā)育過程中的調(diào)控機制。為此，該課題組收集整理了目前小鼠發(fā)育過程中的多套DNA甲基化譜，并整合了小鼠基因組的其他信息，構(gòu)建了系統(tǒng)全面的小鼠發(fā)育甲基化組數(shù)據(jù)庫。通過該數(shù)據(jù)庫，用戶可以搜索基因組的功能區(qū)域（如基因、miRNA、lncRNA以及特定的基因組區(qū)域）在不同發(fā)育過程中的DNA甲基化譜，并通過數(shù)據(jù)庫集成的分析工具對搜索到的甲基化譜進行分析，如篩選差異甲基化的基因、基因功能注釋、層次聚類、數(shù)據(jù)庫可視化；此外，用戶還可以下載數(shù)據(jù)和分析結(jié)果用于進一步的分析。
該數(shù)據(jù)庫將為人們研究小鼠發(fā)育過程中的DNA甲基化動態(tài)提供便利，幫助人們找到新的潛在的發(fā)育標記，并為研究人類發(fā)育過程以及復雜疾病的調(diào)控機制提供基礎。
相關(guān)鏈接：
1. 論文連接:
http://database.oxfordjournals.org/content/2014/bat084.long
2. 數(shù)據(jù)庫連接：
http://www.devmouse.org/
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mg.php?lang=cn&id=21
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