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多肽產(chǎn)品

Ac-Arg-Ser-Arg-Arg-AMC,Ac-Arg-Ser-Arg-Arg-AMC,Ac-RSRR-AMC,杭州專(zhuān)肽生物的產(chǎn)品

Ac-Arg-Ser-Arg-Arg-AMC

編號(hào):400885

CAS號(hào):

單字母:Ac-RSRR-AMC

糾錯(cuò)
  • 編號(hào):400885
    中文名稱(chēng):Ac-Arg-Ser-Arg-Arg-AMC
    單字母:Ac-RSRR-AMC
    三字母:Ac

    N端乙?;舛?/p>-Arg

    精氨酸

    -Ser

    絲氨酸

    -Arg

    精氨酸

    -Arg

    精氨酸

    -AMC

    7-氨基-4-甲基香豆素

    氨基酸個(gè)數(shù):4
    分子式:C33H52O8N14
    平均分子量:772.85
    精確分子量:772.41
    等電點(diǎn)(PI):-
    pH=7.0時(shí)的凈電荷數(shù):3
    平均親水性:2.325
    疏水性值:-3.58
    消光系數(shù):-
    標(biāo)簽:AMC修飾肽   

  • 多肽熒光標(biāo)記由于沒(méi)有放射性,實(shí)驗(yàn)操作簡(jiǎn)單。因此,目前在生物學(xué)研究中多肽熒光標(biāo)記應(yīng)用非常廣泛,多肽熒光標(biāo)記方法與熒光試劑的結(jié)構(gòu)有關(guān)系,對(duì)于有游離羧基的采用的方法與接多肽反應(yīng)相同,也采用HBTU/HOBt/DIEA方法連接。 在N端標(biāo)記FITC的多肽需經(jīng)歷環(huán)化作用來(lái)形成熒光素,通常會(huì)伴有最后一個(gè)氨基酸的去除,但當(dāng)有一個(gè)間隔器如氨基己酸,或者是通過(guò)非酸性環(huán)境將目的多肽從樹(shù)脂上切下來(lái)時(shí),這種情況可避免在切割的過(guò)程中被TFA切割掉。
            人們利用利用熒光標(biāo)記的多肽來(lái)檢測(cè)目標(biāo)蛋白的活性,并將 其發(fā)展的高通量活性篩選方法應(yīng)用于疾病治療靶點(diǎn)蛋白的藥物篩選和藥物開(kāi)發(fā)(例如,各種激 酶、磷酸酶、肽酶等)。
            專(zhuān)肽生物能夠提供技術(shù)成熟的各種熒光標(biāo)記多肽。
     

     

    下面是一些常見(jiàn)的多肽修飾熒光物質(zhì)結(jié)構(gòu):




    FITC標(biāo)記
     

     

          FITC(異硫氰酸熒光素)具有比較高的活性,我們公司可以通過(guò)兩種方式將FITC標(biāo)記于多肽 上:(1) 將FITC標(biāo)記于賴(lài)氨酸(Lys)或被選擇性地脫保護(hù)的鳥(niǎo)氨酸(ornithine)側(cè)鏈氨基 上;(2) 將FITC標(biāo)記于多肽N端氨基。

     

          當(dāng)在N端標(biāo)記時(shí),建議在最后一個(gè)氨基和由異硫氰酸酯與氨基反應(yīng)產(chǎn)生的硫脲鍵之間引入 烷基間隔器(alkyl spacer),如氨基己酸(Ahx)。鏈接切割需要酸性環(huán)境,在N端標(biāo)記FITC 的多肽需經(jīng)歷環(huán)化作用來(lái)形成熒光素,通常會(huì)伴有最后一個(gè)氨基酸的去除,但當(dāng)有一個(gè)間隔器 如氨基己酸,或者是通過(guò)非酸性環(huán)境將目的肽從樹(shù)脂上切下來(lái)時(shí),這種情況可避免。空間位阻 被認(rèn)為是在熒光染料前使用Ahx的主要原因,而不是為什么FITC不能直接偶聯(lián)在多肽上的原因。

     

          Ahx或b-Ala均可作為間隔器用于FITC標(biāo)記的多肽上。

     

     

     



     

    普通熒光修飾

     

    熒光修飾中文名稱(chēng) N端 N端帶有l(wèi)inker
    生物素標(biāo)記多肽 Biotin- Biotin-Ahx-
    異硫氰酸熒光素 FITC-   FITC-Ahx-  
    5-羧基熒光素 5-FAM- 5-FAM-Ahx- 
    丹磺酰熒光素 Dansyl- Dansyl-Ahx- 
    5-羧基四甲基羅丹明 TMR-  (TAMRA-) TMR-Ahx-  (TAMRA-Ahx-) 

    通過(guò)Lys側(cè)鏈氨基連接的熒光修飾

     

    多肽N端 多肽序列中間 N端帶有l(wèi)inker
    生物素標(biāo)記多肽 Biotin- 多肽C端
    Lys(Biotin)-  -Lys(Biotin)-- -Lys(Biotin) 
    Lys(FITC)- -Lys(FITC)-  -Lys(FITC)
    Lys(5-FAM)- -Lys(5-FAM)- -Lys(5-FAM)
    Lys(Dansyl)-  -Lys(Dansyl)- -Lys(Dansyl)
    Lys(TMR)- -Lys(TMR)-  -Lys(TMR)
    Lys(Dnp)- -Lys(Dnp)-  -Lys(Dnp)



    專(zhuān)肽常做的熒光物質(zhì)的激發(fā)光波長(zhǎng)和發(fā)射光波長(zhǎng)??晒﹨⒖歼x擇:
     

    熒光基團(tuán) Ex(nm) Em(nm) 熒光基團(tuán) Ex(nm) Em(nm)
    羥基香豆素 325 386 R-phycoerythrin (PE) (489) 565 578
    丹磺酰氯 340 578 Rhodamine Red-X 560 580
    AMC 345 445 Tamara 565 580
    甲氧基香豆素 360 410 Alexa fluor 555 556 573
    Alexa fluor 系列 345 442 Alexa fluor 546 556 573
    氨基香豆素 350 445 Rox 575 602
    Dabcyl 453 - Alexa fluor 568 578 603
    Cy2 490 510 Texas Red 589 615
    FAM 495 517 Alexa fluor 594 590 617
    Alexa fluor 488 494 517 Alexa fluor 621 639
    FITC 495 519 Alexa fluor 633 650 668
    Alexa fluor 430 430 545 Cy5 (625) 650 670
    5-FAM 492 518 Alexa fluor 660 663 690
    Alexa fluor 532 530 530 Cy5.5 675 694
    HEX 535 556 TruRed 490; 675 695
    5-TAMRA 542 568 Alexa fluor 680 679 702
    Cy3 550 570 Cy7 743 767
    TRITC 547 572 Cy3.5 581

    596

     

  • 多肽Ac-Arg-Ser-Arg-Arg-AMC的合成步驟:

    1、合成CTC樹(shù)脂:稱(chēng)取2.79g CTC Resin(如初始取代度約為0.67mmol/g)和2.24mmol Fmoc-Arg(Pbf)-OH于反應(yīng)器中,加入適量DCM溶解氨基酸(需要注意,此時(shí)CTC樹(shù)脂體積會(huì)增大好幾倍,避免DCM溶液過(guò)少),再加入5.61mmol DIPEA(Mw:129.1,d:0.740g/ml),反應(yīng)2-3小時(shí)后,可不抽濾溶液,直接加入1ml的HPLC級(jí)甲醇,封端半小時(shí)。依次用DMF洗滌2次,甲醇洗滌1次,DCM洗滌一次,甲醇洗滌一次,DCM洗滌一次,DMF洗滌2次(這里使用甲醇和DCM交替洗滌,是為了更好地去除其他溶質(zhì),有利于后續(xù)反應(yīng))。得到  Fmoc-Arg(Pbf)-CTC Resin。結(jié)構(gòu)圖如下:

    2、脫Fmoc:加3倍樹(shù)脂體積的20%Pip/DMF溶液,鼓氮?dú)?0分鐘,然后2倍樹(shù)脂體積的DMF 洗滌5次。得到 H2N-Arg(Pbf)-CTC Resin 。(此步驟脫除Fmoc基團(tuán),茚三酮檢測(cè)為藍(lán)色,Pip為哌啶)。結(jié)構(gòu)圖如下:

    3、縮合:取5.61mmol Fmoc-Arg(Pbf)-OH 氨基酸,加入到上述樹(shù)脂里,加適當(dāng)DMF溶解氨基酸,再依次加入11.22mmol DIPEA,5.33mmol HBTU。反應(yīng)30分鐘后,取小樣洗滌,茚三酮檢測(cè)為無(wú)色。用2倍樹(shù)脂體積的DMF 洗滌3次樹(shù)脂。(洗滌樹(shù)脂,去掉殘留溶劑,為下一步反應(yīng)做準(zhǔn)備)。得到Fmoc-Arg(Pbf)-Arg(Pbf)-CTC Resin。氨基酸:DIPEA:HBTU:樹(shù)脂=3:6:2.85:1(摩爾比)。結(jié)構(gòu)圖如下:

    4、依次循環(huán)步驟二、步驟三,依次得到

    H2N-Arg(Pbf)-Arg(Pbf)-CTC Resin

    Fmoc-Ser(tBu)-Arg(Pbf)-Arg(Pbf)-CTC Resin

    H2N-Ser(tBu)-Arg(Pbf)-Arg(Pbf)-CTC Resin

    Fmoc-Arg(Pbf)-Ser(tBu)-Arg(Pbf)-Arg(Pbf)-CTC Resin

    以上中間結(jié)構(gòu),均可在專(zhuān)肽生物多肽計(jì)算器-多肽結(jié)構(gòu)計(jì)算器中,一鍵畫(huà)出。

    最后再經(jīng)過(guò)步驟二得到 H2N-Arg(Pbf)-Ser(tBu)-Arg(Pbf)-Arg(Pbf)-CTC Resin,結(jié)構(gòu)如下:

    5、乙酸酐反應(yīng)連接:在上述樹(shù)脂中,加入適當(dāng)DMF后,再加入5.61mmol 乙酸酐到樹(shù)脂中,再加入11.22mmol DIPEA、5.33mmol HBTU,鼓氮?dú)夥磻?yīng)30分鐘。用2倍樹(shù)脂體積的DMF 洗滌3次樹(shù)脂(洗滌樹(shù)脂,去掉殘留溶劑,為下一步反應(yīng)做準(zhǔn)備)。 得到Ac-Arg(Pbf)-Ser(tBu)-Arg(Pbf)-Arg(Pbf)-CTC Resin。 結(jié)構(gòu)如下:

    6、全保護(hù)切割:配置0.5%TFA/DCM溶液,溶液體積約為樹(shù)脂體積的3倍。再次用DCM洗滌樹(shù)脂2遍(去除殘留DMF),后將配置好的溶液倒入到反應(yīng)器中,反應(yīng)30分鐘。抽濾樹(shù)脂,收集濾液(此時(shí)多肽已經(jīng)從樹(shù)脂上分離,存在于濾液中)。多肽序列為 Ac-Arg(Pbf)-Ser(tBu)-Arg(Pbf)-Arg(Pbf)-CTC Resin。 在濾液中添加DIEPA,調(diào)PH至7-8。用飽和NaHCO3洗滌濾液,分離出DCM層溶液。可適當(dāng)旋蒸DCM層溶液,減少有機(jī)溶劑。再次加入1或2倍體積的乙酸乙酯,用稀HCl溶液調(diào)PH至微酸性,將多肽從DCM層萃取到乙酸乙酯層。用飽和NaCl洗滌2次乙酸乙酯層。用無(wú)水硫酸鎂吸收乙酸乙酯層的水分。通過(guò)減壓旋蒸,直接將乙酸乙酯完全旋蒸掉,得到晶體狀固體多肽,用于下一步C端反應(yīng)?;蛲ㄟ^(guò)減壓旋蒸保留適量乙酸乙酯的溶液體積,加入冰乙醚析出 多肽,然后對(duì)多肽進(jìn)行烘干操作即可用于下一步C端反應(yīng)。Ac-Arg(Pbf)-Ser(tBu)-Arg(Pbf)-Arg(Pbf)-COOH的結(jié)構(gòu)圖如下。

    7、7-氨基-4-甲基香豆素反應(yīng)連接:在上述樹(shù)脂中,加入適當(dāng)DMF后,再加入5.61mmol 7-氨基-4-甲基香豆素到樹(shù)脂中,再加入11.22mmol DIPEA、5.33mmol HBTU,鼓氮?dú)夥磻?yīng)30分鐘。用2倍樹(shù)脂體積的DMF 洗滌3次樹(shù)脂(洗滌樹(shù)脂,去掉殘留溶劑,為下一步反應(yīng)做準(zhǔn)備)。 得到 Ac-Arg(Pbf)-Ser(tBu)-Arg(Pbf)-Arg(Pbf)-AMC。 結(jié)構(gòu)如下:

    8、切割:6倍樹(shù)脂體積的切割液(或每1g樹(shù)脂加8ml左右的切割液),搖床搖晃 2小時(shí),過(guò)濾掉樹(shù)脂,用冰無(wú)水乙醚沉淀濾液,并用冰無(wú)水乙醚洗滌沉淀物3次,最后將沉淀物放真空干燥釜中,常溫干燥24小試,得到粗品Ac-Arg-Ser-Arg-Arg-AMC。結(jié)構(gòu)圖見(jiàn)產(chǎn)品結(jié)構(gòu)圖。

    切割液選擇:1)TFA:H2O=95%:5%

    2)TFA:H2O:TIS=95%:2.5%:2.5%

    3)三氟乙酸:茴香硫醚:1,2-乙二硫醇:苯酚:水=87.5%:5%:2.5%:2.5%:2.5%

    (前兩種適合沒(méi)有容易氧化的氨基酸,例如Trp、Cys、Met。第三種適合幾乎所有的序列。)

    9、純化凍干:使用液相色譜純化,收集目標(biāo)峰液體,進(jìn)行凍干,獲得蓬松的粉末狀固體多肽。不過(guò)這時(shí)要取小樣復(fù)測(cè)下純度 是否目標(biāo)純度。

    10、最后總結(jié):

    杭州專(zhuān)肽生物技術(shù)有限公司(ALLPEPTIDE http://amynixphotography.com)主營(yíng)定制多肽合成業(yè)務(wù),提供各類(lèi)長(zhǎng)肽,短肽,環(huán)肽,提供各類(lèi)修飾肽,如:熒光標(biāo)記修飾(CY3、CY5、CY5.5、CY7、FAM、FITC、Rhodamine B、TAMRA等),功能基團(tuán)修飾肽(疊氮、炔基、DBCO、DOTA、NOTA等),同位素標(biāo)記肽(N15、C13),訂書(shū)肽(Stapled Peptide),脂肪酸修飾肽(Pal、Myr、Ste),磷酸化修飾肽(P-Ser、P-Thr、P-Tyr),環(huán)肽(酰胺鍵環(huán)肽、一對(duì)或者多對(duì)二硫鍵環(huán)),生物素標(biāo)記肽,PEG修飾肽,甲基化修飾肽等。

    以上所有內(nèi)容,為專(zhuān)肽生物原創(chuàng)內(nèi)容,請(qǐng)勿發(fā)布到其他網(wǎng)站上。

  • 暫時(shí)沒(méi)有數(shù)據(jù)