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專注多肽 服務(wù)科研
法呢基二磷酸法呢基轉(zhuǎn)移酶 (FTase) 的熒光底物。五肽基于 H-Ras 的 C 端區(qū)域,在 N 端連接一個丹?;S捎诎腚装彼崃虼蓟鶊F的法呢基化,丹磺?;鶑臉O性分子環(huán)境變?yōu)榉菢O性分子環(huán)境,這伴隨著熒光增強和丹磺?;鶊F向較低波長發(fā)射最大值的轉(zhuǎn)變。產(chǎn)物的完全轉(zhuǎn)化導(dǎo)致發(fā)射最大波長從 565 nm 降低到 515 nm,同時在 505 nm 處熒光強度增強 13 倍。 Dansyl-GCVLS 可用于在 505 nm 處使用 340 nm 激發(fā)波長(kcat = 0.5 s?¹;Km = 1.4 µM)連續(xù)
編號:111935
CAS號:143744-88-1
單字母:Dansyl-GCVLS-OH
編號: | 111935 |
中文名稱: | 標(biāo)記肽Dansyl-Gly-Cys-Val-Leu-Ser-OH |
英文名: | Dansyl-Gly-Cys-Val-Leu-Ser-OH |
CAS號: | 143744-88-1 |
單字母: | Dansyl-GCVLS-OH |
三字母: | Dansyl N端Dansyl標(biāo)記 -Gly甘氨酸 -Cys半胱氨酸 -Val纈氨酸 -Leu亮氨酸 -Ser絲氨酸 -OHC端羧基 |
氨基酸個數(shù): | 5 |
分子式: | C31H46N5O9S2 |
平均分子量: | 696.86 |
精確分子量: | 696.27 |
等電點(PI): | - |
pH=7.0時的凈電荷數(shù): | 0.97 |
平均親水性: | -1 |
疏水性值: | 1.86 |
消光系數(shù): | - |
來源: | 人工化學(xué)合成,僅限科學(xué)研究使用,不得用于人體。 |
鹽體系: | 可選TFA、HAc、HCl或其它 |
儲存條件: | 負(fù)80℃至負(fù)20℃ |
標(biāo)簽: | Dansyl標(biāo)記肽 |
Fluorogenic substrate for farnesyl diphosphate farnesyltransferase (FTase). The pentapeptide is based on the C-terminal region of H-Ras with a dansyl group attached to the N-terminus. Due to farnesylation of the cysteine thiol group the dansyl group is placed from a polar to a non-polar molecular environment which is accompanied by an enhancement of fluorescence and a shift to a lower wavelength emission maximum of the dansyl group. Complete conversion of the product results in a decrease of the emission maximum wavelength from 565 nm to 515 nm together with a 13-fold enhancement in fluorescence intensity at 505 nm. Dansyl-GCVLS can be used for continuously monitoring FTase activity in the presence of farnesyl diphosphate (FPP) at 505 nm using an excitation wavelength of 340 nm (kcat = 0.5 s?¹; Km = 1.4 µM). It represents a useful tool for screening potential FTase inhibitors. The substrate is highly specific to FTase and is not recognized by geranylgeranyl transferse type I (GGTase I). Concentrations of stock solutions of Dns-GCVLS can be calculated from the extinction coefficient of the dansyl moiety (ε??? = 4250 M?¹cm?¹ in 20 mM Tris-HCl, pH 7.5, 10 mM EDTA).
多肽熒光標(biāo)記由于沒有放射性,實驗操作簡單。因此,目前在生物學(xué)研究中多肽熒光標(biāo)記應(yīng)用非常廣泛,多肽熒光標(biāo)記方法與熒光試劑的結(jié)構(gòu)有關(guān)系,對于有游離羧基的采用的方法與接多肽反應(yīng)相同,也采用HBTU/HOBt/DIEA方法連接。 在N端標(biāo)記FITC的多肽需經(jīng)歷環(huán)化作用來形成熒光素,通常會伴有最后一個氨基酸的去除,但當(dāng)有一個間隔器如氨基己酸,或者是通過非酸性環(huán)境將目的多肽從樹脂上切下來時,這種情況可避免在切割的過程中被TFA切割掉。
人們利用利用熒光標(biāo)記的多肽來檢測目標(biāo)蛋白的活性,并將 其發(fā)展的高通量活性篩選方法應(yīng)用于疾病治療靶點蛋白的藥物篩選和藥物開發(fā)(例如,各種激 酶、磷酸酶、肽酶等)。
專肽生物能夠提供技術(shù)成熟的各種熒光標(biāo)記多肽。
下面是一些常見的多肽修飾熒光物質(zhì)結(jié)構(gòu):
FITC標(biāo)記
FITC(異硫氰酸熒光素)具有比較高的活性,我們公司可以通過兩種方式將FITC標(biāo)記于多肽 上:(1) 將FITC標(biāo)記于賴氨酸(Lys)或被選擇性地脫保護(hù)的鳥氨酸(ornithine)側(cè)鏈氨基 上;(2) 將FITC標(biāo)記于多肽N端氨基。
當(dāng)在N端標(biāo)記時,建議在最后一個氨基和由異硫氰酸酯與氨基反應(yīng)產(chǎn)生的硫脲鍵之間引入 烷基間隔器(alkyl spacer),如氨基己酸(Ahx)。鏈接切割需要酸性環(huán)境,在N端標(biāo)記FITC 的多肽需經(jīng)歷環(huán)化作用來形成熒光素,通常會伴有最后一個氨基酸的去除,但當(dāng)有一個間隔器 如氨基己酸,或者是通過非酸性環(huán)境將目的肽從樹脂上切下來時,這種情況可避免。空間位阻 被認(rèn)為是在熒光染料前使用Ahx的主要原因,而不是為什么FITC不能直接偶聯(lián)在多肽上的原因。
Ahx或b-Ala均可作為間隔器用于FITC標(biāo)記的多肽上。
熒光修飾中文名稱 | N端 | N端帶有l(wèi)inker |
生物素標(biāo)記多肽 | Biotin- | Biotin-Ahx- |
異硫氰酸熒光素 | FITC- | FITC-Ahx- |
5-羧基熒光素 | 5-FAM- | 5-FAM-Ahx- |
丹磺酰熒光素 | Dansyl- | Dansyl-Ahx- |
5-羧基四甲基羅丹明 | TMR- (TAMRA-) | TMR-Ahx- (TAMRA-Ahx-) |
多肽N端 | 多肽序列中間 | N端帶有l(wèi)inker |
生物素標(biāo)記多肽 | Biotin- | 多肽C端 |
Lys(Biotin)- | -Lys(Biotin)-- | -Lys(Biotin) |
Lys(FITC)- | -Lys(FITC)- | -Lys(FITC) |
Lys(5-FAM)- | -Lys(5-FAM)- | -Lys(5-FAM) |
Lys(Dansyl)- | -Lys(Dansyl)- | -Lys(Dansyl) |
Lys(TMR)- | -Lys(TMR)- | -Lys(TMR) |
Lys(Dnp)- | -Lys(Dnp)- | -Lys(Dnp) |
專肽常做的熒光物質(zhì)的激發(fā)光波長和發(fā)射光波長??晒﹨⒖歼x擇:
熒光基團 | Ex(nm) | Em(nm) | 熒光基團 | Ex(nm) | Em(nm) |
羥基香豆素 | 325 | 386 | R-phycoerythrin (PE) (489) | 565 | 578 |
丹磺酰氯 | 340 | 578 | Rhodamine Red-X | 560 | 580 |
AMC | 345 | 445 | Tamara | 565 | 580 |
甲氧基香豆素 | 360 | 410 | Alexa fluor 555 | 556 | 573 |
Alexa fluor 系列 | 345 | 442 | Alexa fluor 546 | 556 | 573 |
氨基香豆素 | 350 | 445 | Rox | 575 | 602 |
Dabcyl | 453 | - | Alexa fluor 568 | 578 | 603 |
Cy2 | 490 | 510 | Texas Red | 589 | 615 |
FAM | 495 | 517 | Alexa fluor 594 | 590 | 617 |
Alexa fluor 488 | 494 | 517 | Alexa fluor | 621 | 639 |
FITC | 495 | 519 | Alexa fluor 633 | 650 | 668 |
Alexa fluor 430 | 430 | 545 | Cy5 (625) | 650 | 670 |
5-FAM | 492 | 518 | Alexa fluor 660 | 663 | 690 |
Alexa fluor 532 | 530 | 530 | Cy5.5 | 675 | 694 |
HEX | 535 | 556 | TruRed | 490; 675 | 695 |
5-TAMRA | 542 | 568 | Alexa fluor 680 | 679 | 702 |
Cy3 | 550 | 570 | Cy7 | 743 | 767 |
TRITC | 547 | 572 | Cy3.5 | 581 | 596 |
DOI | 名稱 | |
---|---|---|
10.1006/abio.1995.1108 | A fluorescence assay for geranylgeranyl transferase type I | 下載 |
10.1021/bi981525v | H-Ras peptide and protein substrates bind protein farnesyltransferase as an ionized thiolate | 下載 |
多肽Dansyl-Gly-Cys-Val-Leu-Ser-COOH的合成步驟:
1、合成CTC樹脂:稱取0.45g CTC Resin(如初始取代度約為1.08mmol/g)和0.58mmol Fmoc-Ser(tBu)-OH于反應(yīng)器中,加入適量DCM溶解氨基酸(需要注意,此時CTC樹脂體積會增大好幾倍,避免DCM溶液過少),再加入1.46mmol DIPEA(Mw:129.1,d:0.740g/ml),反應(yīng)2-3小時后,可不抽濾溶液,直接加入1ml的HPLC級甲醇,封端半小時。依次用DMF洗滌2次,甲醇洗滌1次,DCM洗滌一次,甲醇洗滌一次,DCM洗滌一次,DMF洗滌2次(這里使用甲醇和DCM交替洗滌,是為了更好地去除其他溶質(zhì),有利于后續(xù)反應(yīng))。得到 Fmoc-Ser(tBu)-CTC Resin。結(jié)構(gòu)圖如下:
2、脫Fmoc:加3倍樹脂體積的20%Pip/DMF溶液,鼓氮氣30分鐘,然后2倍樹脂體積的DMF 洗滌5次。得到 H2N-Ser(tBu)-CTC Resin 。(此步驟脫除Fmoc基團,茚三酮檢測為藍(lán)色,Pip為哌啶)。結(jié)構(gòu)圖如下:
3、縮合:取1.46mmol Fmoc-Leu-OH 氨基酸,加入到上述樹脂里,加適當(dāng)DMF溶解氨基酸,再依次加入2.92mmol DIPEA,1.39mmol HBTU。反應(yīng)30分鐘后,取小樣洗滌,茚三酮檢測為無色。用2倍樹脂體積的DMF 洗滌3次樹脂。(洗滌樹脂,去掉殘留溶劑,為下一步反應(yīng)做準(zhǔn)備)。得到Fmoc-Leu-Ser(tBu)-CTC Resin。氨基酸:DIPEA:HBTU:樹脂=3:6:2.85:1(摩爾比)。結(jié)構(gòu)圖如下:
4、依次循環(huán)步驟二、步驟三,依次得到
H2N-Leu-Ser(tBu)-CTC Resin
Fmoc-Val-Leu-Ser(tBu)-CTC Resin
H2N-Val-Leu-Ser(tBu)-CTC Resin
Fmoc-Cys(Trt)-Val-Leu-Ser(tBu)-CTC Resin
H2N-Cys(Trt)-Val-Leu-Ser(tBu)-CTC Resin
Fmoc-Gly-Cys(Trt)-Val-Leu-Ser(tBu)-CTC Resin
以上中間結(jié)構(gòu),均可在專肽生物多肽計算器-多肽結(jié)構(gòu)計算器中,一鍵畫出。
最后再經(jīng)過步驟二得到 H2N-Gly-Cys(Trt)-Val-Leu-Ser(tBu)-CTC Resin,結(jié)構(gòu)如下:
5、丹酰酸 Dansyl反應(yīng)連接:在上述樹脂中,加入適當(dāng)DMF后,再加入1.46mmol 丹酰酸 Dansyl到樹脂中,再加入2.92mmol DIPEA、1.39mmol HBTU,鼓氮氣反應(yīng)30分鐘。用2倍樹脂體積的DMF 洗滌3次樹脂(洗滌樹脂,去掉殘留溶劑,為下一步反應(yīng)做準(zhǔn)備)。 得到Dansyl-Gly-Cys(Trt)-Val-Leu-Ser(tBu)-CTCResin。 結(jié)構(gòu)如下:
6、切割:6倍樹脂體積的切割液(或每1g樹脂加8ml左右的切割液),搖床搖晃 2小時,過濾掉樹脂,用冰無水乙醚沉淀濾液,并用冰無水乙醚洗滌沉淀物3次,最后將沉淀物放真空干燥釜中,常溫干燥24小試,得到粗品Dansyl-Gly-Cys-Val-Leu-Ser-COOH。結(jié)構(gòu)圖見產(chǎn)品結(jié)構(gòu)圖。
切割液選擇:1)TFA:H2O=95%:5%
2)TFA:H2O:TIS=95%:2.5%:2.5%
3)三氟乙酸:茴香硫醚:1,2-乙二硫醇:苯酚:水=87.5%:5%:2.5%:2.5%:2.5%
(前兩種適合沒有容易氧化的氨基酸,例如Trp、Cys、Met。第三種適合幾乎所有的序列。)
6、純化凍干:使用液相色譜純化,收集目標(biāo)峰液體,進(jìn)行凍干,獲得蓬松的粉末狀固體多肽。不過這時要取小樣復(fù)測下純度 是否目標(biāo)純度。
7、最后總結(jié):
杭州專肽生物技術(shù)有限公司(ALLPEPTIDE http://amynixphotography.com)主營定制多肽合成業(yè)務(wù),提供各類長肽,短肽,環(huán)肽,提供各類修飾肽,如:熒光標(biāo)記修飾(CY3、CY5、CY5.5、CY7、FAM、FITC、Rhodamine B、TAMRA等),功能基團修飾肽(疊氮、炔基、DBCO、DOTA、NOTA等),同位素標(biāo)記肽(N15、C13),訂書肽(Stapled Peptide),脂肪酸修飾肽(Pal、Myr、Ste),磷酸化修飾肽(P-Ser、P-Thr、P-Tyr),環(huán)肽(酰胺鍵環(huán)肽、一對或者多對二硫鍵環(huán)),生物素標(biāo)記肽,PEG修飾肽,甲基化修飾肽
以上所有內(nèi)容,為專肽生物原創(chuàng)內(nèi)容,請勿發(fā)布到其他網(wǎng)站上。