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KR-12對應于LL-37的18-29氨基酸殘基,是LL-37中保留抗菌活性的最小肽。KR12對細菌有選擇性毒性作用,但對人體細胞無選擇性毒性作用。它可以作為開發(fā)新型螞蟻的模板。
編號:192385
CAS號:1218951-51-9
單字母:H2N-KRIVQRIKDFLR-CONH2
編號: | 192385 |
中文名稱: | KR-12 (human), KR-12 amide (human) |
英文名: | LL-37 (18-29), CAMP (18-29), Antibacterial Protein |
CAS號: | 1218951-51-9 |
單字母: | H2N-KRIVQRIKDFLR-CONH2 |
三字母: | H2N N端氨基 -Lys賴氨酸 -Arg精氨酸 -Ile異亮氨酸 -Val纈氨酸 -Gln谷氨酰胺 -Arg精氨酸 -Ile異亮氨酸 -Lys賴氨酸 -Asp天冬氨酸 -Phe苯丙氨酸 -Leu亮氨酸 -Arg精氨酸 -CONH2C端酰胺化 |
氨基酸個數(shù): | 12 |
分子式: | C71H127N25O15 |
平均分子量: | 1570.93 |
精確分子量: | 1569.99 |
等電點(PI): | 12.82 |
pH=7.0時的凈電荷數(shù): | 4.98 |
平均親水性: | 0.73333333333333 |
疏水性值: | -0.71 |
消光系數(shù): | - |
來源: | 人工化學合成,僅限科學研究使用,不得用于人體。 |
鹽體系: | 可選TFA、HAc、HCl或其它 |
儲存條件: | 負80℃至負20℃ |
標簽: | 未分類肽 |
KR-12 corresponds to amino acid residues 18-29 of LL-37 and is the smallest peptide of LL-37 retaining antibacterial activity. KR12 displays a selective toxic effect on bacteria but not on human cells. It may be used as a template for developing novel antimicrobial agents of therapeutic use.
作為抗菌肽中的一種衍生多肽,KR-12 amide (human)具有相同的序列片段,在序列的改造中,C端加入了酰胺鍵,通過對C端的封閉使多肽的生理活性發(fā)生了改變,在一些研究中表明,KR-12 amide (human)一樣具有不錯的抗菌效果,且更具特異性,在生物體內(nèi)的主要作用是,使一些生物過程在無菌干擾的狀態(tài)進行。
DOI | 名稱 | |
---|---|---|
10.1074/jbc.M805533200 | Structures of human host defense cathelicidin LL-37 and its smallest antimicrobial peptide KR-12 in lipid micelles | 下載 |
多肽H2N-Lys-Arg-Ile-Val-Gln-Arg-Ile-Lys-Asp-Phe-Leu-Arg-NH2的合成步驟:
1、合成MBHA樹脂:取若干克的MBHA樹脂(如初始取代度為0.5mmol/g)和1倍樹脂摩爾量的Fmoc-Linker-OH加入到反應器中,加入DMF,攪拌使氨基酸完全溶解。再加入樹脂2倍量的DIEPA,攪拌混合均勻。再加入樹脂0.95倍量的HBTU,攪拌混合均勻。反應3-4小時后,用DMF洗滌3次。用2倍樹脂體積的10%乙酸酐/DMF 進行封端30分鐘。然后再用DMF洗滌3次,甲醇洗滌2次,DCM洗滌2次,再用甲醇洗滌2次。真空干燥12小時以上,得到干燥的樹脂{Fmoc-Linker-MHBA Resin},測定取代度。這里測得取代度為 0.3mmol/g。結構如下圖:
2、脫Fmoc:取2.87g的上述樹脂,用DCM或DMF溶脹20分鐘。用DMF洗滌2遍。加3倍樹脂體積的20%Pip/DMF溶液,鼓氮氣30分鐘,然后2倍樹脂體積的DMF 洗滌5次。得到 H2N-Linker-MBHA Resin 。(此步驟脫除Fmoc基團,茚三酮檢測為藍色,Pip為哌啶)。結構圖如下:
3、縮合:取2.58mmol Fmoc-Arg(Pbf)-OH 氨基酸,加入到上述樹脂里,加適當DMF溶解氨基酸,再依次加入5.17mmol DIPEA,2.45mmol HBTU。反應30分鐘后,取小樣洗滌,茚三酮檢測為無色。用2倍樹脂體積的DMF 洗滌3次樹脂。(洗滌樹脂,去掉殘留溶劑,為下一步反應做準備)。得到Fmoc-Arg(Pbf)-Linker-MBHA Resin。氨基酸:DIPEA:HBTU:樹脂=3:6:2.85:1(摩爾比)。結構圖如下:
4、依次循環(huán)步驟二、步驟三,依次得到
H2N-Arg(Pbf)-Linker-MBHA Resin
Fmoc-Leu-Arg(Pbf)-Linker-MBHA Resin
H2N-Leu-Arg(Pbf)-Linker-MBHA Resin
Fmoc-Phe-Leu-Arg(Pbf)-Linker-MBHA Resin
H2N-Phe-Leu-Arg(Pbf)-Linker-MBHA Resin
Fmoc-Asp(OtBu)-Phe-Leu-Arg(Pbf)-Linker-MBHA Resin
H2N-Asp(OtBu)-Phe-Leu-Arg(Pbf)-Linker-MBHA Resin
Fmoc-Lys(Boc)-Asp(OtBu)-Phe-Leu-Arg(Pbf)-Linker-MBHA Resin
H2N-Lys(Boc)-Asp(OtBu)-Phe-Leu-Arg(Pbf)-Linker-MBHA Resin
Fmoc-Ile-Lys(Boc)-Asp(OtBu)-Phe-Leu-Arg(Pbf)-Linker-MBHA Resin
H2N-Ile-Lys(Boc)-Asp(OtBu)-Phe-Leu-Arg(Pbf)-Linker-MBHA Resin
Fmoc-Arg(Pbf)-Ile-Lys(Boc)-Asp(OtBu)-Phe-Leu-Arg(Pbf)-Linker-MBHA Resin
H2N-Arg(Pbf)-Ile-Lys(Boc)-Asp(OtBu)-Phe-Leu-Arg(Pbf)-Linker-MBHA Resin
Fmoc-Gln(Trt)-Arg(Pbf)-Ile-Lys(Boc)-Asp(OtBu)-Phe-Leu-Arg(Pbf)-Linker-MBHA Resin
H2N-Gln(Trt)-Arg(Pbf)-Ile-Lys(Boc)-Asp(OtBu)-Phe-Leu-Arg(Pbf)-Linker-MBHA Resin
Fmoc-Val-Gln(Trt)-Arg(Pbf)-Ile-Lys(Boc)-Asp(OtBu)-Phe-Leu-Arg(Pbf)-Linker-MBHA Resin
H2N-Val-Gln(Trt)-Arg(Pbf)-Ile-Lys(Boc)-Asp(OtBu)-Phe-Leu-Arg(Pbf)-Linker-MBHA Resin
Fmoc-Ile-Val-Gln(Trt)-Arg(Pbf)-Ile-Lys(Boc)-Asp(OtBu)-Phe-Leu-Arg(Pbf)-Linker-MBHA Resin
H2N-Ile-Val-Gln(Trt)-Arg(Pbf)-Ile-Lys(Boc)-Asp(OtBu)-Phe-Leu-Arg(Pbf)-Linker-MBHA Resin
Fmoc-Arg(Pbf)-Ile-Val-Gln(Trt)-Arg(Pbf)-Ile-Lys(Boc)-Asp(OtBu)-Phe-Leu-Arg(Pbf)-Linker-MBHA Resin
H2N-Arg(Pbf)-Ile-Val-Gln(Trt)-Arg(Pbf)-Ile-Lys(Boc)-Asp(OtBu)-Phe-Leu-Arg(Pbf)-Linker-MBHA Resin
Fmoc-Lys(Boc)-Arg(Pbf)-Ile-Val-Gln(Trt)-Arg(Pbf)-Ile-Lys(Boc)-Asp(OtBu)-Phe-Leu-Arg(Pbf)-Linker-MBHA Resin
以上中間結構,均可在專肽生物多肽計算器-多肽結構計算器中,一鍵畫出。
最后再經(jīng)過步驟二得到 H2N-Lys(Boc)-Arg(Pbf)-Ile-Val-Gln(Trt)-Arg(Pbf)-Ile-Lys(Boc)-Asp(OtBu)-Phe-Leu-Arg(Pbf)-Linker-MBHA Resin,結構如下:
5、切割:6倍樹脂體積的切割液(或每1g樹脂加8ml左右的切割液),搖床搖晃 2小時,過濾掉樹脂,用冰無水乙醚沉淀濾液,并用冰無水乙醚洗滌沉淀物3次,最后將沉淀物放真空干燥釜中,常溫干燥24小試,得到粗品H2N-Lys-Arg-Ile-Val-Gln-Arg-Ile-Lys-Asp-Phe-Leu-Arg-NH2。結構圖見產(chǎn)品結構圖。
切割液選擇:1)TFA:H2O=95%:5%
2)TFA:H2O:TIS=95%:2.5%:2.5%
3)三氟乙酸:茴香硫醚:1,2-乙二硫醇:苯酚:水=87.5%:5%:2.5%:2.5%:2.5%
(前兩種適合沒有容易氧化的氨基酸,例如Trp、Cys、Met。第三種適合幾乎所有的序列。)
6、純化凍干:使用液相色譜純化,收集目標峰液體,進行凍干,獲得蓬松的粉末狀固體多肽。不過這時要取小樣復測下純度 是否目標純度。
7、最后總結:
杭州專肽生物技術有限公司(ALLPEPTIDE http://amynixphotography.com)主營定制多肽合成業(yè)務,提供各類長肽,短肽,環(huán)肽,提供各類修飾肽,如:熒光標記修飾(CY3、CY5、CY5.5、CY7、FAM、FITC、Rhodamine B、TAMRA等),功能基團修飾肽(疊氮、炔基、DBCO、DOTA、NOTA等),同位素標記肽(N15、C13),訂書肽(Stapled Peptide),脂肪酸修飾肽(Pal、Myr、Ste),磷酸化修飾肽(P-Ser、P-Thr、P-Tyr),環(huán)肽(酰胺鍵環(huán)肽、一對或者多對二硫鍵環(huán)),生物素標記肽,PEG修飾肽,甲基化修飾肽等。
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