鬼臼毒素是鬼臼亞科(Podophylloideae)植物特有的次生代謝物,屬于木質(zhì)素類(lignans)化合物,是非常重要的抗腫瘤藥物的先導(dǎo)化合物,然而其代謝途徑中關(guān)鍵基因的分子進化模式仍然不清楚。本研究組選擇八角蓮屬(Dysosma)的云南八角蓮(D. aurantiocaulis)和八角蓮(D. versipellis)兩個種為研究對象,基于RNA-Seq技術(shù),利用Illumina HiSeq 2000測序平臺,比較分析了兩個種嫩葉期的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),并利用直接PCR測序方法探討了鬼臼毒素合成路徑關(guān)鍵基因CYP719A的進化式樣。該研究成功開發(fā)了大量可用的群體遺傳學(xué)分子標記,如EST-SSR、單拷貝核基因。首次揭示了CYP719A基因在鬼臼亞科植物中具有19個基因型,并形成單系,該基因在進化過程中為保持功能經(jīng)歷很強的凈化選擇(purifying selection)。在八角蓮屬內(nèi),該基因表現(xiàn)為高海拔物種經(jīng)歷了松散的凈化選擇或更多的正向選擇作用。論文第一作者為邱英雄教授指導(dǎo)的博士生毛云銳。
該研究結(jié)果以“Comparative transcriptome resources of two?Dysosma?species (Berberidaceae) and molecular evolution of the?CYP719A?gene in Podophylloideae”為題發(fā)表于自然科學(xué)類期刊Molecular Ecology Resources??(IF:?5.626)上。?
上述研究工作得到國家自然科學(xué)基金(31170200, 31370241)和浙江省杰出青年項目(LR12C02001)的資助。?
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Yun-Rui Mao,?Yong-Hua Zhang,?Chuan Xu and?Ying-Xiong Qiu*. Comparative transcriptome resources of two?Dysosma?species (Berberidaceae) and molecular evolution of the?CYP719A?gene in Podophylloideae.?Molecular Ecology Resources?(IF:?5.626).?14?APR?2015. DOI:?10.1111/1755-0998.12415.
http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/1755-0998.12415
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