近日,國際學(xué)術(shù)期刊《Molecular Therapy》(IF: 11.454)在線發(fā)表了生命科學(xué)學(xué)院病毒學(xué)國家重點(diǎn)和省細(xì)胞穩(wěn)態(tài)重點(diǎn)實驗室殷雷研究組在Cas12a脫靶研究取得的新成果,論文題目為“Cas12a variants designed for lower genome-wide off-target effect through stringent PAM recognition”( 《通過設(shè)計PAM嚴(yán)格識別的Cas12變體來降低其全基因組脫靶效應(yīng)》),這是繼該課題組2020年在《Genome Biology》上發(fā)表低脫靶CeCas12a的又一成果。。
CRISPR-Cas系統(tǒng)是細(xì)菌抵御病毒入侵的免疫防御系統(tǒng),對基因組能特異性識別和高效切割并在基因組編輯中得到廣泛應(yīng)用。他人報道表明AsCas12a和LbCas12a是以TTTV為最佳PAM(protospacer adjacent motif)基序的基因編輯酶,但對含C的PAM(CTTV、TCTV、TTCV等)也會部分識別。殷雷研究組長期關(guān)注病原識別和分子設(shè)計,前期從自然界鑒定并實驗明確CeCas12a其嚴(yán)格的PAM識別和隨后很低的脫靶效應(yīng)(Chen et.al. genome biology. 2020)。在該研究中,基于分子設(shè)計,在國際目前都集中在PAM識別擴(kuò)展的背景下,反向設(shè)計使PAM識別嚴(yán)格,在具備自主知識產(chǎn)權(quán)的Lb2Cas12a和其他Cas12a基礎(chǔ)上,研究組成功設(shè)計得到其PAM識別嚴(yán)格同時基因編輯效率依舊高效的多個變體,能同時編輯多個基因,在哺乳細(xì)胞全基因組上GUIDE-seq表明這些變體相較于野生型具有相當(dāng)?shù)幕蚓庉嫽钚院透偷拿摪行?yīng)與染色體重排效應(yīng),并申請了相關(guān)專利。該研究為基因編輯酶的低脫靶人工設(shè)計改造提供了新的思路和候選分子。
殷雷課題組博士后周進(jìn)和陳鵬為共同第一作者,殷雷教授為通訊作者,該工作得到了國家科技部和國家自然科學(xué)基金的資助。
全基因組水平高通量測序分析各種編輯蛋白及其變體的特異性
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https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1525001621005177
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