2018年5月4日,同濟(jì)大學(xué)生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院康九紅教授和施威揚(yáng)研究員合作在老牌學(xué)術(shù)期刊《Nucleic Acids Research》(IF:10.162)在線發(fā)表題為“Sin3a-Tet1 interaction activates gene transcription and is required for embryonic stem cell pluripotency”的研究論文。該文章首次揭示了輔助因子Sin3a通過聯(lián)合DNA羥甲基化酶Tet1形成轉(zhuǎn)錄激活機(jī)器,并闡明Sin3a-Tet1復(fù)合體對(duì)于胚胎干細(xì)胞的全能性起到重要調(diào)控作用。
胚胎干細(xì)胞(ES)的自我更新和分化潛能這兩種特性受到細(xì)胞外各種信號(hào)、細(xì)胞內(nèi)轉(zhuǎn)錄因子、表觀修飾分子、核小體重塑蛋白以及一些輔助因子等的協(xié)同作用。Sin3a作為一個(gè)重要的輔助蛋白在胚胎發(fā)育的囊胚期就有廣泛表達(dá),并在胚胎發(fā)育過程中發(fā)揮重要作用。傳統(tǒng)的觀念認(rèn)為,Sin3a是一個(gè)支架蛋白,能夠提供獨(dú)特的接觸平臺(tái)與特定的蛋白結(jié)合形成轉(zhuǎn)錄抑制復(fù)合物參與調(diào)控多種生物學(xué)事件。然而,Sin3a在基因轉(zhuǎn)錄激活調(diào)控過程中的重要作用往往被低估;并且將這些Sin3a參與形成的特定蛋白結(jié)合與具體的生物學(xué)功能聯(lián)系起來非常具有挑戰(zhàn)性。
該項(xiàng)研究發(fā)現(xiàn)Sin3a對(duì)于ES細(xì)胞多能性維持是非常重要的,其缺失會(huì)導(dǎo)致ES細(xì)胞喪失正常的自我更新能力并傾向于中內(nèi)胚層分化。作為關(guān)鍵的早期胚胎誘導(dǎo)信號(hào),Nodal信號(hào)的強(qiáng)度與小鼠ES細(xì)胞的中內(nèi)胚層分化關(guān)系密切。該項(xiàng)工作首次將小鼠ES細(xì)胞中Sin3a-Tet1復(fù)合體與Nodal信號(hào)關(guān)鍵分子Lefty1的轉(zhuǎn)錄激活聯(lián)系起來。深入研究還發(fā)現(xiàn)Sin3a的PAH1結(jié)構(gòu)域的兩個(gè)關(guān)鍵氨基酸(Phe147、Phe182)對(duì)于Sin3a-Tet1的結(jié)合及其調(diào)控ES細(xì)胞全能性維持是必需的。更重要的是,本文作者通過ChIP-seq和MeDIP-seq分析發(fā)現(xiàn)Sin3a和Tet1能夠正向調(diào)控大量基因轉(zhuǎn)錄表達(dá),表明Sin3a-Tet1復(fù)合物促進(jìn)基因轉(zhuǎn)錄是一種普遍調(diào)控模式。因此,該項(xiàng)工作揭示了Sin3a結(jié)合表觀修飾分子Tet1促進(jìn)基因表達(dá)的新機(jī)制,闡釋了Sin3a在ES細(xì)胞全能性調(diào)控中的新模式。
康九紅教授和施威揚(yáng)研究員為該文的共同通訊作者。博士研究生朱付貴為該文的第一作者。該項(xiàng)工作的大數(shù)據(jù)分析得到了同濟(jì)大學(xué)生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院江賜忠課題組的支持,博士研究生朱乾書和劉鎮(zhèn)萍碩士參與了相關(guān)生物信息分析工作。參與此項(xiàng)工作的還有葉丹博士、郭旭東博士、張清泉博士、博士研究生楊一偉、汪貴英副教授、陳文副教授以及朱頌成副教授等。該項(xiàng)目得到國(guó)家科技部、國(guó)家自然科學(xué)基金委、上海市科委等項(xiàng)目的資助。
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https://academic.oup.com/nar/advance-article/doi/10.1093/nar/gky347/4992654?guestAccessKey=59f29b41-000c-4651-b904-74c85dbe13cf
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