N端氨基：N-terminal amino group。在肽或多肽鏈中含有游離a-氨基的氨基酸一端。在表示氨基酸序列時(shí)，通常將N端放在肽鏈的左邊。

半胱氨酸：cysteine。L-半胱氨酸的系統(tǒng)命名為(2R)-氨基-3-巰基丙酸，是編碼氨基酸。符號(hào)：C，Cys。D-半胱氨酸存在于螢火蟲的螢光素酶中。

L-甲硫氨酸：methionine又稱“蛋氨酸”。系統(tǒng)命名為(2S)-氨基-4-甲硫基丁酸。是編碼氨基酸。是哺乳動(dòng)物的必需氨基酸。符號(hào)：M，Met。

鳥氨酸：ornithine。系統(tǒng)命名為(2S)，5-二氨基戊酸。由精氨酸降解脫去尿素而產(chǎn)生，是鳥氨酸循環(huán)的起始物質(zhì)。不直接參與蛋白質(zhì)生物合成。符號(hào)：Orn。

甘氨酸：glycine。系統(tǒng)命名為 2-氨基乙酸。是編碼氨基酸中沒有旋光性的最簡單的氨基酸，因具有甜味而得名。符號(hào)：G，Gly。

半胱氨酸：cysteine。L-半胱氨酸的系統(tǒng)命名為(2R)-氨基-3-巰基丙酸，是編碼氨基酸。符號(hào)：C，Cys。D-半胱氨酸存在于螢火蟲的螢光素酶中。

L-甲硫氨酸：methionine又稱“蛋氨酸”。系統(tǒng)命名為(2S)-氨基-4-甲硫基丁酸。是編碼氨基酸。是哺乳動(dòng)物的必需氨基酸。符號(hào)：M，Met。

L-谷氨酸：glutamic acid。系統(tǒng)命名為(2S)-氨基-戊二酸。是編碼氨基酸。符號(hào)：E，Glu。D-谷氨酸存在于多種細(xì)菌的細(xì)胞壁和某些細(xì)菌桿菌肽中。

L-纈氨酸：valine。系統(tǒng)命名為(2S)-氨基-3-甲基丁酸。是編碼氨基酸。是哺乳動(dòng)物的必需氨基酸。符號(hào)：V，Val。在某些放線菌素如纈霉素中存在 D-纈氨酸。

甘氨酸：glycine。系統(tǒng)命名為 2-氨基乙酸。是編碼氨基酸中沒有旋光性的最簡單的氨基酸，因具有甜味而得名。符號(hào)：G，Gly。

L-色氨酸：tryptophan[e]。系統(tǒng)命名為(2S)-氨基-3-(3-吲哚基)丙酸。是編碼氨基酸，哺乳動(dòng)物的必需氨基酸。符號(hào)：W，Trp。某些抗菌素中含有 D-色氨酸。

L-酪氨酸：tyrosine。系統(tǒng)命名為(2S)-氨基-3-(4-羥基苯基)丙酸。是編碼氨基酸。符號(hào)：Y，Tyr。

L-精氨酸：arginine。系統(tǒng)命名為(2S)-氨基-5-胍基戊酸。在生理?xiàng)l件下帶正電荷，為編碼氨基酸。是幼小哺乳動(dòng)物的必需氨基酸。符號(hào)：R，Arg。

L-絲氨酸：serine。系統(tǒng)命名為(2S)-氨基-3-羥基丙酸。是編碼氨基酸。因可從蠶絲中獲得而得名。符號(hào)：S，Ser。在絲原蛋白及某些抗菌素中含有 D-絲氨酸。

L-脯氨酸：proline。系統(tǒng)命名為吡咯烷-(2S)-羧酸。為亞氨基酸。是編碼氨基酸。在肽鏈中有特殊作用，如易形成順式的肽鍵等。符號(hào)：P，Pro。

L-苯丙氨酸：phenylalanine。系統(tǒng)命名為(2S)-氨基-3-苯基丙酸。是編碼氨基酸。是哺乳動(dòng)物的必需氨基酸。符號(hào)：F，Phe。

L-絲氨酸：serine。系統(tǒng)命名為(2S)-氨基-3-羥基丙酸。是編碼氨基酸。因可從蠶絲中獲得而得名。符號(hào)：S，Ser。在絲原蛋白及某些抗菌素中含有 D-絲氨酸。

L-精氨酸：arginine。系統(tǒng)命名為(2S)-氨基-5-胍基戊酸。在生理?xiàng)l件下帶正電荷，為編碼氨基酸。是幼小哺乳動(dòng)物的必需氨基酸。符號(hào)：R，Arg。

L-纈氨酸：valine。系統(tǒng)命名為(2S)-氨基-3-甲基丁酸。是編碼氨基酸。是哺乳動(dòng)物的必需氨基酸。符號(hào)：V，Val。在某些放線菌素如纈霉素中存在 D-纈氨酸。

L-纈氨酸：valine。系統(tǒng)命名為(2S)-氨基-3-甲基丁酸。是編碼氨基酸。是哺乳動(dòng)物的必需氨基酸。符號(hào)：V，Val。在某些放線菌素如纈霉素中存在 D-纈氨酸。

L-組氨酸：histidine。系統(tǒng)命名為(2S)-氨基-3-(4-咪唑基)丙酸。其側(cè)鏈帶有弱堿性的咪唑基，為編碼氨基酸。是幼小哺乳動(dòng)物的必需氨基酸。符號(hào)：H，His。

L-亮氨酸：leucine。系統(tǒng)命名為(2S)-氨基-4-甲基戊酸。是編碼氨基酸。是哺乳動(dòng)物的必需氨基酸。符號(hào)：L，Leu。

L-酪氨酸：tyrosine。系統(tǒng)命名為(2S)-氨基-3-(4-羥基苯基)丙酸。是編碼氨基酸。符號(hào)：Y，Tyr。

L-精氨酸：arginine。系統(tǒng)命名為(2S)-氨基-5-胍基戊酸。在生理?xiàng)l件下帶正電荷，為編碼氨基酸。是幼小哺乳動(dòng)物的必需氨基酸。符號(hào)：R，Arg。

天冬酰胺：asparagine。L-天冬酰胺的系統(tǒng)命名為(2S)-氨基-3-氨酰基丙酸，是編碼氨基酸。符號(hào)：N，Asn。D-天冬酰胺存在于短桿菌肽A分子中。

甘氨酸：glycine。系統(tǒng)命名為 2-氨基乙酸。是編碼氨基酸中沒有旋光性的最簡單的氨基酸，因具有甜味而得名。符號(hào)：G，Gly。

L-賴氨酸：lysine。系統(tǒng)命名為(2S)-6-二氨基已酸。是編碼氨基酸中的堿性氨基酸，哺乳動(dòng)物的必需氨基酸。在蛋白質(zhì)中的賴氨酸可以被修飾為多種形式的衍生物。符號(hào)：K，Lys。

C端羧基：C-terminal carboxyl group。在肽或多肽鏈中含有游離羧基的氨基酸一端。在表示氨基酸序列時(shí)，通常將C端放在肽鏈的右邊。