何春江團隊解析年齡相關的免疫和基因表達變化
近日，Briefings in Bioinformatics 在線發(fā)表了華中農業(yè)大學生物醫(yī)學與健康學院何春江教授課題組研究論文，題目為“ADEIP: an integrated platform of age-dependent expression and immune profiles across human tissues”。該研究搭建了一個平臺ADEIP，用于展示和檢索年齡相關的基因表達和免疫圖譜。
圖1. ADEIP的界面和開發(fā)流程
ADEIP包括來自GTEx計劃中30個主要人體組織超過16000個樣本的基因表達數(shù)據(jù)，這些樣本來的年齡范圍在20-80歲之間的捐贈者。該研究對不同年齡組的差異表達基因和基因集、免疫相關基因和免疫細胞組成等幾個方面進行了整合分析。同時對已知與SARS-CoV-2和人類間充質干細胞(hMSC)相關的基因進行了舉例分析，展示了ADEIP的相關應用。作為一個比較全面的平臺，ADEIP可用于研究與衰老相關的表達和跨組織的免疫地圖，有助于了解與年齡相關的傳染病或遺傳疾病的機制，從而開發(fā)個性化的治療方案。
華中農業(yè)大學信息學院研究生劉旋和武漢大學基礎醫(yī)學院陳文博為該論文共同第一作者，華中農業(yè)大學生物醫(yī)學與健康學院何春江教授、德州農工大學韓冷教授和華中農業(yè)大學生物醫(yī)學與健康學院董志強教授為共同通訊作者，華中農業(yè)大學信息學院章文教授參與研究。
全文鏈接：
https://academic.oup.com/bib/advance-article/doi/10.1093/bib/bbab274/6319933
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