鄧子新團(tuán)隊(duì)揭示多重耐藥肺炎克雷伯菌可移動(dòng)基因組
?????? 近日，英國抗菌化療協(xié)會(huì) (British Society for Antimicrobial Chemotherapy)出版的刊物《Journal of Antimicrobial Chemotherapy》在線發(fā)表了上海交通大學(xué)微生物代謝國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室鄧子新團(tuán)隊(duì)關(guān)于肺炎克雷伯菌HS11286的基因組分析論文“Mapping the resistance-associated mobilome of a carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae strain reveals insights into factors shaping these regions and facilitates generation of a ‘resistance-disarmed’ model organism” 。該論文的第一作者為博士生畢德璽，指導(dǎo)教師為歐竑宇教授。
?
?
?????? 抗生素濫用引發(fā)的細(xì)菌耐藥問題已成為全球關(guān)注熱點(diǎn)之一，應(yīng)對(duì)以耐碳青霉烯類抗生素為代表的多重耐藥菌已刻不容緩；而肺炎克雷伯菌 (Klebsiella pneumonia) 則是院內(nèi)感染最重要的多重耐藥條件致病菌之一。該研究深入分析了碳青霉烯類抗生素抗性的、屬于中國流行克隆群 (ST11型) 的肺炎克雷伯菌HS11286基因組，發(fā)現(xiàn)了6個(gè)質(zhì)粒、2個(gè)整合性接合元件和7個(gè)前噬菌體等復(fù)雜的可移動(dòng)遺傳元件，闡明了轉(zhuǎn)座子Tn3、Tn1721和Tn5393和插入序列IS26等元件對(duì)blaKPC-2等二十多個(gè)重要耐藥基因的水平轉(zhuǎn)移有重要貢獻(xiàn)。此外，輔于分子遺傳學(xué)實(shí)驗(yàn)，確定了HS11286的耐藥基因缺失突變株對(duì)臨床常用抗菌藥物的敏感性大幅提高，由此也成功構(gòu)建了可用于實(shí)驗(yàn)室安全遺傳操作的肺炎克雷伯菌模式菌株。
?????? 這是該團(tuán)隊(duì)在病原細(xì)菌基因組研究中取得的最新進(jìn)展之一。此外，今年他們還合作報(bào)道了轉(zhuǎn)座子Tn1721同時(shí)編碼碳青霉烯酶和磷霉素抗性 (Antimicrobial Agents and Chemotherapy, 2015, 59:338-343)，比較分析了高致病鮑曼不動(dòng)桿菌的全基因組序列 (Scientific Reports, 2015, 5:8643)。這些進(jìn)展得益于該團(tuán)隊(duì)圍繞細(xì)菌可移動(dòng)基因組研發(fā)的微生物信息學(xué)平臺(tái)。近十年來，該平臺(tái)向國內(nèi)外微生物學(xué)同行提供了細(xì)菌基因組快速比對(duì)和可移動(dòng)遺傳元件識(shí)別等一系列特色的在線工具和開放數(shù)據(jù)庫。其中，與細(xì)菌耐藥性播散相關(guān)的整合性接合元件數(shù)據(jù)庫ICEberg和IV型分泌系統(tǒng)數(shù)據(jù)庫SecReT4、與細(xì)菌致病性相關(guān)的VI型分泌系統(tǒng)數(shù)據(jù)庫SecReT6等三個(gè)分子生物學(xué)數(shù)據(jù)庫被美國橡樹嶺國家實(shí)驗(yàn)室的Dr. Igor B. Zhulin向微生物學(xué)研究者推薦使用 (J Bacteriol, 2015, 197:2458-67)。這些研究是微生物代謝國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室在分子微生物學(xué)和生物信息學(xué)等多學(xué)科交叉所取得的一系列進(jìn)展，將有助于實(shí)現(xiàn)重要微生物代謝潛力的深度挖掘。
版權(quán)與免責(zé)聲明：本網(wǎng)頁的內(nèi)容由收集互聯(lián)網(wǎng)上公開發(fā)布的信息整理獲得。目的在于傳遞信息及分享，并不意味著贊同其觀點(diǎn)或證實(shí)其真實(shí)性，也不構(gòu)成其他建議。僅提供交流平臺(tái)，不為其版權(quán)負(fù)責(zé)。如涉及侵權(quán)，請聯(lián)系我們及時(shí)修改或刪除。郵箱：sales@allpeptide.com