2019年12月16日中午,藥學(xué)院化學(xué)生物學(xué)系在藥學(xué)樓216會(huì)議室舉行“藥物創(chuàng)新論壇”第七次交流會(huì),三位博士后、研究生進(jìn)行了報(bào)告,系主任董甦偉教授及學(xué)院50余位師生參與了本次交流,夏青教授擔(dān)任主持。
董甦偉課題組的安傳敬博士后首先介紹了自己的求學(xué)和科研歷程,及自己對(duì)課題研究的認(rèn)識(shí)和思考。沿著自身成長(zhǎng)經(jīng)歷,安傳敬依次介紹了從本科畢業(yè)設(shè)計(jì)直到博士階段在植物分子遺傳領(lǐng)域的研究經(jīng)歷;博士后階段交叉進(jìn)入化學(xué)生物學(xué)系,在董老師組從事糖基轉(zhuǎn)移酶、多肽鏈接酶的原核表達(dá)及功能研究,嘗試將多肽連接酶Butelase 1引入植物葉綠體、線粒體及過氧化物酶體中,以實(shí)現(xiàn)對(duì)各個(gè)細(xì)胞器的熒光標(biāo)記。安傳敬博士的講述內(nèi)容豐富,娓娓道來,既有科研發(fā)現(xiàn)的過程,更有對(duì)不同研究階段課題內(nèi)容的銜接和深入思考,給與會(huì)的師弟師妹們做了很好的表率。
接著,楊曉達(dá)和謝正偉教授指導(dǎo)的六年制研究生張博文同學(xué)給大家?guī)硪粓?chǎng)有關(guān)深度學(xué)習(xí)算法的頭腦風(fēng)暴——基于深度強(qiáng)化學(xué)習(xí)和docking的PTP1B抑制劑設(shè)計(jì)。張博文使用深度學(xué)習(xí)算法搭建了基于計(jì)算機(jī)模擬的蛋白質(zhì)酪氨酸磷酸酶PTP1B抑制劑篩選平臺(tái),模擬構(gòu)建出超過6000萬(wàn)小分子;使用蒙特卡洛模型構(gòu)建獎(jiǎng)賞函數(shù),對(duì)其中超過2400萬(wàn)個(gè)骨架分子進(jìn)行取樣訓(xùn)練,經(jīng)過多輪次篩選,獲得的結(jié)果逐漸收斂;目前已初步獲得一批合理的骨架,后續(xù)將繼續(xù)進(jìn)行側(cè)鏈的添加。湯新景教授課題組的張雪莉同學(xué)壓軸介紹了四嗪誘導(dǎo)的生物正交鍵切割反應(yīng)用于siRNA的可控激活。張雪莉在實(shí)驗(yàn)室前期研究基礎(chǔ)之上,構(gòu)建了基于光誘導(dǎo)的生物正交鏈斷裂反應(yīng),并對(duì)設(shè)計(jì)的siRNA進(jìn)行了細(xì)胞水平驗(yàn)證;報(bào)告條理清晰,講述連貫,內(nèi)容豐富。
從左向右:安傳敬博士、張博文同學(xué)、張雪莉同學(xué)
本次交流會(huì)的三位報(bào)告者研究方向迥異,給與會(huì)師生帶來不同學(xué)科的研究思路碰撞,尤其是計(jì)算機(jī)模擬和大數(shù)據(jù)分析帶來的全新設(shè)計(jì)理念,相信會(huì)啟發(fā)在座同學(xué)進(jìn)行更加深入的思考。
化學(xué)生物學(xué)系? 夏青課題組 供稿
2019年12月16日中午,藥學(xué)院化學(xué)生物學(xué)系在藥學(xué)樓216會(huì)議室舉行“藥物創(chuàng)新論壇”第七次交流會(huì),三位博士后、研究生進(jìn)行了報(bào)告,系主任董甦偉教授及學(xué)院50余位師生參與了本次交流,夏青教授擔(dān)任主持。
董甦偉課題組的安傳敬博士后首先介紹了自己的求學(xué)和科研歷程,及自己對(duì)課題研究的認(rèn)識(shí)和思考。沿著自身成長(zhǎng)經(jīng)歷,安傳敬依次介紹了從本科畢業(yè)設(shè)計(jì)直到博士階段在植物分子遺傳領(lǐng)域的研究經(jīng)歷;博士后階段交叉進(jìn)入化學(xué)生物學(xué)系,在董老師組從事糖基轉(zhuǎn)移酶、多肽鏈接酶的原核表達(dá)及功能研究,嘗試將多肽連接酶Butelase 1引入植物葉綠體、線粒體及過氧化物酶體中,以實(shí)現(xiàn)對(duì)各個(gè)細(xì)胞器的熒光標(biāo)記。安傳敬博士的講述內(nèi)容豐富,娓娓道來,既有科研發(fā)現(xiàn)的過程,更有對(duì)不同研究階段課題內(nèi)容的銜接和深入思考,給與會(huì)的師弟師妹們做了很好的表率。
接著,楊曉達(dá)和謝正偉教授指導(dǎo)的六年制研究生張博文同學(xué)給大家?guī)硪粓?chǎng)有關(guān)深度學(xué)習(xí)算法的頭腦風(fēng)暴——基于深度強(qiáng)化學(xué)習(xí)和docking的PTP1B抑制劑設(shè)計(jì)。張博文使用深度學(xué)習(xí)算法搭建了基于計(jì)算機(jī)模擬的蛋白質(zhì)酪氨酸磷酸酶PTP1B抑制劑篩選平臺(tái),模擬構(gòu)建出超過6000萬(wàn)小分子;使用蒙特卡洛模型構(gòu)建獎(jiǎng)賞函數(shù),對(duì)其中超過2400萬(wàn)個(gè)骨架分子進(jìn)行取樣訓(xùn)練,經(jīng)過多輪次篩選,獲得的結(jié)果逐漸收斂;目前已初步獲得一批合理的骨架,后續(xù)將繼續(xù)進(jìn)行側(cè)鏈的添加。湯新景教授課題組的張雪莉同學(xué)壓軸介紹了四嗪誘導(dǎo)的生物正交鍵切割反應(yīng)用于siRNA的可控激活。張雪莉在實(shí)驗(yàn)室前期研究基礎(chǔ)之上,構(gòu)建了基于光誘導(dǎo)的生物正交鏈斷裂反應(yīng),并對(duì)設(shè)計(jì)的siRNA進(jìn)行了細(xì)胞水平驗(yàn)證;報(bào)告條理清晰,講述連貫,內(nèi)容豐富。
從左向右:安傳敬博士、張博文同學(xué)、張雪莉同學(xué)
本次交流會(huì)的三位報(bào)告者研究方向迥異,給與會(huì)師生帶來不同學(xué)科的研究思路碰撞,尤其是計(jì)算機(jī)模擬和大數(shù)據(jù)分析帶來的全新設(shè)計(jì)理念,相信會(huì)啟發(fā)在座同學(xué)進(jìn)行更加深入的思考。
化學(xué)生物學(xué)系? 夏青課題組 供稿
版權(quán)與免責(zé)聲明:本網(wǎng)頁(yè)的內(nèi)容由收集互聯(lián)網(wǎng)上公開發(fā)布的信息整理獲得。目的在于傳遞信息及分享,并不意味著贊同其觀點(diǎn)或證實(shí)其真實(shí)性,也不構(gòu)成其他建議。僅提供交流平臺(tái),不為其版權(quán)負(fù)責(zé)。如涉及侵權(quán),請(qǐng)聯(lián)系我們及時(shí)修改或刪除。郵箱:sales@allpeptide.com