陳鵬課題組發(fā)展新一代蛋白質(zhì)光交聯(lián)探針
時(shí)間：2021-04-06 16:49:04學(xué)院：化學(xué)與分子工程學(xué)院學(xué)校：北京大學(xué)
位點(diǎn)特異性的蛋白質(zhì)光交聯(lián)探針已經(jīng)成為研究活細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用的關(guān)鍵工具。陳鵬課題組長(zhǎng)期致力于發(fā)展基于遺傳密碼子拓展的蛋白質(zhì)光交聯(lián)技術(shù)。在之前的工作中他們?cè)O(shè)計(jì)了高效的光敏感非天然氨基酸交聯(lián)探針（DiZPK），能夠廣泛地用于捕捉活細(xì)胞內(nèi)的蛋白-蛋白相互作用。（Nat. Chem. Biol.,2011, 7, 671-677; J. Am. Chem. Soc.,2011, 133, 20581-20587.）
最近，在上述工作的基礎(chǔ)之上，該課題組發(fā)展了“可切割”的新一代光交聯(lián)探針DiZSeK（下圖）。與原有探針相比，新一代的探針在高效捕捉蛋白相互作用的同時(shí)，其骨架中所含的硒原子能夠在過氧化氫氧化條件下斷裂，從而實(shí)現(xiàn)對(duì)光交聯(lián)獲得的“誘餌蛋白-靶標(biāo)蛋白”復(fù)合物的分離。進(jìn)一步的，他們發(fā)展了能夠與靶標(biāo)蛋白上產(chǎn)生的次硒酸基團(tuán)發(fā)生特異反應(yīng)的捕獲試劑，實(shí)現(xiàn)了對(duì)靶標(biāo)蛋白的特異標(biāo)記和富集。上述新技術(shù)的發(fā)展，使他們?cè)诤罄m(xù)二維凝膠電泳實(shí)驗(yàn)中有效去除了誘餌蛋白的干擾，完成了對(duì)特定蛋白的全細(xì)胞靶標(biāo)蛋白的質(zhì)譜分析與鑒定。新一代“可切割型”光交聯(lián)探針的開發(fā)，將有力地推動(dòng)基于蛋白質(zhì)光交聯(lián)技術(shù)的蛋白質(zhì)組學(xué)研究。該工作近日在美國(guó)化學(xué)會(huì)志上發(fā)表(Lin SX, et al,J. Am. Chem. Soc. 2014, DOI10.1021/ja504371w),并被美國(guó)化學(xué)會(huì)的官方雜志 “Chemical & Engineering News”以News of the Week的形式進(jìn)行了報(bào)道。陳鵬實(shí)驗(yàn)室的研究生林世賢是該文的第一作者，同時(shí)化學(xué)學(xué)院的何丹，張帥，生命科學(xué)聯(lián)合中心的龍騰和鳳凰平臺(tái)質(zhì)譜中心的孟榮老師為論文的發(fā)表做出了重要的貢獻(xiàn)。此項(xiàng)研究得到了國(guó)家自然科學(xué)基金委、科技部和北大-清華生命科學(xué)聯(lián)合中心的資助。
原文鏈接：http://pubs.acs.org/doi/pdf/10.1021/ja504371w
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Volume 92 Issue 34?|?p. 4?|?News of The Week
Issue Date: August 25, 2014?|?Web Date: August 22, 2014
Linker Helps Detect Protein Partners
Biochemistry: Cleavable photo-cross-linker aids protein-protein interaction analysis
http://cen.acs.org/articles/92/i34/Linker-Helps-Detect-Protein-Partners.html?
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