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一個(gè) FAM 熒光標(biāo)記的 β-Amyloid (1-40) 肽。
編號(hào):110381
CAS號(hào):1678416-08-4
單字母:5FAM-DAEFRHDSGYEVHHQKLVFFAEDVGSNKGAIIGLMVGGVV-OH
編號(hào): | 110381 |
中文名稱: | 淀粉肽Fam-βAmyloid(1-40) |
英文名: | Fam-βAmyloid(1-40) |
CAS號(hào): | 1678416-08-4 |
單字母: | 5FAM-DAEFRHDSGYEVHHQKLVFFAEDVGSNKGAIIGLMVGGVV-OH |
三字母: | 5FAM N端標(biāo)記5-FAM -Asp天冬氨酸 -Ala丙氨酸 -Glu谷氨酸 -Phe苯丙氨酸 -Arg精氨酸 -His組氨酸 -Asp天冬氨酸 -Ser絲氨酸 -Gly甘氨酸 -Tyr酪氨酸 -Glu谷氨酸 -Val纈氨酸 -His組氨酸 -His組氨酸 -Gln谷氨酰胺 -Lys賴氨酸 -Leu亮氨酸 -Val纈氨酸 -Phe苯丙氨酸 -Phe苯丙氨酸 -Ala丙氨酸 -Glu谷氨酸 -Asp天冬氨酸 -Val纈氨酸 -Gly甘氨酸 -Ser絲氨酸 -Asn天冬酰胺 -Lys賴氨酸 -Gly甘氨酸 -Ala丙氨酸 -Ile異亮氨酸 -Ile異亮氨酸 -Gly甘氨酸 -Leu亮氨酸 -Met甲硫氨酸 -Val纈氨酸 -Gly甘氨酸 -Gly甘氨酸 -Val纈氨酸 -Val纈氨酸 -OHC端羧基 |
氨基酸個(gè)數(shù): | 40 |
分子式: | C215H305O64N53S1 |
平均分子量: | 4688.1 |
精確分子量: | 4685.2 |
等電點(diǎn)(PI): | 6.23 |
pH=7.0時(shí)的凈電荷數(shù): | -1.29 |
平均親水性: | -0.1 |
疏水性值: | 0.07 |
外觀與性狀: | 淡黃色粉末狀固體 |
消光系數(shù): | 1490 |
來(lái)源: | 人工化學(xué)合成,僅限科學(xué)研究使用,不得用于人體。 |
純度: | 95%、98% |
鹽體系: | 可選TFA、HAc、HCl或其它 |
儲(chǔ)存條件: | 負(fù)80℃至負(fù)20℃ |
標(biāo)簽: | 淀粉樣肽(Amyloid Peptides) FAM、FITC修飾肽 |
β-Amyloid (1-40), FAM-labeled 是一個(gè) FAM 熒光標(biāo)記的 β-Amyloid (1-40) 肽 (λex=?492?nm and λem=?518?nm)。
β-Amyloid (1-40), FAM-labeled is a FAM fluorescently-labelled?β-Amyloid (1-40) peptide (λex=?492?nm and λem=?518?nm)[1].
淀粉肽背景:β淀粉樣蛋白(Aβ或Abeta)是從淀粉樣前體蛋白加工而成的含有36–43個(gè)氨基酸的多肽。Aβ是與阿爾茲海默病相關(guān)的淀粉樣蛋白斑的成分。已有證據(jù)表明,Aβ是一個(gè)多功能肽,具有顯著的非病理性活性。Aβ是阿爾茲海默病患者腦中發(fā)現(xiàn)的沉積物的主要成分。在散發(fā)性阿爾茲海默病患者的腦中,Aβ的水平升高,造成腦血管病變和神經(jīng)毒性。Aβ蛋白是由β和γ分泌酶的連續(xù)作用而產(chǎn)生的。γ分泌酶產(chǎn)生Aβ肽的C末端,在APP的轉(zhuǎn)膜結(jié)構(gòu)域切割,可以產(chǎn)生許多36-43個(gè)氨基酸殘基長(zhǎng)度的異構(gòu)體,最常見的異構(gòu)體是Aβ40和Aβ42。更長(zhǎng)形式的Aβ在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)中切割產(chǎn)生,而更短形式的Aβ在反面高爾基網(wǎng)中產(chǎn)生。
structure of Amyloid β-Peptide (1-40) (human)
淀粉樣蛋白肽的 定義淀粉樣蛋白 是絲狀蛋白質(zhì)沉積物,大小從納米到微米不等,并且由肽β鏈的平行或反平行排列形成的聚集的肽β折疊構(gòu)成。
結(jié)構(gòu)特征:使用固態(tài)NMR(SSNMR),與計(jì)算能量最小化過(guò)程結(jié)合,Tycko和合作者已經(jīng)提出從淀粉狀蛋白肽SS(Aß1-40)的40個(gè)殘基的形式形成的淀粉樣蛋白原纖維的結(jié)構(gòu)在pH 7.4和24 o C在靜止條件下。在這種結(jié)構(gòu)中,每個(gè)Aß1-40分子在原纖維的核心區(qū)域貢獻(xiàn)一對(duì)ß鏈,大約跨越殘基12-24和30-40。這些由回路25-29連接的鏈不是同一張ß-sheet的一部分,但參與同一原絲內(nèi)兩個(gè)不同的ß-sheets的形成。不同的Aß分子2、3至少?gòu)牡?到39位殘基以平行排列和對(duì)齊的方式相互堆疊。通過(guò)調(diào)用其他實(shí)驗(yàn)約束,例如使用透射電子顯微鏡(TEM)觀察到的原絲直徑和單位質(zhì)量通過(guò)掃描透射電子顯微鏡(STEM)1、2測(cè)得的長(zhǎng)度表明,單個(gè)原絲是由四個(gè)ß片組成的,它們之間的距離約為10Å。
作用模式:阿爾茨海默氏病(AD)是淀粉樣蛋白絲狀沉積物的結(jié)果,淀粉狀蛋白沉積物在分子水平上定義該疾病,發(fā)生在神經(jīng)周膜,軸突,樹突和神經(jīng)元末端,如神經(jīng)原纖維纏結(jié)(NFT),在細(xì)胞外神經(jīng)纖維中淀粉樣斑塊(APC),以及周圍的血管稱為淀粉樣嗜血性血管?。ˋCA)。淀粉樣蛋白沉積物顯然發(fā)生在發(fā)展NFT的神經(jīng)元末端區(qū)域。已經(jīng)表明,APC和ACA的主要成分已被證明是4.5kDa的淀粉樣蛋白,最初被稱為“β-蛋白”或“淀粉樣蛋白A4”,我們現(xiàn)在將其稱為“βA4”。
功能:鈣失調(diào)和膜破壞是可溶性淀粉樣蛋白低聚物普遍存在的神經(jīng)毒性機(jī)制:進(jìn)行了一項(xiàng)研究,以研究Ca 2+信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)可能參與淀粉樣蛋白誘導(dǎo)的細(xì)胞毒性,疾病相關(guān)淀粉樣蛋白(β,病毒,胰島淀粉樣蛋白)的均質(zhì)制劑制備了處于各種聚集狀態(tài)的多肽,聚谷氨酰胺和溶菌酶),并測(cè)試了它們對(duì)加載fluo-3的SH-SY5Y細(xì)胞的作用。寡聚形式的所有淀粉樣蛋白的應(yīng)用(0.6-6 µg / ml)迅速(約5 s)使細(xì)胞內(nèi)Ca 2+升高,而等量的單體和原纖維則沒(méi)有。細(xì)胞內(nèi)Ca 2+耗盡后,Abeta42低聚物引起的Ca 2+信號(hào)持續(xù)存在店,和小信號(hào)仍留在鈣2 + -游離介質(zhì),指示從細(xì)胞外和細(xì)胞內(nèi)Ca貢獻(xiàn)2+源。膜對(duì)Ca 2+的滲透性增加不能歸因于內(nèi)源性Ca 2+通道的活化,因?yàn)榉磻?yīng)不受強(qiáng)力的Ca 2 +-通道阻滯劑鈷的影響。取而代之的是,觀察到Abeta42和其他低聚物引起陰離子熒光染料的快速細(xì)胞泄漏,這表明膜通透性普遍提高。導(dǎo)致的離子和分子通量失調(diào)可能為許多淀粉樣變性疾病中Ca 2+失調(diào)提供了由低聚物介導(dǎo)的毒性的常見機(jī)制。離子起著至關(guān)重要的作用,因?yàn)樗鼈兊目缒舛忍荻群軓?qiáng),并且參與了細(xì)胞功能障礙和死亡。
2型糖尿病中的胰島淀粉樣蛋白和毒性低聚物假說(shuō): 2型糖尿?。═2DM)的特征是胰島素抵抗,胰島素分泌缺陷,β細(xì)胞量減少,β細(xì)胞凋亡增加和胰島淀粉樣蛋白。胰島淀粉樣蛋白源自胰島淀粉樣蛋白多肽(IAPP,胰島淀粉樣多肽),該蛋白是通過(guò)胰β細(xì)胞與胰島素共表達(dá)和共分泌的蛋白。與其他淀粉樣蛋白一樣,IAPP具有形成膜滲透性毒性低聚物的傾向。越來(lái)越多的證據(jù)表明,這些有毒的寡聚體而不是這些蛋白質(zhì)的細(xì)胞外淀粉樣蛋白形式,是導(dǎo)致神經(jīng)退行性疾病中神經(jīng)元丟失的原因。有人提出,胞內(nèi)IAPP寡聚物的形成可能會(huì)導(dǎo)致T2DM 6中的β細(xì)胞丟失。
多肽熒光標(biāo)記由于沒(méi)有放射性,實(shí)驗(yàn)操作簡(jiǎn)單。因此,目前在生物學(xué)研究中多肽熒光標(biāo)記應(yīng)用非常廣泛,多肽熒光標(biāo)記方法與熒光試劑的結(jié)構(gòu)有關(guān)系,對(duì)于有游離羧基的采用的方法與接多肽反應(yīng)相同,也采用HBTU/HOBt/DIEA方法連接。 在N端標(biāo)記FITC的多肽需經(jīng)歷環(huán)化作用來(lái)形成熒光素,通常會(huì)伴有最后一個(gè)氨基酸的去除,但當(dāng)有一個(gè)間隔器如氨基己酸,或者是通過(guò)非酸性環(huán)境將目的多肽從樹脂上切下來(lái)時(shí),這種情況可避免在切割的過(guò)程中被TFA切割掉。
人們利用利用熒光標(biāo)記的多肽來(lái)檢測(cè)目標(biāo)蛋白的活性,并將 其發(fā)展的高通量活性篩選方法應(yīng)用于疾病治療靶點(diǎn)蛋白的藥物篩選和藥物開發(fā)(例如,各種激 酶、磷酸酶、肽酶等)。
專肽生物能夠提供技術(shù)成熟的各種熒光標(biāo)記多肽。
下面是一些常見的多肽修飾熒光物質(zhì)結(jié)構(gòu):
FITC標(biāo)記
FITC(異硫氰酸熒光素)具有比較高的活性,我們公司可以通過(guò)兩種方式將FITC標(biāo)記于多肽 上:(1) 將FITC標(biāo)記于賴氨酸(Lys)或被選擇性地脫保護(hù)的鳥氨酸(ornithine)側(cè)鏈氨基 上;(2) 將FITC標(biāo)記于多肽N端氨基。
當(dāng)在N端標(biāo)記時(shí),建議在最后一個(gè)氨基和由異硫氰酸酯與氨基反應(yīng)產(chǎn)生的硫脲鍵之間引入 烷基間隔器(alkyl spacer),如氨基己酸(Ahx)。鏈接切割需要酸性環(huán)境,在N端標(biāo)記FITC 的多肽需經(jīng)歷環(huán)化作用來(lái)形成熒光素,通常會(huì)伴有最后一個(gè)氨基酸的去除,但當(dāng)有一個(gè)間隔器 如氨基己酸,或者是通過(guò)非酸性環(huán)境將目的肽從樹脂上切下來(lái)時(shí),這種情況可避免??臻g位阻 被認(rèn)為是在熒光染料前使用Ahx的主要原因,而不是為什么FITC不能直接偶聯(lián)在多肽上的原因。
Ahx或b-Ala均可作為間隔器用于FITC標(biāo)記的多肽上。
熒光修飾中文名稱 | N端 | N端帶有l(wèi)inker |
生物素標(biāo)記多肽 | Biotin- | Biotin-Ahx- |
異硫氰酸熒光素 | FITC- | FITC-Ahx- |
5-羧基熒光素 | 5-FAM- | 5-FAM-Ahx- |
丹磺酰熒光素 | Dansyl- | Dansyl-Ahx- |
5-羧基四甲基羅丹明 | TMR- (TAMRA-) | TMR-Ahx- (TAMRA-Ahx-) |
多肽N端 | 多肽序列中間 | N端帶有l(wèi)inker |
生物素標(biāo)記多肽 | Biotin- | 多肽C端 |
Lys(Biotin)- | -Lys(Biotin)-- | -Lys(Biotin) |
Lys(FITC)- | -Lys(FITC)- | -Lys(FITC) |
Lys(5-FAM)- | -Lys(5-FAM)- | -Lys(5-FAM) |
Lys(Dansyl)- | -Lys(Dansyl)- | -Lys(Dansyl) |
Lys(TMR)- | -Lys(TMR)- | -Lys(TMR) |
Lys(Dnp)- | -Lys(Dnp)- | -Lys(Dnp) |
專肽常做的熒光物質(zhì)的激發(fā)光波長(zhǎng)和發(fā)射光波長(zhǎng)??晒﹨⒖歼x擇:
熒光基團(tuán) | Ex(nm) | Em(nm) | 熒光基團(tuán) | Ex(nm) | Em(nm) |
羥基香豆素 | 325 | 386 | R-phycoerythrin (PE) (489) | 565 | 578 |
丹磺酰氯 | 340 | 578 | Rhodamine Red-X | 560 | 580 |
AMC | 345 | 445 | Tamara | 565 | 580 |
甲氧基香豆素 | 360 | 410 | Alexa fluor 555 | 556 | 573 |
Alexa fluor 系列 | 345 | 442 | Alexa fluor 546 | 556 | 573 |
氨基香豆素 | 350 | 445 | Rox | 575 | 602 |
Dabcyl | 453 | - | Alexa fluor 568 | 578 | 603 |
Cy2 | 490 | 510 | Texas Red | 589 | 615 |
FAM | 495 | 517 | Alexa fluor 594 | 590 | 617 |
Alexa fluor 488 | 494 | 517 | Alexa fluor | 621 | 639 |
FITC | 495 | 519 | Alexa fluor 633 | 650 | 668 |
Alexa fluor 430 | 430 | 545 | Cy5 (625) | 650 | 670 |
5-FAM | 492 | 518 | Alexa fluor 660 | 663 | 690 |
Alexa fluor 532 | 530 | 530 | Cy5.5 | 675 | 694 |
HEX | 535 | 556 | TruRed | 490; 675 | 695 |
5-TAMRA | 542 | 568 | Alexa fluor 680 | 679 | 702 |
Cy3 | 550 | 570 | Cy7 | 743 | 767 |
TRITC | 547 | 572 | Cy3.5 | 581 | 596 |
DOI | 名稱 | |
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10.1248/bpb.b13-00432 | Shuttling protein nucleolin is a microglia receptor for amyloid beta peptide 1-42 | 下載 |