10月4日,同濟大學醫(yī)學院、同濟大學附屬上海市肺科醫(yī)院戈寶學教授團隊在Nature Communications雜志在線發(fā)表題為“Genome-wide association study identifies two risk loci for tuberculosis in Han Chinese”的研究論文。首次報道TGM6和ESRRB兩個新的結(jié)核病易感基因,為結(jié)核病的發(fā)病機制研究和個體化診療提供新的靶點和理論支持。這項研究由同濟大學附屬上海市肺科醫(yī)院戈寶學教授領(lǐng)銜,聯(lián)合上海交通大學、深圳華大基因、南通市第六人民醫(yī)院和深圳大學等國內(nèi)多家單位共同參與完成。
為探索新的結(jié)核病易感基因,同濟大學附屬上海市肺科醫(yī)院戈寶學教授團隊等,通過對3個獨立漢族人群(包括8,039例樣本)進行三階段GWAS研究,發(fā)現(xiàn)rs12437118和rs6114027 兩個新的遺傳變異與結(jié)核病顯著相關(guān),這些易感變異分別位于基因TGM6和ESRRB上。此外,攜帶有rs6114027位點C等位基因的結(jié)核病患者伴有TGM6基因表達水平下降,同時血漿中sIL-2R水平上升,IL-6水平下降,痰涂片帶菌量增加,提示該SNP位點是結(jié)核病新的易感基因位點。最后,通過CRISPR/Cas9基因編輯技術(shù)構(gòu)建tgm6基因敲除小鼠,利用結(jié)核菌動物感染模型,最終證實tgm6在結(jié)核病的發(fā)病過程中發(fā)揮重要作用。本研究為結(jié)核病藥物靶點研發(fā)、疾病預防與診療提供新的契機,為實現(xiàn)結(jié)核病的精準診療奠定基礎(chǔ)。
該項研究結(jié)合GWAS技術(shù)和基因敲除小鼠,對易感基因的生物學功能進行了深入研究,從遺傳相關(guān)性到動物模型的功能驗證,為結(jié)核病相關(guān)易感基因位點的研究提供了創(chuàng)新性的研究模式。
據(jù)悉,同濟大學附屬上海市肺科醫(yī)院助理研究員鄭瑞娟博士,上海交通大學李志強博士以及深圳華大基因何福生博士為該論文的共同第一作者;同濟大學醫(yī)學院、同濟大學附屬上海市肺科醫(yī)院戈寶學教授為論文的通訊作者,同濟大學附屬上海市肺科醫(yī)院劉海鵬副研究員,上海交通大學師詠勇教授及深圳華大基因?qū)O嗣龍教授為該論文的共同通訊作者。
戈寶學教授目前擔任上海市結(jié)核病(肺)重點實驗室主任,該實驗室是由上海市科學技術(shù)委員會于2004年批準成立的市級重點實驗室,依托于上海市肺科醫(yī)院,圍繞肺結(jié)核預防和診治開展基礎(chǔ)和臨床轉(zhuǎn)化醫(yī)學研究。該項目獲得國家重點研發(fā)計劃項目,國家自然科學基金重點項目,基金委重大研究計劃項目,上海市重中之重臨床重點學科建設(shè)項目等資助。
https://www.nature.com/articles/s41467-018-06539-w
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