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CSKSSDYQC (Disulfide bridge: C1-C9)(CSK)肽可以特異性識別杯狀細胞,由9個氨基酸的組成的二硫鍵環(huán)肽。
編號:223223
CAS號:
單字母:H2N-CSKSSDYQC-OH
編號: | 223223 |
中文名稱: | 靶向肽CSK、CSKSSDYQC (Disulfide bridge: C1-C9) |
單字母: | H2N-CSKSSDYQC-OH |
三字母: | H2N-Cys-Ser-Lys-Ser-Ser-Asp-Tyr-Gln-Cys-COOH |
氨基酸個數(shù): | 9 |
分子式: | C39H61N11O17S2 |
平均分子量: | 1020.1 |
精確分子量: | 1019.37 |
等電點(PI): | 9.55 |
pH=7.0時的凈電荷數(shù): | 2.91 |
平均親水性: | 0.18888888888889 |
疏水性值: | -1.02 |
外觀與性狀: | 粉末狀固體 |
消光系數(shù): | 1490 |
來源: | 人工化學合成,僅限科學研究使用,不得用于人體。 |
儲存條件: | 負80℃至負20℃ |
標簽: | 二硫鍵環(huán)肽 |
CSKSSDYQC (Disulfide bridge: C1-C9)(CSK)肽可以特異性識別杯狀細胞,由9個氨基酸的組成的二硫鍵環(huán)肽。
二硫鍵廣泛存在與蛋白結(jié)構(gòu)中,對穩(wěn)定蛋白結(jié)構(gòu)具有非常重要的意義,二硫鍵一般是通過序列中的2個Cys的巰基,經(jīng)氧化形成。
形成二硫鍵的方法很多:空氣氧化法,DMSO氧化法,過氧化氫氧化法等。
二硫鍵的合成過程, 可以通過Ellman檢測以及HPLC檢測方法對其反應(yīng)進程進行監(jiān)測。
如果多肽中只含有1對Cys,那二硫鍵的形成是簡單的。多肽經(jīng)固相或液相合成,然后在pH8-9的溶液中進行氧化。
當需要形成2對或2對以上的二硫鍵時,合成過程則相對復(fù)雜。盡管二硫鍵的形成通常是在合成方案的最后階段完成,但有時引入預(yù)先形成的二硫化物是有利于連合或延長肽鏈的。通常采用的巰基保護基有trt, Acm, Mmt, tBu, Bzl, Mob, Tmob等多種基團。我們分別列出兩種以2-Cl樹脂和Rink樹脂為載體合成的多肽上多對二硫鍵形成路線:
二硫鍵反應(yīng)條件選擇
二硫鍵即為蛋白質(zhì)或多肽分子中兩個不同位點Cys的巰基(-SH)被氧化形成的S-S共價鍵。 一條肽鏈上不同位置的氨基酸之間形成的二硫鍵,可以將肽鏈折疊成特定的空間結(jié)構(gòu)。多肽分 子通常分子量較大,空間結(jié)構(gòu)復(fù)雜,結(jié)構(gòu)中形成二硫鍵時要求兩個半胱氨酸在空間距離上接近。 此外,多肽結(jié)構(gòu)中還原態(tài)的巰基化學性質(zhì)活潑,容易發(fā)生其他的副反應(yīng),而且肽鏈上其他側(cè)鏈 也可能會發(fā)生一系列修飾,因此,肽鏈進行修飾所選取的氧化劑和氧化條件是反應(yīng)的關(guān)鍵因素, 反應(yīng)機理也比較復(fù)雜,既可能是自由基反應(yīng),也可能是離子反應(yīng)。
反應(yīng)條件有多種選擇,比如空氣氧化,DMSO氧化等溫和的氧化過程,也可以采用H2O2,I2, 汞鹽等激烈的反應(yīng)條件。
空氣氧化法: 空氣氧化法形成二硫鍵是多肽合成中最經(jīng)典的方法,通常是將巰基處于還原態(tài)的多肽溶于水中,在近中性或弱堿性條件下(PH值6.5-10),反應(yīng)24小時以上。為了降低分子之間二硫鍵形成的可能,該方法通常需要在低濃度條件下進行。
碘氧化法:將多肽溶于25%的甲醇水溶液或30%的醋酸水溶液中,逐滴滴加10-15mol/L的碘進行氧化,反應(yīng)15-40min。當肽鏈中含有對碘比較敏感的Tyr、Trp、Met和His的殘基時,氧化條件要控制的更精確,氧化完后,立即加入維生素C或硫代硫酸鈉除去過量的碘。 當序列中有兩對或多對二硫鍵需要成環(huán)時,通常有兩種情況:
自然隨機成環(huán): 序列中的Cys之間隨機成環(huán),與一對二硫鍵成環(huán)條件相似;
定點成環(huán): 定點成環(huán)即序列中的Cys按照設(shè)計要求形成二硫鍵,反應(yīng)過程相對復(fù)雜。在 固相合成多肽之前,需要提前設(shè)計幾對二硫鍵形成的順序和方法路線,選擇不同的側(cè)鏈 巰基保護基,利用其性質(zhì)差異,分步氧化形成兩對或多對二硫鍵。 通常采用的巰基保護 基有trt, Acm, Mmt, tBu, Bzl, Mob, Tmob等多種基團。
多肽H2N-Cys-Ser-Lys-Ser-Ser-Asp-Tyr-Gln-Cys-COOH的合成步驟:
1、合成CTC樹脂:稱取0.35g CTC Resin(如初始取代度約為0.94mmol/g)和0.39mmol Fmoc-Cys(Trt)-OH于反應(yīng)器中,加入適量DCM溶解氨基酸(需要注意,此時CTC樹脂體積會增大好幾倍,避免DCM溶液過少),再加入0.99mmol DIPEA(Mw:129.1,d:0.740g/ml),反應(yīng)2-3小時后,可不抽濾溶液,直接加入1ml的HPLC級甲醇,封端半小時。依次用DMF洗滌2次,甲醇洗滌1次,DCM洗滌一次,甲醇洗滌一次,DCM洗滌一次,DMF洗滌2次(這里使用甲醇和DCM交替洗滌,是為了更好地去除其他溶質(zhì),有利于后續(xù)反應(yīng))。得到 Fmoc-Cys(Trt)-CTC Resin。結(jié)構(gòu)圖如下:
2、脫Fmoc:加3倍樹脂體積的20%Pip/DMF溶液,鼓氮氣30分鐘,然后2倍樹脂體積的DMF 洗滌5次。得到 H2N-Cys(Trt)-CTC Resin 。(此步驟脫除Fmoc基團,茚三酮檢測為藍色,Pip為哌啶)。結(jié)構(gòu)圖如下:
3、縮合:取0.99mmol Fmoc-Gln(Trt)-OH 氨基酸,加入到上述樹脂里,加適當DMF溶解氨基酸,再依次加入1.97mmol DIPEA,0.94mmol HBTU。反應(yīng)30分鐘后,取小樣洗滌,茚三酮檢測為無色。用2倍樹脂體積的DMF 洗滌3次樹脂。(洗滌樹脂,去掉殘留溶劑,為下一步反應(yīng)做準備)。得到Fmoc-Gln(Trt)-Cys(Trt)-CTC Resin。氨基酸:DIPEA:HBTU:樹脂=3:6:2.85:1(摩爾比)。結(jié)構(gòu)圖如下:
4、依次循環(huán)步驟二、步驟三,依次得到
H2N-Gln(Trt)-Cys(Trt)-CTC Resin
Fmoc-Tyr(tBu)-Gln(Trt)-Cys(Trt)-CTC Resin
H2N-Tyr(tBu)-Gln(Trt)-Cys(Trt)-CTC Resin
Fmoc-Asp(OtBu)-Tyr(tBu)-Gln(Trt)-Cys(Trt)-CTC Resin
H2N-Asp(OtBu)-Tyr(tBu)-Gln(Trt)-Cys(Trt)-CTC Resin
Fmoc-Ser(tBu)-Asp(OtBu)-Tyr(tBu)-Gln(Trt)-Cys(Trt)-CTC Resin
H2N-Ser(tBu)-Asp(OtBu)-Tyr(tBu)-Gln(Trt)-Cys(Trt)-CTC Resin
Fmoc-Ser(tBu)-Ser(tBu)-Asp(OtBu)-Tyr(tBu)-Gln(Trt)-Cys(Trt)-CTC Resin
H2N-Ser(tBu)-Ser(tBu)-Asp(OtBu)-Tyr(tBu)-Gln(Trt)-Cys(Trt)-CTC Resin
Fmoc-Lys(Boc)-Ser(tBu)-Ser(tBu)-Asp(OtBu)-Tyr(tBu)-Gln(Trt)-Cys(Trt)-CTC Resin
H2N-Lys(Boc)-Ser(tBu)-Ser(tBu)-Asp(OtBu)-Tyr(tBu)-Gln(Trt)-Cys(Trt)-CTC Resin
Fmoc-Ser(tBu)-Lys(Boc)-Ser(tBu)-Ser(tBu)-Asp(OtBu)-Tyr(tBu)-Gln(Trt)-Cys(Trt)-CTC Resin
H2N-Ser(tBu)-Lys(Boc)-Ser(tBu)-Ser(tBu)-Asp(OtBu)-Tyr(tBu)-Gln(Trt)-Cys(Trt)-CTC Resin
Fmoc-Cys(Trt)-Ser(tBu)-Lys(Boc)-Ser(tBu)-Ser(tBu)-Asp(OtBu)-Tyr(tBu)-Gln(Trt)-Cys(Trt)-CTC Resin
以上中間結(jié)構(gòu),均可在專肽生物多肽計算器-多肽結(jié)構(gòu)計算器中,一鍵畫出。
最后再經(jīng)過步驟二得到 H2N-Cys(Trt)-Ser(tBu)-Lys(Boc)-Ser(tBu)-Ser(tBu)-Asp(OtBu)-Tyr(tBu)-Gln(Trt)-Cys(Trt)-CTC Resin,結(jié)構(gòu)如下:
5、切割:6倍樹脂體積的切割液(或每1g樹脂加8ml左右的切割液),搖床搖晃 2小時,過濾掉樹脂,用冰無水乙醚沉淀濾液,并用冰無水乙醚洗滌沉淀物3次,最后將沉淀物放真空干燥釜中,常溫干燥24小試,得到粗品H2N-Cys-Ser-Lys-Ser-Ser-Asp-Tyr-Gln-Cys-COOH。結(jié)構(gòu)圖見產(chǎn)品結(jié)構(gòu)圖。
切割液選擇:1)TFA:H2O=95%:5%、TFA:H2O=97.5%:2.5%
2)TFA:H2O:TIS=95%:2.5%:2.5%
3)三氟乙酸:茴香硫醚:1,2-乙二硫醇:苯酚:水=87.5%:5%:2.5%:2.5%:2.5%
(前兩種適合沒有容易氧化的氨基酸,例如Trp、Cys、Met。第三種適合幾乎所有的序列。)
6、純化凍干:使用液相色譜純化,收集目標峰液體,進行凍干,獲得蓬松的粉末狀固體多肽。不過這時要取小樣復(fù)測下純度 是否目標純度。
7、最后總結(jié):
杭州專肽生物技術(shù)有限公司(ALLPEPTIDE http://amynixphotography.com)主營定制多肽合成業(yè)務(wù),提供各類長肽,短肽,環(huán)肽,提供各類修飾肽,如:熒光標記修飾(CY3、CY5、CY5.5、CY7、FAM、FITC、Rhodamine B、TAMRA等),功能基團修飾肽(疊氮、炔基、DBCO、DOTA、NOTA等),同位素標記肽(N15、C13),訂書肽(Stapled Peptide),脂肪酸修飾肽(Pal、Myr、Ste),磷酸化修飾肽(P-Ser、P-Thr、P-Tyr),環(huán)肽(酰胺鍵環(huán)肽、一對或者多對二硫鍵環(huán)),生物素標記肽,PEG修飾肽,甲基化修飾肽
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