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人肽基-脯氨酰順式/反式異構(gòu)酶Pin1(kcat / Km = 9300 mM·ss¹)及其酵母同系物Ess1(kcat / Km = 12000 mM·ss¹)的優(yōu)良發(fā)色底物。
編號:122402
CAS號:202739-37-5
單字母:Ac-AA-pSer-PR-pNA
編號: | 122402 |
中文名稱: | 肽基脯氨酰異構(gòu)酶底物:Ac-Ala-Ala-Ser(PO?H?)-Pro-Arg-對硝基苯胺 |
英文名: | Ac-Ala-Ala-Ser(PO?H?)-Pro-Arg-pNA |
CAS號: | 202739-37-5 |
單字母: | Ac-AA-pSer-PR-pNA |
三字母: | Ac N端乙?;舛?/p> -Ala丙氨酸 -Ala丙氨酸 -Ser(PO3H2)磷酸化絲氨酸 -Pro脯氨酸 -Arg精氨酸 -pNA對硝基苯胺 |
氨基酸個數(shù): | 5 |
分子式: | C28H43O12N10P1 |
平均分子量: | 742.67 |
精確分子量: | 742.28 |
等電點(PI): | - |
pH=7.0時的凈電荷數(shù): | 1 |
平均親水性: | 0.575 |
疏水性值: | -0.66 |
消光系數(shù): | - |
來源: | 人工化學(xué)合成,僅限科學(xué)研究使用,不得用于人體。 |
鹽體系: | 可選TFA、HAc、HCl或其它 |
儲存條件: | 負(fù)80℃至負(fù)20℃ |
標(biāo)簽: | pNA修飾肽 磷酸化修飾肽 |
Ac-AApSPR-pNA, excellent chromogenic substrate for the human peptidyl-prolyl cis/trans isomerase Pin1 (kcat/Km = 9300 mM?¹s?¹) and its yeast homolog Ess1 (kcat/Km = 12000 mM?¹s?¹).
磷酸肽
在生命過程中發(fā)揮重要作用,磷酸化的位置在多肽上的Tyr、Ser,Thr,。目前磷酸肽合成一般都采用磷酸化氨基酸,目前使用的都是單芐基磷酸化氨基酸。磷酸化氨基酸的連接一般采用HBTU/HOBt/DIEA方法,但是目前采用該方法合成磷酸化多肽也有缺點,特別是在合成多磷酸化多肽或氨基酸較長的多肽的時候,連接效率低,最后產(chǎn)品純度很低,對于這種磷酸化多肽,我們考慮采用后磷酸化方法,其合成過程就是在多肽合成結(jié)束后,選擇性脫去要標(biāo)記的氨基酸的側(cè)鏈保護基,對于Tyr,Thr可以直接使用側(cè)鏈不保護的氨基酸進行反應(yīng),而Ser可以采用Fmoc-Ser(trt),在1% TFA/DCM條件下可以定量的脫除。
后磷酸化,采用雙芐基亞磷酰胺,四氮唑生成亞磷酰胺四唑活性中間體,連接到羥基上,隨后在過氧酸下氧化生成磷?;瓿煞磻?yīng)。
目前,多肽的磷酸化修飾方法主要有兩種:
(1)將適當(dāng)保護的磷酸化氨基酸直接引入到多肽序列中;
(2)多肽序列在樹脂上合成完后,再對其中的Ser、Tyr或Thr的側(cè)鏈羥基進行磷酸化。
1)將適當(dāng)保護的磷酸化氨基酸直接引入到多肽序列中:
即事先將需要磷酸化的氨基酸(Thr,Ser或Tyr)磷酸化并適當(dāng)保護,然后按照正常SPPS 合成流程將磷酸化單體縮合到多肽指定位點。這種方法操作簡便,已經(jīng)成為多肽單位點 磷酸化修飾的主要方法。
2)多肽序列在樹脂上合成完后,再對其中的Ser、Tyr或Thr的側(cè)鏈羥基進行磷酸化:
采用將磷酸化單體縮合到多肽中的方法進行磷酸化修飾時,磷酸化的氨基酸由于側(cè)鏈修 飾的較大基團產(chǎn)生的位阻而導(dǎo)致難以與肽鏈縮合,并且之后的氨基酸引入都會比較困難, 尤其在含有多個磷酸化位點修飾時,合成將變得異常困難,并且最終產(chǎn)物成分復(fù)雜,難 以分離,產(chǎn)率極低。
因此,當(dāng)肽鏈中多個位點進行磷酸化時,可以考慮采用將多肽序列 在樹脂上合成完后,再對其中的Ser、Tyr或Thr的側(cè)鏈羥基進行磷酸化:其合成過程主要 就是在多肽合成結(jié)束之后,選擇性的脫去要標(biāo)記氨基酸的側(cè)鏈保護基,對于Tyr,Thr可 以直接使用側(cè)鏈不保護的氨基酸進行反應(yīng)。
側(cè)鏈保護基在1%TFA/DCM條件下可以定量的脫 除。采用這種方法時,可以采用雙芐基亞磷酰胺,四氮唑生成亞磷酰胺四唑活性中間體, 連接到羥基上,然后在過氧酸條件下氧化生成磷?;?,完成反應(yīng)。
DOI | 名稱 | |
---|---|---|
10.1021/bi0262395 | Substrate-based design of reversible Pin1 inhibitors | 下載 |
10.1016/j.febslet.2006.04.087 | Comparative analysis of enzyme activities and mRNA levels of peptidyl prolyl cis/trans isomerases in various organs of wild type and Pin1-/- mice | 下載 |
多肽Ac-Ala-Ala-Ser(PO3H2)-Pro-Arg-pNA的合成步驟:
1、合成CTC樹脂:稱取0.17g CTC Resin(如初始取代度約為1.05mmol/g)和0.21mmol Fmoc-Arg(Pbf)-OH于反應(yīng)器中,加入適量DCM溶解氨基酸(需要注意,此時CTC樹脂體積會增大好幾倍,避免DCM溶液過少),再加入0.54mmol DIPEA(Mw:129.1,d:0.740g/ml),反應(yīng)2-3小時后,可不抽濾溶液,直接加入1ml的HPLC級甲醇,封端半小時。依次用DMF洗滌2次,甲醇洗滌1次,DCM洗滌一次,甲醇洗滌一次,DCM洗滌一次,DMF洗滌2次(這里使用甲醇和DCM交替洗滌,是為了更好地去除其他溶質(zhì),有利于后續(xù)反應(yīng))。得到 Fmoc-Arg(Pbf)-CTC Resin。結(jié)構(gòu)圖如下:
2、脫Fmoc:加3倍樹脂體積的20%Pip/DMF溶液,鼓氮氣30分鐘,然后2倍樹脂體積的DMF 洗滌5次。得到 H2N-Arg(Pbf)-CTC Resin 。(此步驟脫除Fmoc基團,茚三酮檢測為藍色,Pip為哌啶)。結(jié)構(gòu)圖如下:
3、縮合:取0.54mmol Fmoc-Pro-OH 氨基酸,加入到上述樹脂里,加適當(dāng)DMF溶解氨基酸,再依次加入1.07mmol DIPEA,0.51mmol HBTU。反應(yīng)30分鐘后,取小樣洗滌,茚三酮檢測為無色。用2倍樹脂體積的DMF 洗滌3次樹脂。(洗滌樹脂,去掉殘留溶劑,為下一步反應(yīng)做準(zhǔn)備)。得到Fmoc-Pro-Arg(Pbf)-CTC Resin。氨基酸:DIPEA:HBTU:樹脂=3:6:2.85:1(摩爾比)。結(jié)構(gòu)圖如下:
4、依次循環(huán)步驟二、步驟三,依次得到
H2N-Pro-Arg(Pbf)-CTC Resin
Fmoc-Ser(HPO3Bzl)-Pro-Arg(Pbf)-CTC Resin
H2N-Ser(HPO3Bzl)-Pro-Arg(Pbf)-CTC Resin
Fmoc-Ala-Ser(HPO3Bzl)-Pro-Arg(Pbf)-CTC Resin
H2N-Ala-Ser(HPO3Bzl)-Pro-Arg(Pbf)-CTC Resin
Fmoc-Ala-Ala-Ser(HPO3Bzl)-Pro-Arg(Pbf)-CTC Resin
以上中間結(jié)構(gòu),均可在專肽生物多肽計算器-多肽結(jié)構(gòu)計算器中,一鍵畫出。
最后再經(jīng)過步驟二得到 H2N-Ala-Ala-Ser(HPO3Bzl)-Pro-Arg(Pbf)-CTC Resin,結(jié)構(gòu)如下:
5、反應(yīng)連接:在上述樹脂中,加入適當(dāng)DMF后,再加入0.54mmol到樹脂中,再加入1.07mmol DIPEA,鼓氮氣反應(yīng)30分鐘。用2倍樹脂體積的DMF 洗滌3次樹脂(洗滌樹脂,去掉殘留溶劑,為下一步反應(yīng)做準(zhǔn)備)。 得到Ac-Ala-Ala-Ser(HPO3Bzl)-Pro-Arg(Pbf)-CTC Resin。 結(jié)構(gòu)如下:
6、全保護切割:配置0.5%TFA/DCM溶液,溶液體積約為樹脂體積的3倍。再次用DCM洗滌樹脂2遍(去除殘留DMF),后將配置好的溶液倒入到反應(yīng)器中,反應(yīng)30分鐘。抽濾樹脂,收集濾液(此時多肽已經(jīng)從樹脂上分離,存在于濾液中)。多肽序列為 Ac-Ala-Ala-Ser(HPO3Bzl)-Pro-Arg(Pbf)-CTC Resin。 在濾液中添加DIEPA,調(diào)PH至7-8。用飽和NaHCO3洗滌濾液,分離出DCM層溶液??蛇m當(dāng)旋蒸DCM層溶液,減少有機溶劑。再次加入1或2倍體積的乙酸乙酯,用稀HCl溶液調(diào)PH至微酸性,將多肽從DCM層萃取到乙酸乙酯層。用飽和NaCl洗滌2次乙酸乙酯層。用無水硫酸鎂吸收乙酸乙酯層的水分。通過減壓旋蒸,直接將乙酸乙酯完全旋蒸掉,得到晶體狀固體多肽,用于下一步C端反應(yīng)。或通過減壓旋蒸保留適量乙酸乙酯的溶液體積,加入冰乙醚析出 多肽,然后對多肽進行烘干操作即可用于下一步C端反應(yīng)。Ac-Ala-Ala-Ser(HPO3Bzl)-Pro-Arg(Pbf)-COOH的結(jié)構(gòu)圖如下。
7、4-硝基苯胺反應(yīng)連接:在上述樹脂中,加入適當(dāng)DMF后,再加入0.54mmol 4-硝基苯胺到樹脂中,再加入1.07mmol DIPEA、0.51mmol HBTU,鼓氮氣反應(yīng)30分鐘。用2倍樹脂體積的DMF 洗滌3次樹脂(洗滌樹脂,去掉殘留溶劑,為下一步反應(yīng)做準(zhǔn)備)。 得到 Ac-Ala-Ala-Ser(HPO3Bzl)-Pro-Arg(Pbf)-pNA。 結(jié)構(gòu)如下:
8、切割:6倍樹脂體積的切割液(或每1g樹脂加8ml左右的切割液),搖床搖晃 2小時,過濾掉樹脂,用冰無水乙醚沉淀濾液,并用冰無水乙醚洗滌沉淀物3次,最后將沉淀物放真空干燥釜中,常溫干燥24小試,得到粗品Ac-Ala-Ala-Ser(PO3H2)-Pro-Arg-pNA。結(jié)構(gòu)圖見產(chǎn)品結(jié)構(gòu)圖。
切割液選擇:1)TFA:H2O=95%:5%、TFA:H2O=97.5%:2.5%
2)TFA:H2O:TIS=95%:2.5%:2.5%
3)三氟乙酸:茴香硫醚:1,2-乙二硫醇:苯酚:水=87.5%:5%:2.5%:2.5%:2.5%
(前兩種適合沒有容易氧化的氨基酸,例如Trp、Cys、Met。第三種適合幾乎所有的序列。)
9、純化凍干:使用液相色譜純化,收集目標(biāo)峰液體,進行凍干,獲得蓬松的粉末狀固體多肽。不過這時要取小樣復(fù)測下純度 是否目標(biāo)純度。
10、最后總結(jié):
杭州專肽生物技術(shù)有限公司(ALLPEPTIDE http://amynixphotography.com)主營定制多肽合成業(yè)務(wù),提供各類長肽,短肽,環(huán)肽,提供各類修飾肽,如:熒光標(biāo)記修飾(CY3、CY5、CY5.5、CY7、FAM、FITC、Rhodamine B、TAMRA等),功能基團修飾肽(疊氮、炔基、DBCO、DOTA、NOTA等),同位素標(biāo)記肽(N15、C13),訂書肽(Stapled Peptide),脂肪酸修飾肽(Pal、Myr、Ste),磷酸化修飾肽(P-Ser、P-Thr、P-Tyr),環(huán)肽(酰胺鍵環(huán)肽、一對或者多對二硫鍵環(huán)),生物素標(biāo)記肽,PEG修飾肽,甲基化修飾肽
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