黃黎珍副教授課題組開發(fā)新冠突變株可視化快速檢測技術(shù)
隨著新冠病毒在全球持續(xù)蔓延，大量突變毒株不斷涌現(xiàn)，突變毒株免疫逃逸的發(fā)生及傳播力感染力的增強給疫情防控帶來更加嚴峻的挑戰(zhàn)。突變毒株的快速精準檢測將大力推動新冠突變流行高效預警監(jiān)測及新冠精準防控。
目前病毒變異株檢測主要依賴于核酸測序，不僅耗時長且成本高昂。CRISPR系統(tǒng)的單堿基識別特性使其成為突變檢測新型利器。華南理工大學黃黎珍副教授課題組與杜紅麗教授課題組在團隊Cas12介導CORDS檢測系統(tǒng)及突變大數(shù)據(jù)自動分析平臺之上，聯(lián)合廣東省疾病預防控制中心、南方醫(yī)科大學、中山大學等單位進一步開發(fā)新冠變異株檢測方法RT-CORDS，可快速、準確檢測N501Y、D614G以及Δ69/70的變異株（圖1）。該檢測方法操作簡便，可快速實現(xiàn)多種突變同步精準檢測（單堿基突變、小片段缺失等）。相關(guān)成果發(fā)表在檢測領(lǐng)域國際權(quán)威期刊Biosensors and Bioelectronics（影響因子10.61）。
圖一.?RT-CORDS新冠變異株檢測平臺
RT-CORDS通過設(shè)計針對突變株和非突變株特異性Cas12a/crRNA-M及Cas12a/crRNA-M，采用熒光報告系統(tǒng)，40分鐘可檢測D614G突變株，N501Y及69/70 del變異株檢測時間僅需10分鐘；檢測靈敏度達6 copies/μL（圖二）。
圖二.?RT-CORDS熒光檢測平臺檢測N501Y、D614G和69/70deletion變異株
為了進一步簡便操作流程，課題組同時開發(fā)RT-CORDS試紙條突變檢測系統(tǒng)，肉眼可視化直接讀取檢測變異株和非變異株。18例不同突變毒株的檢測結(jié)果表明，試紙條突變檢測結(jié)果與測序結(jié)果完全一致（準確度100%）（圖三）。
圖三.?RT-CORDS試紙條平臺檢測SARS-CoV-2變異株
該項成果于2022年2月15日發(fā)表在檢測領(lǐng)域國際權(quán)威期刊Biosensors and Bioelectronics（影響因子10.61），黃黎珍副教授為通訊作者，碩士研究生何昌生為第一作者，華南理工大學生物科學與工程學院為第一單位，廣東省疾病預防控制中心為第二單位。
該項工作得到國家重點研發(fā)計劃(2018YFC0910201)、國家自然科學基金(31871292)和廣東省自然科學基金(2019A1515010619)等項目資助。
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https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0956566321008940?via%3Dihub
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