陳海峰研究團(tuán)隊(duì)在組蛋白協(xié)同修飾研究中取得新進(jìn)展
?????? 近日，Nature系列刊物scientific reports在線發(fā)布了上海交通大學(xué)生命科學(xué)技術(shù)學(xué)院陳海峰研究團(tuán)隊(duì)的文章“Synergistic Modification Induced Specific Recognition between Histone and TRIM24 via Fluctuation Correlation Network Analysis”，該研究首次采用動(dòng)態(tài)相關(guān)網(wǎng)絡(luò)分析的方法研究了組蛋白協(xié)同修飾與TRIM24蛋白的特異性識(shí)別。該研究成果是與上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬仁濟(jì)醫(yī)院以及加州大學(xué)爾灣分校合作完成的。
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?????? 組蛋白可以發(fā)生甲基化、乙?；⒘姿峄?、泛素化等不同的修飾，從而調(diào)控基因的表達(dá)；不同的組蛋白修飾能夠被對(duì)應(yīng)的組蛋白“reader”識(shí)別和結(jié)合，然而這些蛋白是如何特異識(shí)別特定類型的組蛋白修飾，目前的研究還尚不清楚。
?????? 研究利用分子動(dòng)力學(xué)模擬結(jié)合動(dòng)態(tài)網(wǎng)絡(luò)分析的方法，通過構(gòu)建不同的組蛋白修飾體系，系統(tǒng)的分析了與乳腺癌相關(guān)的“reader”蛋白TRIM24與組蛋白修飾的關(guān)系。研究發(fā)現(xiàn)TRIM24蛋白在結(jié)合不同位點(diǎn)和不同類型的組蛋白修飾后構(gòu)象和蛋白內(nèi)部網(wǎng)絡(luò)存在差異顯著，在動(dòng)態(tài)網(wǎng)絡(luò)以及社區(qū)網(wǎng)絡(luò)分類的基礎(chǔ)上提出了“協(xié)同修飾誘導(dǎo)識(shí)別”的理論，對(duì)于靶向“reader”蛋白的藥物發(fā)現(xiàn)具有重要的指導(dǎo)意義。同時(shí)，這一方法對(duì)于生物大分子間的別構(gòu)以及信號(hào)傳導(dǎo)等機(jī)制的研究也具有重要意義。
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