由德林研究小組在DNA磷硫酰化修飾生物化學(xué)研究取得新進展
?????? 7月27日，《scientific reports》雜志在線發(fā)表了上海交通大學(xué)生命科學(xué)技術(shù)學(xué)院、微生物代謝國家重點實驗室由德林教授研究小組以曹博為第一作者的研究論文“In vitro analysis of phosphorothioate modification of DNA reveals substrate recognition by a multiprotein complex” 。該研究首次在體外再現(xiàn)了DNA磷硫酰化修飾生物反應(yīng)，并發(fā)現(xiàn)磷硫酰化修飾過程中形成了600 kDa的蛋白復(fù)合體用于底物識別和催化。
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?????? DNA磷硫?；橇蛟尤〈鶧NA骨架非橋聯(lián)氧原子的一種新型表觀遺傳學(xué)修飾，這種修飾廣泛存在于原核生物中。由德林教授研究小組最近闡明其5個修飾基因中dptB基因為負調(diào)控基因，在轉(zhuǎn)錄水平上調(diào)控DNA磷硫?；揎椈虻谋磉_（Cheng et al, Molecular Microbiology 2015, doi: 10.1111/mmi.13096），但其它4個修飾基因在DNA磷硫?；揎椷^程中的具體功能以及修飾蛋白對DNA底物的識別機制目前尚不清楚。
?????? 本研究通過構(gòu)建沙門氏菌的全細胞裂解液催化體系，在體外再現(xiàn)了DNA磷硫?；揎椃磻?yīng)。實驗結(jié)果發(fā)現(xiàn)，GAAC/GTTC為修飾反應(yīng)的保守序列，其兩側(cè)序列對修飾沒有影響，雙鏈DNA可以在體外被修飾，但單鏈DNA不能被修飾。研究還發(fā)現(xiàn)參與修飾反應(yīng)的DptC、DptD和DptE 3個蛋白形成了穩(wěn)定的600 kDa復(fù)合體，用于底物識別和催化。該研究首次展示了在體外DNA磷硫?；揎椫忻甘且缘鞍讖?fù)合物的形式實現(xiàn)修飾功能，為進一步深入理解DNA磷硫酰化的生物化學(xué)過程奠定了重要基礎(chǔ)。
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