2021年8月12日,清華大學(xué)藥學(xué)院胡澤平課題組與合作者在《Nature Metabolism》雜志以研究長文(Article)在線發(fā)表題為“Aberrant NAD+ metabolism underlies Zika virus-induced microcephaly” 的文章,揭示ZIKV感染導(dǎo)致小頭癥腦組織發(fā)生顯著的煙酰胺腺嘌呤二核苷酸(NAD+)代謝重編程;并發(fā)現(xiàn)靶向干預(yù)NAD+代謝可以在動物模型中有效改善ZIKV感染所致的小頭癥。
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孕期感染寨卡病毒(Zika virus,ZIKV)會導(dǎo)致新生兒小頭畸形[1, 2]。然而,其潛在的發(fā)生機(jī)制尚不明確,也缺乏有效的治療策略。病毒感染宿主后,可以通過“劫持”并重編程宿主的代謝以滿足其快速生長復(fù)制的物質(zhì)和能量需求,并促使其發(fā)生免疫逃逸[3, 4],而靶向代謝可以有效抑制病毒復(fù)制[5-8]。因此,探究ZIKV感染對宿主代謝的重編程和影響,有助于理解小頭癥的發(fā)生機(jī)制,進(jìn)而開發(fā)潛在的治療策略。近年來,多組學(xué)整合研究策略在理解復(fù)雜疾?。ㄈ缒[瘤[9],糖尿病[10],病毒感染等[11, 12])發(fā)生發(fā)展的分子機(jī)制中發(fā)揮著越來越重要的作用,也為發(fā)現(xiàn)疾病治療的潛在靶標(biāo)提供了重要工具和理論基礎(chǔ)。
為了探究ZIKV感染所致小頭癥的分子機(jī)制和潛在治療靶點(diǎn),作者利用包括轉(zhuǎn)錄組學(xué),蛋白質(zhì)組學(xué),磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué),以及代謝組學(xué)在內(nèi)的多組學(xué)技術(shù),全面描繪了ZIKV感染腦組織中的分子變化特征。轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白組學(xué)揭示了ZIKV感染腦組織引起了顯著的細(xì)胞凋亡和免疫反應(yīng)。蛋白組學(xué)揭示了ZIKV感染腦組織中膽固醇代謝上調(diào)和腦神經(jīng)發(fā)育障礙。進(jìn)一步,通過將代謝組學(xué)與其他組學(xué)在通路水平進(jìn)行多組學(xué)整合分析,作者從不同分子層面上交互驗(yàn)證了ZIKV感染導(dǎo)致小頭癥的發(fā)生過程中的一系列代謝重編程事件,如NAD+代謝,三羧酸循環(huán)(TCA cycle),氧化磷酸化(OXPHOS),嘌呤和嘧啶代謝等,同時也提示ZIKV感染可能導(dǎo)致線粒體功能發(fā)生障礙(圖1)。值得注意的是,ZIKV感染腦組織中NAD+水平急劇下降,而從頭合成和補(bǔ)救合成途徑上的前體(tryptophan、kynurenine、nicotinamide riboside、nicotinamide mononucleotide)水平均發(fā)生不同程度的上調(diào)(圖1)。因此推測NAD+代謝通路重編程可能是ZIKV感染所致小頭癥的關(guān)鍵節(jié)點(diǎn)和潛在干預(yù)靶標(biāo)。此外,磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)揭示了ZIKV感染腦組織中MAPK通路顯著激活,結(jié)合NAD+代謝以及相關(guān)蛋白變化,推測ZIKV感染可能存在MAPK-NMNAT2-NAD+軸的潛在分子機(jī)制。
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圖1 ZIKV感染引起腦內(nèi)NAD+代謝,TCA cycle以及OXPHOS代謝重編程
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為了探究NAD+代謝重編程在ZIKV感染所致小頭癥中的功能,作者使用ZIKV感染小鼠所致小頭癥模型進(jìn)行體內(nèi)實(shí)驗(yàn),觀察回補(bǔ)NAD+及相關(guān)前體是否可以改善ZIKV感染所致的小頭癥。研究結(jié)果表明,腦注射NAD+可以顯著抑制ZIKV感染所致的細(xì)胞凋亡,增加大腦皮層厚度。而腹腔注射NAD+的重要前體nicotinamide riboside(NR)不僅可以顯著抑制ZIKV感染所致的細(xì)胞凋亡,增加大腦皮層厚度,還可以增加感染小鼠的體重和腦重,延長其生存期(圖2)。
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圖2 NR可以顯著改善ZIKV感染導(dǎo)致的小頭癥
綜上,該研究通過對ZIKV感染所致小頭癥的多組學(xué)分析,揭示了ZIKV感染導(dǎo)致顯著的NAD+代謝重編程,并證明干預(yù)NAD+代謝能夠從分子和整體層面上顯著改善ZIKV感染所致的小頭癥。該研究不僅提供了ZIKV感染后不同分子層面重塑的組學(xué)大數(shù)據(jù)信息,也為理解ZIKV感染所致小頭癥的分子機(jī)制提供了新見解,并提示干預(yù)NAD+代謝或可作為治療ZIKV感染所致小頭癥的潛在新策略。
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清華大學(xué)藥學(xué)院博士后龐歡歡、聶萌、博士生李杰,中國科學(xué)院遺傳與發(fā)育生物學(xué)研究所博士生姜義圣,清華大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院博士生王鈺珅為該論文的共同第一作者。清華大學(xué)藥學(xué)院胡澤平研究員、中國科學(xué)院遺傳與發(fā)育生物學(xué)研究所許執(zhí)恒研究員、清華大學(xué)醫(yī)學(xué)院藍(lán)勛研究員、國家蛋白質(zhì)中心宋雷博士為該論文的共同通訊作者。清華大學(xué)李蓬教授和李梢教授參與合作并給予指導(dǎo)和協(xié)助。清華大學(xué)施一公教授、曾文文教授、王戈林教授等對該研究提供了大力支持和幫助。該研究工作得到了科技部“發(fā)育編程及其代謝調(diào)節(jié)”重點(diǎn)專項(xiàng)、國家自然科學(xué)基金委“糖脂代謝的時空網(wǎng)絡(luò)調(diào)控”重大計劃的重點(diǎn)項(xiàng)目、國家自然科學(xué)基金委面上項(xiàng)目、清華-北大生命聯(lián)合中心,以及中國科學(xué)院等項(xiàng)目支持。
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?原文鏈接:https://www.nature.com/articles/s42255-021-00437-0
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