由德林研究小組揭示DNA磷硫?；揎椪{控機制
?????? 近日，國際微生物學權威期刊Molecular Microbiology在線發(fā)表了上海交通大學生命科學技術學院、微生物代謝國家重點實驗室由德林教授小組的最新研究進展“Regulation of DNA phosphorothioate modifications by the transcriptional regulator DptB in Salmonella”。該研究揭示了DNA磷硫酰化修飾在轉錄水平上調控的分子機制。
?????? DNA磷硫酰化修飾是近年發(fā)現(xiàn)的一種新型表觀遺傳學生理修飾，該修飾位于DNA大分子骨架上，由硫原子取代了DNA磷酸骨架上非橋聯(lián)氧原子而形成了具有序列特異性和空間構象專一性的磷硫酰化修飾。這種新型表觀遺傳學修飾的調控機制目前尚不清楚，它的發(fā)現(xiàn)拓展了經(jīng)典的DNA組成理論，在國內(nèi)外引起了廣泛關注。
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?????? 由德林教授研究小組成秋香和曹博研究發(fā)現(xiàn)，敲除沙門氏菌中控制磷硫?；揎椈騞ptBCDE中的dptB基因后，細胞內(nèi)磷硫?；揎椝皆鰪?，同時在細胞快速生長時期，該基因的下游DNA磷硫?；蜣D錄水平明顯增高。當用dptB基因回補其突變株時，下游修飾基因的轉錄和細胞內(nèi)磷硫酰化修飾恢復到與野生型沙門氏菌相當水平，表明dptB在轉錄水平上負調控DNA磷硫?；揎椈虻谋磉_。同時，通過精確定位DptB在DNA磷硫?；揎椈蛏嫌握{控區(qū)的2個DNA結合區(qū)域，發(fā)現(xiàn)每個靶序列中都含有1對保守的正向重復序列，進一步研究也表明，這種負調控機制是DNA磷硫?；揎椫衅毡榇嬖诘恼{控方式。
?????? 該研究是由德林教授研究小組繼破譯DNA磷硫酰化修飾基因組圖譜（Cao et al, Nature Communication, 2014, 5: 3951），解析DNA磷硫酰化修飾限制系統(tǒng)作用機制（Cao et al, Molecular Microbiology 2014, 93(4):776-85）之后，在這種新型表觀遺傳學修飾生物學研究上的又一重要進展，對理解基因組上的低頻率的修飾機制和修飾的生理功能具有重要的意義。
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