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北京大學(xué)化學(xué)與分子工程學(xué)院賈桂芳課題組致力于研究RNA甲基化修飾N6-甲基腺嘌呤(m6A)調(diào)控植物生長發(fā)育及刺激響應(yīng)的分子機制,繪制了植物擬南芥和玉米的m6A全轉(zhuǎn)錄圖譜(Nature Communications 2014;Plant Physiology 2020),鑒定和解析了植物擬南芥中m6A去修飾酶ALKBH10B和m6A結(jié)合蛋白ECT2、CPSF30-L的生物功能(Plant Cell 2017, 2018; Molecular Plant 2021;Nature Communications 2021),推動了植物RNA表觀遺傳學(xué)的研究。
2021年7月22日,賈桂芳課題組與美國芝加哥大學(xué)何川教授課題組、貴州大學(xué)宋寶安院士課題組合作,共同在《Nature Biotechnology》上發(fā)表了題為“RNA demethylation increases the yield and biomass of rice and potato plants in field trials”的研究論文。該研究發(fā)現(xiàn)通過調(diào)節(jié)RNA表觀遺傳修飾m6A含量可促進植物生長,提高作物產(chǎn)量和生物量,作為首個糧食增產(chǎn)的表觀遺傳育種新技術(shù),未來有望推進我國農(nóng)業(yè)技術(shù)發(fā)展。
該研究在單子葉植物水稻和雙子葉植物土豆中引入FTO(哺乳動物體內(nèi)的RNA去甲基化酶)對植物RAN表觀遺傳修飾m6A進行去甲基化。田間試驗結(jié)果表明過表達FTO的水稻和土豆的產(chǎn)量和生物量都顯著增加了約50%。進一步研究發(fā)現(xiàn),過表達FTO可顯著促進水稻分蘗形成和根系生長,增強光合作用效率和抗旱能力。FTO可特異性增強根頂端分生組織細胞的增殖,增加根長和根的數(shù)目,從而促進根系生長。深入研究其分子機理發(fā)現(xiàn)FTO介導(dǎo)的m6A去甲基化可以促進染色質(zhì)的開放,激活轉(zhuǎn)錄,尤其是表型相關(guān)基因的轉(zhuǎn)錄。
該研究開發(fā)了一種全新的、具有普適性的表觀遺傳編輯育種技術(shù),可用于培育高產(chǎn)高生物量的優(yōu)良品種,實現(xiàn)糧食增產(chǎn)。此外改造后的植物根系發(fā)達有望更加適應(yīng)抗旱、抗逆等環(huán)境,未來該技術(shù)有望應(yīng)用于森林草原生態(tài)修復(fù)問題。
FTO對水稻品種日本晴(Nipp)的改造
FTO對馬鈴薯品種鄂薯3號(EM3)的改造
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北京大學(xué)化學(xué)與分子工程學(xué)院賈桂芳組博士后喻瓊(作物RNA修飾研究),芝加哥大學(xué)何川組博士后劉順(生物信息學(xué)分析)為該論文的共同第一作者。北京大學(xué)化學(xué)與分子工程學(xué)院賈桂芳研究員,芝加哥大學(xué)何川教授和貴州大學(xué)宋寶安院士為該論文的共同通訊作者。該研究得到了國家自然科學(xué)基金、國家重點基礎(chǔ)研究發(fā)展計劃項目、北京市自然科學(xué)基金、北京光元立方生物技術(shù)有限公司和鐘子逸教育基金和北京分子科學(xué)國家研究中心的資助。
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