新冠肺炎(COVID-19)目前在全世界多個國家爆發(fā)流行,新型冠狀病毒(SARS-CoV-2)核酸檢測目前是實驗室病原檢測的金標準。為保護實驗室檢測人員不受感染,大多數(shù)實驗室使用滅活標本進行核酸檢測。西安市疾病預防控制中心馬超鋒團隊和清華大學醫(yī)學院郭永團隊合作,利用絕對定量的微滴數(shù)字PCR(ddPCR)技術檢測新冠病毒N基因和ORF 1ab基因,比較了TRIzol 試劑、不同溫度的熱滅活方法對臨床樣本中新型冠狀病毒基因拷貝數(shù)的影響,為實驗室選擇適宜滅活方法且提高檢出率提供了科學依據(jù)。該研究結果于5月28日在Journal of Clinical Microbiology發(fā)表(doi:10.1128/JCM.00958-20)。
該研究收集了61份新型冠狀病毒(SARS-CoV-2)核酸檢測陽性的鼻咽拭子標本,采用了以下幾種滅活方法:1、TRIzol試劑在室溫下滅活10分鐘;2、在56℃水浴中加熱30分鐘;3、高溫處理,包括121℃高壓20分鐘、100℃沸水浴煮沸20分鐘、80℃水浴加熱20分鐘。該研究發(fā)現(xiàn),與原始樣品中的RNA量相比,TRIzol處理破壞了47.54%的N基因和39.85%的ORF 1ab基因;56℃30分鐘加熱處理后,N基因和ORF 1ab拷貝數(shù)分別減少48.55%和56.40%;在80℃加熱20分鐘后,病毒RNA拷貝數(shù)下降了50-66%;121℃高壓滅菌或100℃煮沸20分鐘破壞了絕大部分病毒RNA,幾乎未檢測到病毒RNA。
圖1. TRIzol室溫10分鐘處理對生物標本中新冠病毒基因拷貝數(shù)的影響
圖2. 56℃加熱30分鐘處理對生物標本中新冠病毒基因拷貝數(shù)的影響
圖3. 80℃、100℃及121℃加熱20分鐘處理對生物標本中新冠病毒基因拷貝數(shù)的影響
該研究結果表明,滅活降低了可檢測到的病毒RNA數(shù)量,尤其對于弱陽性標本,可能導致假陰性結果。相較于熱滅活,TRIzol處理對病毒核酸拷貝數(shù)影響更小,因此推薦使用TRIzol對臨床樣本進行滅活處理。
吳瑞、陳海龍、邢遠為該研究的共同第一作者,馬超鋒和郭永為該研究的共同通訊作者。該項目受到西安市新型冠狀病毒肺炎疫情應急防治專項項目、清華大學疫情防控科技攻關應急課題、北京市科委新冠肺炎應急項目、新羿生物等單位或項目的支持。
https://jcm.asm.org/content/early/2020/05/28/JCM.00958-20
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