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專注多肽 服務(wù)科研
編號(hào): | 407809 |
中文名稱: | Biotin-Ahx-Arg-Gly-Lys-Gly-Asp-Gly-NH2 |
單字母: | Biotinyl-Ahx-RGKGDG-CONH2 |
三字母: | Biotinyl N端生物素標(biāo)記 -Ahx6-氨基己酸(Linker) -Arg精氨酸 -Gly甘氨酸 -Lys賴氨酸 -Gly甘氨酸 -Asp天冬氨酸 -Gly甘氨酸 -CONH2C端酰胺化 |
氨基酸個(gè)數(shù): | 7 |
分子式: | C38H66N14O11S1 |
平均分子量: | 927.08 |
精確分子量: | 926.48 |
等電點(diǎn)(PI): | 11.66 |
pH=7.0時(shí)的凈電荷數(shù): | 1 |
平均親水性: | 3 |
疏水性值: | -2.18 |
消光系數(shù): | - |
標(biāo)簽: | 生物素標(biāo)記肽(Biotinyl) 氨基酸衍生物肽 |
專肽生物合成用于蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用研究的生物素化肽。盡管生物素可以在 N 端或 C 端引入(通過賴氨酸殘基),但我們建議使用 N 端修飾,因?yàn)樗杀镜?、成功率高、周轉(zhuǎn)時(shí)間短且易于操作。因?yàn)槎嚯暮铣墒菑?C 端到 N 端合成的,因此,N 端修飾是 SPPS步驟的最后一步,不需要額外的特定縮合步驟。相比之下,C 端修飾需要額外的步驟,并且通常更復(fù)雜。當(dāng)然,原則上生物素可以定位在任何地方。
生物素可以通過多種不同的接頭或間隔物與肽分離。盡管如此,還是建議包含一個(gè)靈活的間隔物,例如 Ahx(一個(gè) 6 碳接頭),以使生物素標(biāo)簽更加穩(wěn)定或靈活。
專肽生物在 N 端或 C 端提供生物素化:生物素-N 端、賴氨酸-生物素-肽中間和賴氨酸-生物素-C 端。
專肽生物還可以使用 Ahx 接頭或長(zhǎng)碳 (LC) 接頭提供生物素化:生物素-Ahx-N 末端、Lys-Ahx-生物素-肽中間、Lys-Ahx-生物素-C-末端。
(生物素結(jié)構(gòu))
示例:
GRGDS在N端和C端標(biāo)記生物素的結(jié)構(gòu)展示。
1、GRGDS在N端標(biāo)記生物素,不增加Ahx 接頭
2、GRGDS在N端標(biāo)記生物素,增加一個(gè)Ahx 接頭
3、GRGDS在C端標(biāo)記生物素,不增加Ahx 接頭
4、GRGDS在C端標(biāo)記生物素,增加一個(gè)Ahx 接頭。
多肽Biotin-Ahx-Arg-Gly-Lys-Gly-Asp-Gly-NH2的合成步驟:
1、合成MBHA樹脂:取若干克MBHA樹脂(如初始取代度為0.5mmol/g)和1倍樹脂摩爾量的Fmoc-Linker-OH加入到反應(yīng)器中,加入DMF,攪拌使氨基酸完全溶解。再加入樹脂2倍量的DIEPA,攪拌混合均勻。再加入樹脂0.95倍量的HBTU,攪拌混合均勻。反應(yīng)3-4小時(shí)后,用DMF洗滌3次。用2倍樹脂體積的10%乙酸酐/DMF 進(jìn)行封端30分鐘。然后再用DMF洗滌3次,甲醇洗滌2次,DCM洗滌2次,再用甲醇洗滌2次。真空干燥12小時(shí)以上,得到干燥的樹脂{Fmoc-Linker-MHBA Resin},測(cè)定取代度。這里測(cè)得取代度為 0.3mmol/g。結(jié)構(gòu)如下圖:
2、脫Fmoc:取1.76g的上述樹脂,用DCM或DMF溶脹20分鐘。用DMF洗滌2遍。加3倍樹脂體積的20%Pip/DMF溶液,鼓氮?dú)?0分鐘,然后2倍樹脂體積的DMF 洗滌5次。得到 H2N-Linker-MBHA Resin 。(此步驟脫除Fmoc基團(tuán),茚三酮檢測(cè)為藍(lán)色,Pip為哌啶)。結(jié)構(gòu)圖如下:
3、縮合:取1.58mmol Fmoc-Gly-OH 氨基酸,加入到上述樹脂里,加適當(dāng)DMF溶解氨基酸,再依次加入3.17mmol DIPEA,1.5mmol HBTU。反應(yīng)30分鐘后,取小樣洗滌,茚三酮檢測(cè)為無(wú)色。用2倍樹脂體積的DMF 洗滌3次樹脂。(洗滌樹脂,去掉殘留溶劑,為下一步反應(yīng)做準(zhǔn)備)。得到Fmoc-Gly-Linker-MBHA Resin。氨基酸:DIPEA:HBTU:樹脂=3:6:2.85:1(摩爾比)。結(jié)構(gòu)圖如下:
4、依次循環(huán)步驟二、步驟三,依次得到
H2N-Gly-Linker-MBHA Resin
Fmoc-Asp(OtBu)-Gly-Linker-MBHA Resin
H2N-Asp(OtBu)-Gly-Linker-MBHA Resin
Fmoc-Gly-Asp(OtBu)-Gly-Linker-MBHA Resin
H2N-Gly-Asp(OtBu)-Gly-Linker-MBHA Resin
Fmoc-Lys(Boc)-Gly-Asp(OtBu)-Gly-Linker-MBHA Resin
H2N-Lys(Boc)-Gly-Asp(OtBu)-Gly-Linker-MBHA Resin
Fmoc-Gly-Lys(Boc)-Gly-Asp(OtBu)-Gly-Linker-MBHA Resin
H2N-Gly-Lys(Boc)-Gly-Asp(OtBu)-Gly-Linker-MBHA Resin
Fmoc-Arg(Pbf)-Gly-Lys(Boc)-Gly-Asp(OtBu)-Gly-Linker-MBHA Resin
H2N-Arg(Pbf)-Gly-Lys(Boc)-Gly-Asp(OtBu)-Gly-Linker-MBHA Resin
Fmoc-Ahx-Arg(Pbf)-Gly-Lys(Boc)-Gly-Asp(OtBu)-Gly-Linker-MBHA Resin
以上中間結(jié)構(gòu),均可在專肽生物多肽計(jì)算器-多肽結(jié)構(gòu)計(jì)算器中,一鍵畫出。
最后再經(jīng)過步驟二得到 H2N-Ahx-Arg(Pbf)-Gly-Lys(Boc)-Gly-Asp(OtBu)-Gly-Linker-MBHA Resin,結(jié)構(gòu)如下:
5、生物素反應(yīng)連接:在上述樹脂中,加入適當(dāng)DMF后,再加入1.58mmol 生物素到樹脂中,再加入3.17mmol DIPEA、1.5mmol HBTU,鼓氮?dú)夥磻?yīng)30分鐘。用2倍樹脂體積的DMF 洗滌3次樹脂(洗滌樹脂,去掉殘留溶劑,為下一步反應(yīng)做準(zhǔn)備)。 得到Biotin-Ahx-Arg(Pbf)-Gly-Lys(Boc)-Gly-Asp(OtBu)-Gly-Linker-MBHAResin。 結(jié)構(gòu)如下:
5、切割:6倍樹脂體積的切割液(或每1g樹脂加8ml左右的切割液),搖床搖晃 2小時(shí),過濾掉樹脂,用冰無(wú)水乙醚沉淀濾液,并用冰無(wú)水乙醚洗滌沉淀物3次,最后將沉淀物放真空干燥釜中,常溫干燥24小試,得到粗品Biotin-Ahx-Arg-Gly-Lys-Gly-Asp-Gly-NH2。結(jié)構(gòu)圖見產(chǎn)品結(jié)構(gòu)圖。
切割液選擇:1)TFA:H2O=95%:5%
2)TFA:H2O:TIS=95%:2.5%:2.5%
3)三氟乙酸:茴香硫醚:1,2-乙二硫醇:苯酚:水=87.5%:5%:2.5%:2.5%:2.5%
(前兩種適合沒有容易氧化的氨基酸,例如Trp、Cys、Met。第三種適合幾乎所有的序列。)
6、純化凍干:使用液相色譜純化,收集目標(biāo)峰液體,進(jìn)行凍干,獲得蓬松的粉末狀固體多肽。不過這時(shí)要取小樣復(fù)測(cè)下純度 是否目標(biāo)純度。
7、最后總結(jié):
杭州專肽生物技術(shù)有限公司(ALLPEPTIDE http://amynixphotography.com)主營(yíng)定制多肽合成業(yè)務(wù),提供各類長(zhǎng)肽,短肽,環(huán)肽,提供各類修飾肽,如:熒光標(biāo)記修飾(CY3、CY5、CY5.5、CY7、FAM、FITC、Rhodamine B、TAMRA等),功能基團(tuán)修飾肽(疊氮、炔基、DBCO、DOTA、NOTA等),同位素標(biāo)記肽(N15、C13),訂書肽(Stapled Peptide),脂肪酸修飾肽(Pal、Myr、Ste),磷酸化修飾肽(P-Ser、P-Thr、P-Tyr),環(huán)肽(酰胺鍵環(huán)肽、一對(duì)或者多對(duì)二硫鍵環(huán)),生物素標(biāo)記肽,PEG修飾肽,甲基化修飾肽
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