2019年3月25日下午,德國漢堡大學(xué)Johannes Kirchmair教授應(yīng)張亮仁教授邀請(qǐng)作了題為“In silico models for the identification of compounds likely to cause assay interference”的報(bào)告。劉振明副教授主持了本次報(bào)告會(huì),藥學(xué)院的部分師生參加了此次報(bào)告。
通過篩選尋找先導(dǎo)化合物是藥物發(fā)現(xiàn)的一種有力手段。然而,很多情況下得到的化合物對(duì)靶點(diǎn)沒有表現(xiàn)出預(yù)期的活性。這種現(xiàn)象主要是由泛篩選干擾化合物(PAINS)和膠體聚集體的干擾造成的。Johannes Kirchmair教授首先對(duì)這類干擾分子的作用機(jī)制進(jìn)行了簡(jiǎn)要概括;其次,他引出用計(jì)算的方法可以輔助我們預(yù)測(cè)這些bad actors;最后,他列舉了四種解決方案:基于規(guī)則的方法、基于相似性的方法,統(tǒng)計(jì)方法以及機(jī)器學(xué)習(xí)。并對(duì)機(jī)器學(xué)習(xí)方法進(jìn)行了深入闡述。會(huì)后,張亮仁課題組的學(xué)生又與Johannes Kirchmair教授展開了小組討論。???
Johannes Kirchmair是德國漢堡大學(xué)化學(xué)系和信息學(xué)系教授,同時(shí)擔(dān)任該校生物信息學(xué)中心應(yīng)用化學(xué)信息學(xué)與分子設(shè)計(jì)研究小組負(fù)責(zé)人。Kirchmair教授于2007年獲得奧地利因斯布魯克大學(xué)化學(xué)信息學(xué)與藥物化學(xué)專業(yè)博士學(xué)位,具有13年在國際知名學(xué)術(shù)機(jī)構(gòu)和跨國制藥企業(yè)應(yīng)用化學(xué)信息學(xué)開展新藥研發(fā)的研究經(jīng)驗(yàn)。曾主持多項(xiàng)奧地利科學(xué)基金會(huì)、德國研究基金會(huì)、拜耳制藥等機(jī)構(gòu)資助課題,已在Nat. Rev. Drug Discov.,Nat. Prod. Rep.,J. Med. Chem., J. Chem. Inf. Model.等發(fā)表近60篇學(xué)術(shù)論文(引用次數(shù)超過2500次),同時(shí)擔(dān)任業(yè)界30多種專業(yè)期刊的長期審稿人和SCI期刊Chemistry and Biodiversity的編委。
本次學(xué)術(shù)報(bào)告由北京大學(xué)藥學(xué)院張亮仁課題組承辦。?
Johannes Kirchmair教授作主題報(bào)告
(供稿部門:北京大學(xué)藥學(xué)院張亮仁課題組;供稿人:趙思齊)
2019年3月25日下午,德國漢堡大學(xué)Johannes Kirchmair教授應(yīng)張亮仁教授邀請(qǐng)作了題為“In silico models for the identification of compounds likely to cause assay interference”的報(bào)告。劉振明副教授主持了本次報(bào)告會(huì),藥學(xué)院的部分師生參加了此次報(bào)告。
通過篩選尋找先導(dǎo)化合物是藥物發(fā)現(xiàn)的一種有力手段。然而,很多情況下得到的化合物對(duì)靶點(diǎn)沒有表現(xiàn)出預(yù)期的活性。這種現(xiàn)象主要是由泛篩選干擾化合物(PAINS)和膠體聚集體的干擾造成的。Johannes Kirchmair教授首先對(duì)這類干擾分子的作用機(jī)制進(jìn)行了簡(jiǎn)要概括;其次,他引出用計(jì)算的方法可以輔助我們預(yù)測(cè)這些bad actors;最后,他列舉了四種解決方案:基于規(guī)則的方法、基于相似性的方法,統(tǒng)計(jì)方法以及機(jī)器學(xué)習(xí)。并對(duì)機(jī)器學(xué)習(xí)方法進(jìn)行了深入闡述。會(huì)后,張亮仁課題組的學(xué)生又與Johannes Kirchmair教授展開了小組討論。???
Johannes Kirchmair是德國漢堡大學(xué)化學(xué)系和信息學(xué)系教授,同時(shí)擔(dān)任該校生物信息學(xué)中心應(yīng)用化學(xué)信息學(xué)與分子設(shè)計(jì)研究小組負(fù)責(zé)人。Kirchmair教授于2007年獲得奧地利因斯布魯克大學(xué)化學(xué)信息學(xué)與藥物化學(xué)專業(yè)博士學(xué)位,具有13年在國際知名學(xué)術(shù)機(jī)構(gòu)和跨國制藥企業(yè)應(yīng)用化學(xué)信息學(xué)開展新藥研發(fā)的研究經(jīng)驗(yàn)。曾主持多項(xiàng)奧地利科學(xué)基金會(huì)、德國研究基金會(huì)、拜耳制藥等機(jī)構(gòu)資助課題,已在Nat. Rev. Drug Discov.,Nat. Prod. Rep.,J. Med. Chem., J. Chem. Inf. Model.等發(fā)表近60篇學(xué)術(shù)論文(引用次數(shù)超過2500次),同時(shí)擔(dān)任業(yè)界30多種專業(yè)期刊的長期審稿人和SCI期刊Chemistry and Biodiversity的編委。
本次學(xué)術(shù)報(bào)告由北京大學(xué)藥學(xué)院張亮仁課題組承辦。?
Johannes Kirchmair教授作主題報(bào)告
(供稿部門:北京大學(xué)藥學(xué)院張亮仁課題組;供稿人:趙思齊)
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