近期,我校鄔榮領(lǐng)教授團(tuán)隊(duì)在非模式異交裸子植物榧樹(shù)的研究上獲得新突破。構(gòu)建的連鎖-連鎖不平衡圖推斷出了榧樹(shù)在長(zhǎng)期自然選擇壓力下的進(jìn)化歷程,并且找到了對(duì)進(jìn)化做出響應(yīng)的關(guān)鍵位點(diǎn)。有關(guān)研究成果在線發(fā)表在知名遺傳期刊《DNA Research》(2015,IF="5.477)上。
數(shù)量性狀基因作圖是基于連鎖與連鎖不平衡兩種方法,但這兩種方法單獨(dú)使用時(shí)均顯示其明顯的局限性。我校計(jì)算生物學(xué)中心教授鄔榮領(lǐng)博士在國(guó)際上首次提出了一個(gè)新理論,把這兩種方法整合在一個(gè)框架內(nèi),基于自然界林木自由授粉的特性,針對(duì)天然群體半同胞子代,構(gòu)建了一個(gè)覆蓋整個(gè)基因組的連鎖-連鎖不平衡關(guān)系圖。據(jù)此,人們能夠推斷物種進(jìn)化的歷史,準(zhǔn)確地找出那些不同自然選擇或人工選擇壓力下的染色體位點(diǎn),最終精確定位影響數(shù)量性狀的關(guān)鍵基因。研究人員利用這一理論已成功定位了影響玉米耐旱性的基因,并獲得了生物學(xué)驗(yàn)證,但在高度雜合且研究難度極大的林木上,這個(gè)理論的應(yīng)用未能充分體現(xiàn)。
對(duì)此,鄔榮領(lǐng)教授團(tuán)隊(duì)與浙江農(nóng)林大學(xué)合作,經(jīng)過(guò)近十年的努力,使這一理論在非模式異交裸子植物榧樹(shù)的研究上獲得重要突破。構(gòu)建的連鎖-連鎖不平衡圖推斷出了榧樹(shù)在長(zhǎng)期自然選擇壓力下的進(jìn)化歷程,并且找到了對(duì)進(jìn)化做出響應(yīng)的關(guān)鍵位點(diǎn)。最近,有關(guān)研究成果在線發(fā)表在知名遺傳期刊《DNA Research》(2015,IF="5.477)上。
論文投稿期間,審稿人評(píng)價(jià)說(shuō),鄔榮領(lǐng)教授提出的這一設(shè)想打破了林木常規(guī)研究手段的局限性,對(duì)于提升遺傳研究的理論水平具有重要的指導(dǎo)意義。
發(fā)表在《DNA Research》上的論文第一作者是我校計(jì)算生物學(xué)中心碩士研究生祝緒禮。在導(dǎo)師鄔榮領(lǐng)教授的指導(dǎo)下,祝緒禮已經(jīng)掌握了這一新理論的核心技術(shù),目前已獨(dú)立開(kāi)展這方面的理論推斷、計(jì)算機(jī)模擬、數(shù)據(jù)分析與結(jié)果解釋。鄔榮領(lǐng)教授與浙江農(nóng)林大學(xué)曾燕如教授是該文的共同通訊作者,其他參與人員包括我校博士研究生姜立波及曾燕如教授領(lǐng)導(dǎo)的團(tuán)隊(duì)。
論文鏈接:http://dnaresearch.oxfordjournals.org/content/early/2015/11/29/dnares.dsv031.full