N端氨基：N-terminal amino group。在肽或多肽鏈中含有游離a-氨基的氨基酸一端。在表示氨基酸序列時(shí)，通常將N端放在肽鏈的左邊。

L-纈氨酸：valine。系統(tǒng)命名為(2S)-氨基-3-甲基丁酸。是編碼氨基酸。是哺乳動(dòng)物的必需氨基酸。符號(hào)：V，Val。在某些放線菌素如纈霉素中存在 D-纈氨酸。

瓜氨酸：citrulline。系統(tǒng)命名為(2S)-氨基-5-脲基戊酸。首先在西瓜汁中發(fā)現(xiàn)。L-瓜氨酸是動(dòng)物體內(nèi)氨基酸代謝、尿素循環(huán)中的重要中間物。符號(hào)：Cit。

L-脯氨酸：proline。系統(tǒng)命名為吡咯烷-(2S)-羧酸。為亞氨基酸。是編碼氨基酸。在肽鏈中有特殊作用，如易形成順式的肽鍵等。符號(hào)：P，Pro。

丙氨酸：alanine。L-丙氨酸的系統(tǒng)命名為(2S)-氨基丙酸，是編碼氨基酸，也叫L-α-丙氨酸。符號(hào)：A，Ala。D-丙氨酸存在于多種細(xì)菌細(xì)胞壁的糖肽中。β-丙氨酸是維生素泛酸和輔酶A的組分。

聯(lián)苯丙氨酸Bip

鳥氨酸：ornithine。系統(tǒng)命名為(2S)，5-二氨基戊酸。由精氨酸降解脫去尿素而產(chǎn)生，是鳥氨酸循環(huán)的起始物質(zhì)。不直接參與蛋白質(zhì)生物合成。符號(hào)：Orn。

L-組氨酸：histidine。系統(tǒng)命名為(2S)-氨基-3-(4-咪唑基)丙酸。其側(cè)鏈帶有弱堿性的咪唑基，為編碼氨基酸。是幼小哺乳動(dòng)物的必需氨基酸。符號(hào)：H，His。

C端羧基：C-terminal carboxyl group。在肽或多肽鏈中含有游離羧基的氨基酸一端。在表示氨基酸序列時(shí)，通常將C端放在肽鏈的右邊。