PLoS Pathogens— 朱勃/陳功友聯(lián)合團隊研究揭示植物病原原核細菌通過A-to-I的 RNA編輯適應(yīng)環(huán)境變化的新機制
國際著名學(xué)術(shù)期刊PLoS Pathogens于2020年8月21日在線發(fā)表了上海交通大學(xué)農(nóng)業(yè)與生物學(xué)院朱勃/陳功友聯(lián)合團隊研究成果“A-to-I RNA editing in bacteria increases pathogenicity and tolerance against oxidative stress”，揭示了原核細菌通過A-to-I的?RNA編輯適應(yīng)環(huán)境變化的新機制。
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腺苷-肌苷(A-to-I) RNA編輯是真核生物中重要的轉(zhuǎn)錄后事件，由ADAR家族的腺苷脫氨酶催化。由于肌苷(I)被聚合酶和翻譯機制識別為鳥苷(G)，?mRNA編碼區(qū)的A-to-I編輯可導(dǎo)致密碼子改變，從而導(dǎo)致蛋白功能的多樣性。而原核生物中A-to-I編輯及其生物學(xué)意義，還鮮有研究。研究團隊通過自行開發(fā)的Python腳本對稻黃單胞菌稻生致病變種Xanthomonasoryzae?pv. oryzicola?(Xoc)在氧化應(yīng)激下的A-to-I編輯事件進行識別和分析，發(fā)現(xiàn)A-to-I編輯在氧化應(yīng)激脅迫下將鞭毛蛋白FliC第128位氨基酸由絲氨酸（S）變?yōu)楦彼幔≒），從而導(dǎo)致鞭毛絲結(jié)構(gòu)的改變。這種轉(zhuǎn)錄后編輯可以通過增加生物膜的形成來增加氧化應(yīng)激耐受性和和在水稻上的毒性。原核細菌惡臭假單胞菌Pseudomonas putida也存在A-to-I編輯響應(yīng)氧化應(yīng)激的機制。
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上海交通大學(xué)農(nóng)業(yè)與生物學(xué)院博士研究生聶文翰和王賽以及中國科學(xué)技術(shù)大學(xué)博士后何瑞為論文的共同第一作者，上海交通大學(xué)長聘教軌副教授朱勃和長聘教授陳功友為論文的共同通訊作者。朱勃博士2017年以長聘教軌副教授引入交大農(nóng)業(yè)與生物學(xué)院。該研究得到了科技部重點研發(fā)等項目（項目編號2017YFD0201108和2018YFD0201202）的資助。
論文鏈接：https://journals.plos.org/plospathogens/article?id=10.1371/journal.ppat.1008740
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