1小時左右可出鑒定結(jié)果!華南理工大學(xué)附屬廣東省人民醫(yī)院和生物科學(xué)與工程學(xué)院近日共同開發(fā)新冠變異株快速分型核酸檢測技術(shù),可助力新冠疑似患者快速分流及德爾塔變異株的精準分型。據(jù)介紹,這一方案也可快速復(fù)制到對奧密克戎毒株感染者的核酸檢測中。
RT-LAMP法對新冠Delta典型突變位點檢測方法的建立
該成果由華南理工大學(xué)附屬廣東省人民醫(yī)院檢驗科顧兵教授團隊和生物科學(xué)與工程學(xué)院張雷教授課題組共同完成,在全球感染領(lǐng)域權(quán)威雜志《新發(fā)傳染病雜志》上發(fā)表。
顧兵教授表示,該項研究始于2021年6月份,由于研究周期和期刊采用稿件等諸多因素,研究成果近日才予發(fā)表。“目前德爾塔毒株已經(jīng)不是全球優(yōu)勢株,代之以奧密克戎毒株,但我們的這一方案是可以快速復(fù)制到對奧密克戎毒株感染者的核酸檢測中的?!?/span>
據(jù)了解,新冠病毒作為單鏈條RNA病毒,其變異是主流。如果提前獲悉受檢者感染的是何種新冠病毒變異株,對于制定和調(diào)整疫情防控策略和準確給予臨床治療方案都有著重要意義。
本研究開發(fā)了一種基于RT-LAMP鑒定單堿基突變水平的檢測方法,針對SARS-CoV-2N基因的保守區(qū)域、德爾塔特異突變R203M區(qū)域設(shè)計了2對特異性引物,在CqR203M/ Cq conserved閾值為1.80時,可實現(xiàn)新冠病毒德爾塔突變株及野生株的快速檢測及區(qū)分,并進行了臨床驗證,分型準確率達到100%。
該方法實現(xiàn)了1小時左右對德爾塔變異株的鑒定和SARS-CoV-2感染的實時監(jiān)測,常規(guī)的熒光定量PCR檢測平臺即可開展,有望為COVID-19可疑患者的快速分流及德爾塔株的精準分型提供有力手段。
Cq-ratio based RT-LAMP技術(shù)對新冠臨床樣本的檢測和分型
據(jù)悉,顧兵教授和張雷教授課題組李杉教授為論文的共同通訊作者,生物科學(xué)與工程學(xué)院碩士研究生楊佳寧和胡雪姣博士為共同第一作者,華南理工大學(xué)生物科學(xué)與工程學(xué)院為第一單位。張雷教授課題組近年來在新型冠狀病毒的快速檢測方面做出了重要成果,已經(jīng)在國際高水平刊物Analytica Chimica Acta、mSphere上發(fā)表,相關(guān)研究成果已經(jīng)轉(zhuǎn)讓廣州達安基因股份有限公司進行產(chǎn)業(yè)化開發(fā)。
媒體報道截圖
該項研究得到國家自然科學(xué)基金、國家藥監(jiān)局血液制品質(zhì)量控制重點實驗室、國家重點研發(fā)項目的支持。成果發(fā)布后,“學(xué)習(xí)強國”學(xué)習(xí)平臺、人民日報、科技日報、羊城晚報、南方都市報等平臺和媒體對其進行了報道。
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