日前,我校林金星教授團隊和中科院植物研究所、法國國家科研中心等單位合作,在自主搭建植物細胞單分子檢測平臺的基礎上,通過植物膜蛋白動力學和寡聚化狀態(tài)定量分析,發(fā)展了適合植物單分子研究的新算法,實現(xiàn)了單個膜蛋白動態(tài)參數(shù)的精準分析。相關研究工作發(fā)表在Nature Protocols上 (影響因子為9.673)。
林金星團隊通過自主搭建適合植物細胞膜蛋白動態(tài)分析的單分子檢測平臺,克服了細胞壁對蛋白動態(tài)分析的干擾,建立了全內(nèi)反射熒光顯微術,實現(xiàn)了對單個質膜蛋白運動的實時成像,相關的研究成果曾經(jīng)發(fā)表在PNAS, Plant Cell 等著名刊物。在此基礎上,他們又針對多假設追蹤算法在多目標關聯(lián)跟蹤過程中計算量大的問題,提出了一種改進的多假設跟蹤算法。通過修改假設生成、假設刪除、新目標初始化、交叉目標關聯(lián),并結合植物細胞熒光成像的特點,用MATLAB實現(xiàn)了算法,并簡化了運算,從而提高了運算速度,在實踐中取得了良好的應用效果,將單個膜蛋白運動參數(shù)的分析精度推進到納米和毫秒級,為進一步揭示植物細胞膜蛋白通過不同聚合方式和側向運動實現(xiàn)自我活性調節(jié)的機制奠定了基礎。
該研究曾經(jīng)得到國家自然科學基金和973項目資助,生物學院李曉娟副教授是共同第一作者。
附:文章鏈接http://www.nature.com/nprot/journal/v10/n12/full/nprot.2015.132.html
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