近期,我校生命科學(xué)學(xué)院馬飛教授、金萍副教授團(tuán)隊與東部戰(zhàn)區(qū)總醫(yī)院夏欣一教授團(tuán)隊聯(lián)合揭示了ZNF蛋白抗SARS-CoV-2感染機(jī)制,該研究成果以《Analyzing master regulators and scRNA-seq of COVID-19 patients reveals an underlying anti-SARS-CoV-2 mechanism of ZNF proteins》為題正式發(fā)表在生物信息學(xué)權(quán)威期刊Briefings in Bioinformatics, 2021, 22(5):1~14, https://doi.org/10.1093/bib/bbab118 (影響因子:11.622)。我校生科院博士生秦士杰為第一作者,金萍副教授、馬飛教授和東部戰(zhàn)區(qū)總醫(yī)院夏欣一教授為論文的通訊作者,第一作者單位為南京師范大學(xué)。
新冠病毒大流行以來已經(jīng)感染超過2億人,造成超400萬人死亡,但是宿主抗SARS-CoV-2侵染機(jī)制仍不是十分清楚。馬飛教授、金萍副教授團(tuán)隊和夏欣一教授團(tuán)隊從性別差異出發(fā),揭示了臨床上女性COVID-19患者的死亡率和重癥率顯著低于男性;并通過系統(tǒng)生物學(xué)研究證明了宿主響應(yīng)SARS-CoV-2感染的主要調(diào)節(jié)子(eg.STAT1/STAT2和ZNF家族蛋白)在女性和男性之間存在顯著差異,女性COVID-19患者能夠比男性患者表達(dá)出更多的ZNF蛋白以及更強(qiáng)的活性。ZNF蛋白活性與患者的病毒載量和疾病嚴(yán)重程度負(fù)相關(guān),而與患者的免疫活性呈正相關(guān)。該研究研究首次揭示ZNF不僅可以作為效應(yīng)蛋白直接抑制SARS-CoV-2,還可作為轉(zhuǎn)錄因子直接激活干擾素刺激基因以及促進(jìn)免疫細(xì)胞成熟和活化來抵抗SARS-CoV-2,并提出ZNF蛋白的數(shù)量和活性的差異是不同性別COVID-19患者預(yù)后不同的潛在原因。
新冠病毒在中國發(fā)生的初期,馬飛教授聯(lián)合我校生科院陳禮明教授和南京郵電大學(xué)季星來教授揭示了SARS-CoV-2與導(dǎo)致重癥的SARS-CoV和MERS-CoV更為相似,發(fā)現(xiàn)導(dǎo)致重癥的冠狀病毒(SARS-CoV, MERS-CoV, SARS-CoV-2)共享多個宿主響應(yīng)基因并且都表現(xiàn)出中性粒細(xì)胞的過度活化。東部戰(zhàn)區(qū)總醫(yī)院夏欣一教授提供的臨床數(shù)據(jù)進(jìn)一步驗證了中性粒細(xì)胞的過度活化可作為重癥COVID-19患者的預(yù)后指標(biāo)。該研究成果以《Mechanistic insights into SARS-CoV-2 epidemic via revealing the features of SARS-CoV-2 coding proteins and host responses upon its infection》為題正式發(fā)表在生物信息學(xué)權(quán)威期刊Bioinformatics, 2021, 36(21):5133-5138. https:// doi: 10.1093/bioinformatics/btaa725 (影響因子:6.931)。我校生科院博士生秦士杰和東部戰(zhàn)區(qū)總醫(yī)院夏欣一教授為共同第一作者,季星來教授、馬飛教授和陳禮明教授為論文的通訊作者,第一作者單位為南京師范大學(xué)。
此外,金萍副教授、馬飛教授團(tuán)隊和夏欣一教授團(tuán)隊還系統(tǒng)比較了不同嚴(yán)重程度的COVID-19患者的各項臨床指標(biāo),并且通過隨機(jī)森林算法篩選并建立了可靠的臨床模型(準(zhǔn)確性接近90%)用于COVID-19患者的預(yù)后監(jiān)測。該研究成果以《3044 Cases reveal important prognosis signatures of COVID-19 patients》為題正式發(fā)表在國際權(quán)威期刊Computational and Structural Biotechnology Journal,2021,19:1163-1175. doi: 10.1016/j.csbj.2021.01.042 (影響因子:7.272)。我院博士生秦士杰是該論文的第一作者,金萍副教授、馬飛教授和夏欣一為該論文的通訊作者。該論文的第二通訊單位為南京師范大學(xué)。
新冠病毒延續(xù)至今,人們對SARS-CoV-2的致病機(jī)制和治療仍然需要深入研究。金萍副教授、馬飛教授團(tuán)隊和夏欣一教授團(tuán)隊所做的工作不僅增加了我們對COVID-19發(fā)病機(jī)制和宿主免疫響應(yīng)的認(rèn)識,也為臨床上對COVID-19患者的診斷和預(yù)后提供了重要的靶標(biāo)分子。
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