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專注多肽 服務(wù)科研
YCWSQYLCY是迄今為止開發(fā)出的最小的擬肽,可以用作下一代藥物的先導(dǎo)化合物。
編號(hào):146230
CAS號(hào):199999-60-5
單字母:H2N-YCWSQYLCY-OH(Disulfide Bridge:C2-C8)
編號(hào): | 146230 |
中文名稱: | TNF-α Antagonist |
英文名: | TNF-α Antagonist |
CAS號(hào): | 199999-60-5 |
單字母: | H2N-YCWSQYLCY-OH(Disulfide Bridge:C2-C8) |
三字母: | H2N-Tyr-Cys-Trp-Ser-Gln-Tyr-Leu-Cys-Tyr-OH(Disulfide Bridge:Cys2-Cys8) |
氨基酸個(gè)數(shù): | 9 |
分子式: | C58H71N11O15S2 |
平均分子量: | 1226.38 |
精確分子量: | 1225.46 |
等電點(diǎn)(PI): | - |
pH=7.0時(shí)的凈電荷數(shù): | 5.91 |
平均親水性: | -1.8777777777778 |
疏水性值: | 0.1 |
消光系數(shù): | 9970 |
來源: | 人工化學(xué)合成,僅限科學(xué)研究使用,不得用于人體。 |
儲(chǔ)存條件: | 負(fù)80℃至負(fù)20℃ |
標(biāo)簽: | 二硫鍵環(huán)肽 |
The TNF-α antagonist WP9QY inhibited TNF-α mediated apoptosis and exhibited an IC?? of 5 µM in the binding assay. YCWSQYLCY is the smallest peptidomimetic developed to date that might be used as a lead compound for the next generation of non-peptidic inhibitors. The name WP9QY arises from the binding to the site observed in the TNF-β/TNF-receptor(I) complex designated WP9 and the introduction of the amino acids Gln and Tyr.
二硫鍵廣泛存在與蛋白結(jié)構(gòu)中,對穩(wěn)定蛋白結(jié)構(gòu)具有非常重要的意義,二硫鍵一般是通過序列中的2個(gè)Cys的巰基,經(jīng)氧化形成。
形成二硫鍵的方法很多:空氣氧化法,DMSO氧化法,過氧化氫氧化法等。
二硫鍵的合成過程, 可以通過Ellman檢測以及HPLC檢測方法對其反應(yīng)進(jìn)程進(jìn)行監(jiān)測。
如果多肽中只含有1對Cys,那二硫鍵的形成是簡單的。多肽經(jīng)固相或液相合成,然后在pH8-9的溶液中進(jìn)行氧化。
當(dāng)需要形成2對或2對以上的二硫鍵時(shí),合成過程則相對復(fù)雜。盡管二硫鍵的形成通常是在合成方案的最后階段完成,但有時(shí)引入預(yù)先形成的二硫化物是有利于連合或延長肽鏈的。通常采用的巰基保護(hù)基有trt, Acm, Mmt, tBu, Bzl, Mob, Tmob等多種基團(tuán)。我們分別列出兩種以2-Cl樹脂和Rink樹脂為載體合成的多肽上多對二硫鍵形成路線:
二硫鍵反應(yīng)條件選擇
二硫鍵即為蛋白質(zhì)或多肽分子中兩個(gè)不同位點(diǎn)Cys的巰基(-SH)被氧化形成的S-S共價(jià)鍵。 一條肽鏈上不同位置的氨基酸之間形成的二硫鍵,可以將肽鏈折疊成特定的空間結(jié)構(gòu)。多肽分 子通常分子量較大,空間結(jié)構(gòu)復(fù)雜,結(jié)構(gòu)中形成二硫鍵時(shí)要求兩個(gè)半胱氨酸在空間距離上接近。 此外,多肽結(jié)構(gòu)中還原態(tài)的巰基化學(xué)性質(zhì)活潑,容易發(fā)生其他的副反應(yīng),而且肽鏈上其他側(cè)鏈 也可能會(huì)發(fā)生一系列修飾,因此,肽鏈進(jìn)行修飾所選取的氧化劑和氧化條件是反應(yīng)的關(guān)鍵因素, 反應(yīng)機(jī)理也比較復(fù)雜,既可能是自由基反應(yīng),也可能是離子反應(yīng)。
反應(yīng)條件有多種選擇,比如空氣氧化,DMSO氧化等溫和的氧化過程,也可以采用H2O2,I2, 汞鹽等激烈的反應(yīng)條件。
空氣氧化法: 空氣氧化法形成二硫鍵是多肽合成中最經(jīng)典的方法,通常是將巰基處于還原態(tài)的多肽溶于水中,在近中性或弱堿性條件下(PH值6.5-10),反應(yīng)24小時(shí)以上。為了降低分子之間二硫鍵形成的可能,該方法通常需要在低濃度條件下進(jìn)行。
碘氧化法:將多肽溶于25%的甲醇水溶液或30%的醋酸水溶液中,逐滴滴加10-15mol/L的碘進(jìn)行氧化,反應(yīng)15-40min。當(dāng)肽鏈中含有對碘比較敏感的Tyr、Trp、Met和His的殘基時(shí),氧化條件要控制的更精確,氧化完后,立即加入維生素C或硫代硫酸鈉除去過量的碘。 當(dāng)序列中有兩對或多對二硫鍵需要成環(huán)時(shí),通常有兩種情況:
自然隨機(jī)成環(huán): 序列中的Cys之間隨機(jī)成環(huán),與一對二硫鍵成環(huán)條件相似;
定點(diǎn)成環(huán): 定點(diǎn)成環(huán)即序列中的Cys按照設(shè)計(jì)要求形成二硫鍵,反應(yīng)過程相對復(fù)雜。在 固相合成多肽之前,需要提前設(shè)計(jì)幾對二硫鍵形成的順序和方法路線,選擇不同的側(cè)鏈 巰基保護(hù)基,利用其性質(zhì)差異,分步氧化形成兩對或多對二硫鍵。 通常采用的巰基保護(hù) 基有trt, Acm, Mmt, tBu, Bzl, Mob, Tmob等多種基團(tuán)。
DOI | 名稱 | |
---|---|---|
10.1002/art.22495 | A tumor necrosis factor receptor loop peptide mimic inhibits bone destruction to the same extent as anti-tumor necrosis factor monoclonal antibody in murine collagen-induced arthritis | 下載 |
10.1111/j.1742-4658.2010.07590.x | Synthetic constrained peptide selectively binds and antagonizes death receptor 5 | 下載 |