伊成器課題組聚焦新冠病毒共感染病原體的檢測與研究
目前，新型冠狀病毒肺炎COVID-19疫情嚴峻，截至4月8日，全球已累計確診近134萬例，死亡超7萬，對人類生存健康造成了嚴重的危害。新型冠狀病毒肺炎COVID-19是由新型冠狀病毒SARS-CoV-2感染導(dǎo)致的，而感染者除了典型的肺炎等呼吸系統(tǒng)癥狀外，還伴隨多組織多器官的其他多種癥狀，其原因很可能是存在其他病原體的共感染或繼發(fā)感染。確定共感染的病原體類型與癥狀之間的關(guān)系，對于對癥治療和用藥指導(dǎo)尤為重要。但是如何做到對臨床樣品中共感染的多種病毒、細菌和真菌等病原體同時進行快速、無偏向性的檢測呢？
北京大學(xué)伊成器課題組新近發(fā)展的基于轉(zhuǎn)座酶的TRACE (Transposase assisted RNA/DNA hybrid Co-tagmEntation)建庫測序技術(shù)，能夠快捷地檢測與新冠病毒共感染的潛在病原體。TRACE技術(shù)不同于繁瑣、耗時久的傳統(tǒng)RNA-seq建庫流程，所有步驟均在一個試管中完成，建庫總時長小于6小時，操作時長不超過2小時，將原來需要數(shù)天完成的程序降低到半天；同時，TRACE技術(shù)能夠避免RNA材料的損失，縮小RNA起始量至納克級別，降低建庫成本，實現(xiàn)了簡便、快速、靈敏、高效的RNA建庫測序。TRACE技術(shù)可用于對鼻咽拭子、痰和糞便等樣本的建庫，使得臨床樣品中新型冠狀病毒RNA基因組和共感染病原體宏基因組的檢測更為便捷，有望在臨床上為定制個性化診療策略提供幫助。
該項工作的開展離不開學(xué)校和國家的支持（“病毒基因組學(xué)測序技術(shù)在新型冠狀病毒研究中的應(yīng)用”）和團隊協(xié)作。該應(yīng)急項目還包括中國科學(xué)院武漢病毒研究所劉翟課題組和武漢希望組的成員。此外，南京諾唯贊生物科技有限公司為項目的順利開展提供了關(guān)鍵試劑。目前，項目組已將該技術(shù)試用于臨床樣品的RNA文庫構(gòu)建和病毒檢測，并將TRACE技術(shù)成功應(yīng)用于首批病人咽拭子樣品的宏基因組測序。伊成器課題組正在利用臨床樣品進一步優(yōu)化TRACE技術(shù)，以快速實現(xiàn)更多臨床樣品的共感染病原體的檢測和分析，為新冠感染者的臨床診治提供更多理論依據(jù)，助力疫情防控取得更多進展。
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