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多肽產(chǎn)品

67615-71-8,標(biāo)記肽EGR-對硝基苯胺,H2N-Glu-Gly-Arg-pNA,H2N-EGR-pNA,杭州專肽生物的產(chǎn)品

標(biāo)記肽EGR-對硝基苯胺

u-纖溶酶原激活劑(uPA)的敏感底物。 也可被胰蛋白酶和matriptase裂解。

編號:172308

CAS號:67615-71-8

單字母:H2N-EGR-pNA

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  • 編號:172308
    中文名稱:標(biāo)記肽EGR-對硝基苯胺
    英文名:H-Glu-Gly-Arg-pNA
    CAS號:67615-71-8
    單字母:H2N-EGR-pNA
    三字母:H2N

    N端氨基:N-terminal amino group。在肽或多肽鏈中含有游離a-氨基的氨基酸一端。在表示氨基酸序列時,通常將N端放在肽鏈的左邊。

    -Glu

    L-谷氨酸:glutamic acid。系統(tǒng)命名為(2S)-氨基-戊二酸。是編碼氨基酸。符號:E,Glu。D-谷氨酸存在于多種細(xì)菌的細(xì)胞壁和某些細(xì)菌桿菌肽中。

    -Gly

    甘氨酸:glycine。系統(tǒng)命名為 2-氨基乙酸。是編碼氨基酸中沒有旋光性的最簡單的氨基酸,因具有甜味而得名。符號:G,Gly。

    -Arg

    L-精氨酸:arginine。系統(tǒng)命名為(2S)-氨基-5-胍基戊酸。在生理條件下帶正電荷,為編碼氨基酸。是幼小哺乳動物的必需氨基酸。符號:R,Arg。

    -pNA

    對硝基苯胺

    氨基酸個數(shù):3
    分子式:C19H28N8O7
    平均分子量:480.48
    精確分子量:480.21
    等電點(PI):10.56
    pH=7.0時的凈電荷數(shù):0.98
    平均親水性:3
    疏水性值:-2.8
    消光系數(shù):-
    來源:人工化學(xué)合成,僅限科學(xué)研究使用,不得用于人體。
    鹽體系:可選TFA、HAc、HCl或其它
    儲存條件:負(fù)80℃至負(fù)20℃
    標(biāo)簽:pNA修飾肽    三肽   

  • EGR-pNA, a sensitive substrate for the u-plasminogen activator (uPA). Also cleaved by trypsin and matriptase.

  • DOI名稱
    10.1074/jbc.M801970200Potent inhibition and global co-localization implicate the transmembrane Kunitz-type serine protease inhibitor hepatocyte growth factor activator inhibitor-2 in the regulation of epithelial matriptase activity下載
    10.1021/cb200478tBicyclic peptide inhibitor reveals large contact interface with a protease target下載
  • 多肽H2N-Glu-Gly-Arg-pNA的合成步驟:

    1、合成CTC樹脂:稱取1.59g CTC Resin(如初始取代度約為0.87mmol/g)和1.66mmol Fmoc-Arg(Pbf)-OH于反應(yīng)器中,加入適量DCM溶解氨基酸(需要注意,此時CTC樹脂體積會增大好幾倍,避免DCM溶液過少),再加入4.15mmol DIPEA(Mw:129.1,d:0.740g/ml),反應(yīng)2-3小時后,可不抽濾溶液,直接加入1ml的HPLC級甲醇,封端半小時。依次用DMF洗滌2次,甲醇洗滌1次,DCM洗滌一次,甲醇洗滌一次,DCM洗滌一次,DMF洗滌2次(這里使用甲醇和DCM交替洗滌,是為了更好地去除其他溶質(zhì),有利于后續(xù)反應(yīng))。得到  Fmoc-Arg(Pbf)-CTC Resin。結(jié)構(gòu)圖如下:

    2、脫Fmoc:加3倍樹脂體積的20%Pip/DMF溶液,鼓氮氣30分鐘,然后2倍樹脂體積的DMF 洗滌5次。得到 H2N-Arg(Pbf)-CTC Resin 。(此步驟脫除Fmoc基團(tuán),茚三酮檢測為藍(lán)色,Pip為哌啶)。結(jié)構(gòu)圖如下:

    3、縮合:取4.15mmol Fmoc-Gly-OH 氨基酸,加入到上述樹脂里,加適當(dāng)DMF溶解氨基酸,再依次加入8.3mmol DIPEA,3.94mmol HBTU。反應(yīng)30分鐘后,取小樣洗滌,茚三酮檢測為無色。用2倍樹脂體積的DMF 洗滌3次樹脂。(洗滌樹脂,去掉殘留溶劑,為下一步反應(yīng)做準(zhǔn)備)。得到Fmoc-Gly-Arg(Pbf)-CTC Resin。氨基酸:DIPEA:HBTU:樹脂=3:6:2.85:1(摩爾比)。結(jié)構(gòu)圖如下:

    4、依次循環(huán)步驟二、步驟三,依次得到

    H2N-Gly-Arg(Pbf)-CTC Resin

    Fmoc-Glu(OtBu)-Gly-Arg(Pbf)-CTC Resin

    以上中間結(jié)構(gòu),均可在專肽生物多肽計算器-多肽結(jié)構(gòu)計算器中,一鍵畫出。

    最后再經(jīng)過步驟二得到 H2N-Glu(OtBu)-Gly-Arg(Pbf)-CTC Resin,結(jié)構(gòu)如下:

    5、N端臨時Boc保護(hù):加適當(dāng)DMF到樹脂中,再依次加入16.6mmol DIPEA,8.3mmol Boc酸酐溶液,鼓氮氣反應(yīng)30分鐘。取小樣茚三酮檢測為無色。Boc酸酐:DIPEA:樹脂=6:12:1(摩爾比)。用2倍樹脂體積的DMF 洗滌3次樹脂(洗滌樹脂,去掉殘留溶劑,為下一步反應(yīng)做準(zhǔn)備)。 得到 Boc-Glu(OtBu)-Gly-Arg(Pbf)-CTC Resin。結(jié)構(gòu)如下:

    6、全保護(hù)切割:配置0.5%TFA/DCM溶液,溶液體積約為樹脂體積的3倍。再次用DCM洗滌樹脂2遍(去除殘留DMF),后將配置好的溶液倒入到反應(yīng)器中,反應(yīng)30分鐘。抽濾樹脂,收集濾液(此時多肽已經(jīng)從樹脂上分離,存在于濾液中)。多肽序列為 Boc-Glu(OtBu)-Gly-Arg(Pbf)-CTC Resin。 在濾液中添加DIEPA,調(diào)PH至7-8。用飽和NaHCO3洗滌濾液,分離出DCM層溶液。可適當(dāng)旋蒸DCM層溶液,減少有機(jī)溶劑。再次加入1或2倍體積的乙酸乙酯,用稀HCl溶液調(diào)PH至微酸性,將多肽從DCM層萃取到乙酸乙酯層。用飽和NaCl洗滌2次乙酸乙酯層。用無水硫酸鎂吸收乙酸乙酯層的水分。通過減壓旋蒸,直接將乙酸乙酯完全旋蒸掉,得到晶體狀固體多肽,用于下一步C端反應(yīng)?;蛲ㄟ^減壓旋蒸保留適量乙酸乙酯的溶液體積,加入冰乙醚析出 多肽,然后對多肽進(jìn)行烘干操作即可用于下一步C端反應(yīng)。Boc-Glu(OtBu)-Gly-Arg(Pbf)-COOH的結(jié)構(gòu)圖如下。

    7、4-硝基苯胺反應(yīng)連接:在上述樹脂中,加入適當(dāng)DMF后,再加入4.15mmol 4-硝基苯胺到樹脂中,再加入8.3mmol DIPEA、3.94mmol HBTU,鼓氮氣反應(yīng)30分鐘。用2倍樹脂體積的DMF 洗滌3次樹脂(洗滌樹脂,去掉殘留溶劑,為下一步反應(yīng)做準(zhǔn)備)。 得到 Boc-Glu(OtBu)-Gly-Arg(Pbf)-pNA。 結(jié)構(gòu)如下:

    8、切割:6倍樹脂體積的切割液(或每1g樹脂加8ml左右的切割液),搖床搖晃 2小時,過濾掉樹脂,用冰無水乙醚沉淀濾液,并用冰無水乙醚洗滌沉淀物3次,最后將沉淀物放真空干燥釜中,常溫干燥24小試,得到粗品H2N-Glu-Gly-Arg-pNA。結(jié)構(gòu)圖見產(chǎn)品結(jié)構(gòu)圖。

    切割液選擇:1)TFA:H2O=95%:5%

    2)TFA:H2O:TIS=95%:2.5%:2.5%

    3)三氟乙酸:茴香硫醚:1,2-乙二硫醇:苯酚:水=87.5%:5%:2.5%:2.5%:2.5%

    (前兩種適合沒有容易氧化的氨基酸,例如Trp、Cys、Met。第三種適合幾乎所有的序列。)

    9、純化凍干:使用液相色譜純化,收集目標(biāo)峰液體,進(jìn)行凍干,獲得蓬松的粉末狀固體多肽。不過這時要取小樣復(fù)測下純度 是否目標(biāo)純度。

    10、最后總結(jié):

    杭州專肽生物技術(shù)有限公司(ALLPEPTIDE http://amynixphotography.com)主營定制多肽合成業(yè)務(wù),提供各類長肽,短肽,環(huán)肽,提供各類修飾肽,如:熒光標(biāo)記修飾(CY3、CY5、CY5.5、CY7、FAM、FITC、Rhodamine B、TAMRA等),功能基團(tuán)修飾肽(疊氮、炔基、DBCO、DOTA、NOTA等),同位素標(biāo)記肽(N15、C13),訂書肽(Stapled Peptide),脂肪酸修飾肽(Pal、Myr、Ste),磷酸化修飾肽(P-Ser、P-Thr、P-Tyr),環(huán)肽(酰胺鍵環(huán)肽、一對或者多對二硫鍵環(huán)),生物素標(biāo)記肽,PEG修飾肽,甲基化修飾肽等。

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