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caspase-6的發(fā)色底物。
編號:131847
CAS號:189684-54-6
單字母:Ac-VEID-pNA
編號: | 131847 |
中文名稱: | Caspase 6 (Mch2) Substrate 1, chromogenic、Colorimetric Substrate |
英文名: | Caspase 6 (Mch2) Substrate 1, chromogenic、Colorimetric Substrate |
CAS號: | 189684-54-6 |
單字母: | Ac-VEID-pNA |
三字母: | Ac N端乙酰化封端 -Val纈氨酸 -Glu谷氨酸 -Ile異亮氨酸 -Asp天冬氨酸 -pNA對硝基苯胺 |
氨基酸個數(shù): | 4 |
分子式: | C28H40O11N6 |
平均分子量: | 636.65 |
精確分子量: | 636.28 |
等電點(diǎn)(PI): | - |
pH=7.0時的凈電荷數(shù): | -2 |
平均親水性: | 0.675 |
疏水性值: | 0.43 |
消光系數(shù): | - |
來源: | 人工化學(xué)合成,僅限科學(xué)研究使用,不得用于人體。 |
儲存條件: | 負(fù)80℃至負(fù)20℃ |
標(biāo)簽: | pNA修飾肽 |
Ac-VEID-pNA is a chromogenic substrate for caspase-6.
DOI | 名稱 | |
---|---|---|
10.1038/sj.cdd.4400968 | Formation of noncanonical high molecular weight caspase-3 and -6 complexes and activation of caspase-12 during serum starvation induced apoptosis in AKR-2B mouse fibroblasts | 下載 |
10.1007/s11105-012-0450-6 | Biochemical and Bioinformatic Characterization of Type II Metacaspase Protein (TaeMCAII) from Wheat | 下載 |
多肽Ac-Val-Glu-Ile-Asp-pNA的合成步驟:
1、合成CTC樹脂:稱取1.14g CTC Resin(如初始取代度約為0.51mmol/g)和0.7mmol Fmoc-Asp(OtBu)-OH于反應(yīng)器中,加入適量DCM溶解氨基酸(需要注意,此時CTC樹脂體積會增大好幾倍,避免DCM溶液過少),再加入1.74mmol DIPEA(Mw:129.1,d:0.740g/ml),反應(yīng)2-3小時后,可不抽濾溶液,直接加入1ml的HPLC級甲醇,封端半小時。依次用DMF洗滌2次,甲醇洗滌1次,DCM洗滌一次,甲醇洗滌一次,DCM洗滌一次,DMF洗滌2次(這里使用甲醇和DCM交替洗滌,是為了更好地去除其他溶質(zhì),有利于后續(xù)反應(yīng))。得到 Fmoc-Asp(OtBu)-CTC Resin。結(jié)構(gòu)圖如下:
2、脫Fmoc:加3倍樹脂體積的20%Pip/DMF溶液,鼓氮?dú)?0分鐘,然后2倍樹脂體積的DMF 洗滌5次。得到 H2N-Asp(OtBu)-CTC Resin 。(此步驟脫除Fmoc基團(tuán),茚三酮檢測為藍(lán)色,Pip為哌啶)。結(jié)構(gòu)圖如下:
3、縮合:取1.74mmol Fmoc-Ile-OH 氨基酸,加入到上述樹脂里,加適當(dāng)DMF溶解氨基酸,再依次加入3.49mmol DIPEA,1.66mmol HBTU。反應(yīng)30分鐘后,取小樣洗滌,茚三酮檢測為無色。用2倍樹脂體積的DMF 洗滌3次樹脂。(洗滌樹脂,去掉殘留溶劑,為下一步反應(yīng)做準(zhǔn)備)。得到Fmoc-Ile-Asp(OtBu)-CTC Resin。氨基酸:DIPEA:HBTU:樹脂=3:6:2.85:1(摩爾比)。結(jié)構(gòu)圖如下:
4、依次循環(huán)步驟二、步驟三,依次得到
H2N-Ile-Asp(OtBu)-CTC Resin
Fmoc-Glu(OtBu)-Ile-Asp(OtBu)-CTC Resin
H2N-Glu(OtBu)-Ile-Asp(OtBu)-CTC Resin
Fmoc-Val-Glu(OtBu)-Ile-Asp(OtBu)-CTC Resin
以上中間結(jié)構(gòu),均可在專肽生物多肽計算器-多肽結(jié)構(gòu)計算器中,一鍵畫出。
最后再經(jīng)過步驟二得到 H2N-Val-Glu(OtBu)-Ile-Asp(OtBu)-CTC Resin,結(jié)構(gòu)如下:
5、乙酸酐反應(yīng)連接:在上述樹脂中,加入適當(dāng)DMF后,再加入1.74mmol 乙酸酐到樹脂中,再加入3.49mmol DIPEA、1.66mmol HBTU,鼓氮?dú)夥磻?yīng)30分鐘。用2倍樹脂體積的DMF 洗滌3次樹脂(洗滌樹脂,去掉殘留溶劑,為下一步反應(yīng)做準(zhǔn)備)。 得到Ac-Val-Glu(OtBu)-Ile-Asp(OtBu)-CTC Resin。 結(jié)構(gòu)如下:
6、全保護(hù)切割:配置0.5%TFA/DCM溶液,溶液體積約為樹脂體積的3倍。再次用DCM洗滌樹脂2遍(去除殘留DMF),后將配置好的溶液倒入到反應(yīng)器中,反應(yīng)30分鐘。抽濾樹脂,收集濾液(此時多肽已經(jīng)從樹脂上分離,存在于濾液中)。多肽序列為 Ac-Val-Glu(OtBu)-Ile-Asp(OtBu)-CTC Resin。 在濾液中添加DIEPA,調(diào)PH至7-8。用飽和NaHCO3洗滌濾液,分離出DCM層溶液。可適當(dāng)旋蒸DCM層溶液,減少有機(jī)溶劑。再次加入1或2倍體積的乙酸乙酯,用稀HCl溶液調(diào)PH至微酸性,將多肽從DCM層萃取到乙酸乙酯層。用飽和NaCl洗滌2次乙酸乙酯層。用無水硫酸鎂吸收乙酸乙酯層的水分。通過減壓旋蒸,直接將乙酸乙酯完全旋蒸掉,得到晶體狀固體多肽,用于下一步C端反應(yīng)?;蛲ㄟ^減壓旋蒸保留適量乙酸乙酯的溶液體積,加入冰乙醚析出 多肽,然后對多肽進(jìn)行烘干操作即可用于下一步C端反應(yīng)。Ac-Val-Glu(OtBu)-Ile-Asp(OtBu)-COOH的結(jié)構(gòu)圖如下。
7、4-硝基苯胺反應(yīng)連接:在上述樹脂中,加入適當(dāng)DMF后,再加入1.74mmol 4-硝基苯胺到樹脂中,再加入3.49mmol DIPEA、1.66mmol HBTU,鼓氮?dú)夥磻?yīng)30分鐘。用2倍樹脂體積的DMF 洗滌3次樹脂(洗滌樹脂,去掉殘留溶劑,為下一步反應(yīng)做準(zhǔn)備)。 得到 Ac-Val-Glu(OtBu)-Ile-Asp(OtBu)-pNA。 結(jié)構(gòu)如下:
8、切割:6倍樹脂體積的切割液(或每1g樹脂加8ml左右的切割液),搖床搖晃 2小時,過濾掉樹脂,用冰無水乙醚沉淀濾液,并用冰無水乙醚洗滌沉淀物3次,最后將沉淀物放真空干燥釜中,常溫干燥24小試,得到粗品Ac-Val-Glu-Ile-Asp-pNA。結(jié)構(gòu)圖見產(chǎn)品結(jié)構(gòu)圖。
切割液選擇:1)TFA:H2O=95%:5%
2)TFA:H2O:TIS=95%:2.5%:2.5%
3)三氟乙酸:茴香硫醚:1,2-乙二硫醇:苯酚:水=87.5%:5%:2.5%:2.5%:2.5%
(前兩種適合沒有容易氧化的氨基酸,例如Trp、Cys、Met。第三種適合幾乎所有的序列。)
9、純化凍干:使用液相色譜純化,收集目標(biāo)峰液體,進(jìn)行凍干,獲得蓬松的粉末狀固體多肽。不過這時要取小樣復(fù)測下純度 是否目標(biāo)純度。
10、最后總結(jié):
杭州專肽生物技術(shù)有限公司(ALLPEPTIDE http://amynixphotography.com)主營定制多肽合成業(yè)務(wù),提供各類長肽,短肽,環(huán)肽,提供各類修飾肽,如:熒光標(biāo)記修飾(CY3、CY5、CY5.5、CY7、FAM、FITC、Rhodamine B、TAMRA等),功能基團(tuán)修飾肽(疊氮、炔基、DBCO、DOTA、NOTA等),同位素標(biāo)記肽(N15、C13),訂書肽(Stapled Peptide),脂肪酸修飾肽(Pal、Myr、Ste),磷酸化修飾肽(P-Ser、P-Thr、P-Tyr),環(huán)肽(酰胺鍵環(huán)肽、一對或者多對二硫鍵環(huán)),生物素標(biāo)記肽,PEG修飾肽,甲基化修飾肽
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