400-998-5282
專(zhuān)注多肽 服務(wù)科研
編號(hào):434523
CAS號(hào):
單字母:Ac-KTKQLR-AMC
編號(hào): | 434523 |
中文名稱(chēng): | Proprotein Convertase Substrate, PC4, Mca - labele |
英文名: | Proprotein Convertase Substrate, PC4, Mca - labele |
單字母: | Ac-KTKQLR-AMC |
三字母: | Ac N端乙?;舛?/p> -Lys賴(lài)氨酸 -Thr蘇氨酸 -Lys賴(lài)氨酸 -Gln谷氨酰胺 -Leu亮氨酸 -Arg精氨酸 -AMC7-氨基-4-甲基香豆素 |
氨基酸個(gè)數(shù): | 6 |
分子式: | C45H73O11N13 |
平均分子量: | 972.14 |
精確分子量: | 971.56 |
等電點(diǎn)(PI): | - |
pH=7.0時(shí)的凈電荷數(shù): | 3 |
平均親水性: | 1.1666666666667 |
疏水性值: | -2.12 |
消光系數(shù): | - |
標(biāo)簽: | 酶底物肽(Substrate Peptide) AMC修飾肽 |
Caspase酶對(duì)應(yīng)的底物,Caspases(半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶,半胱氨酸依賴(lài)性天冬氨酸定向蛋白酶)是一類(lèi)蛋白酶家族,其功能與凋亡(程序性細(xì)胞死亡),壞死和發(fā)燒(炎癥)的過(guò)程密切相關(guān)。
什么是胱天蛋白酶?
胱天蛋白酶(Caspases)是含半胱氨酸的天冬氨酸蛋白水解酶,它們是為細(xì)胞凋亡的主要介質(zhì)。多種受體,例如TNF-α 受體,F(xiàn)asL受體,TLR和死亡受體,以及Bcl-2和凋亡抑制劑(IAP)蛋白家族參與并調(diào)節(jié)該caspase依賴(lài)性凋亡途徑。一旦Caspase受到上游信號(hào)(外部或內(nèi)在)刺激被激活,即會(huì)參與執(zhí)行下游蛋白底物的水解作用,并觸發(fā)一系列事件,導(dǎo)致細(xì)胞分解,死亡,吞噬作用和細(xì)胞碎片的清除。
人Caspases酶
人的Caspases家族基于序列相似性和生物學(xué)功能等共性主要可分為三大類(lèi):第一類(lèi)由具有長(zhǎng)胱天蛋白酶募集結(jié)構(gòu)域的“炎癥”胱天蛋白酶組成,他們對(duì)P4位上的較大的芳香族或疏水性殘基具有親和力。第二類(lèi)由具有短的前體結(jié)構(gòu)域的“細(xì)胞凋亡效應(yīng)”胱天蛋白酶組成,而第三類(lèi)由具有長(zhǎng)的前提結(jié)構(gòu)域的Pap位置具有亮氨酸或纈氨酸底物親和力的“凋亡引發(fā)劑”胱天蛋白酶組成(表1)。
表1. 人胱天蛋白酶的功能分類(lèi):
細(xì)胞死亡途徑 | 半胱天冬酶類(lèi)型 | 酵素 | 物種 |
細(xì)胞凋亡 | 啟動(dòng)器 | Caspases 2 | 人與鼠 |
細(xì)胞凋亡 | 啟動(dòng)器 | Caspases 8 | 人與鼠 |
細(xì)胞凋亡 | 啟動(dòng)器 | Caspases 9 | 人與鼠 |
細(xì)胞凋亡 | 啟動(dòng)器 | Caspases 10 | 人的 |
細(xì)胞凋亡 | 效應(yīng)器 | Caspases 3 | 人與鼠 |
細(xì)胞凋亡 | 效應(yīng)器 | Caspases 6 | 人與鼠 |
細(xì)胞凋亡 | 效應(yīng)器 | Caspases 6 | 人與鼠 |
細(xì)胞焦亡 | 炎性的 | Caspases 1 | 人與鼠 |
細(xì)胞焦亡 | 炎性的 | Caspases 4 | 人的 |
細(xì)胞焦亡 | 炎性的 | Caspases 5 | 人的 |
啟動(dòng)器Caspase和效應(yīng)器Caspase酶
根據(jù)其在凋亡胱天蛋白酶途徑中的作用,胱天蛋白酶可分為兩類(lèi):?jiǎn)?dòng)器和效應(yīng)器Caspase酶。啟動(dòng)器和效應(yīng)器Caspas酶都具有由小亞基和大亞基組成的催化位點(diǎn),Caspase酶的識(shí)別位
凋亡啟動(dòng)器Caspase酶,例如caspase-2,-8,-9和-10可以啟動(dòng)caspase激活級(jí)聯(lián)反應(yīng)。Caspase-8對(duì)于形成死亡誘導(dǎo)信號(hào)復(fù)合物(DISC)是必不可少的,并且在激活后,Caspase-8激活下游效應(yīng)子Caspase(例如Caspase 3)并介導(dǎo)線(xiàn)粒體中細(xì)胞色素c的釋放。Caspase-8已被證明對(duì)IETD肽序列具有相對(duì)較高的底物選擇性。凋亡效應(yīng)胱天蛋白酶例如Caspase-3,-6和-7雖然不負(fù)責(zé)啟動(dòng)級(jí)聯(lián)途徑,但是當(dāng)被激活時(shí),它們?cè)诩?jí)聯(lián)的中間和后續(xù)步驟中起著不可或缺的作用。Caspase-3(CPP32 / apopain)是關(guān)鍵效應(yīng)器,因?yàn)樗糯罅藖?lái)自啟動(dòng)器Caspase的信號(hào),使用對(duì)Caspase-3有選擇性的DEVD肽序列對(duì)活化的Caspase-3進(jìn)行檢測(cè),可以檢測(cè)Caspase-3的活性。
Caspase酶底物和抑制劑
Caspase底物和抑制劑由兩個(gè)關(guān)鍵成分組成:Caspase識(shí)別序列和信號(hào)產(chǎn)生或蛋白酶抑制基序。不同Caspase識(shí)別序列不同,一般由三個(gè)或四個(gè)氨基酸組成(表2)。Caspase酶識(shí)別序列的N端通常有乙?;ˋc)或碳苯甲氧基(Z)基團(tuán)修飾,以增強(qiáng)膜的通透性。對(duì)應(yīng)的Caspase識(shí)別特定的肽序列為其酶促反應(yīng)切割位點(diǎn),釋放產(chǎn)生信號(hào)或抑制信號(hào)的基序。Caspase的顯色和熒光底物均以相似的方式起作用,其中底物的信號(hào)或顏色強(qiáng)度與蛋白水解活性成正比。
表2. Caspase的底物及其序列
多肽 | 氨基酸序列 | 對(duì)應(yīng)的Caspase的種類(lèi) |
IETD | Ile-Glu-Thr-Asp | Caspase 8,顆粒酶B |
DEVD | Asp-Glu-Val-Asp | Caspase 3、6、7、8或10 |
LEHD | Leu-Glu-His-Asp | Caspase 9 |
VAD | Val-Ala-Asp | Caspase 1、2、3、6、8、9或10 |
Caspase酶的顯色底物
Caspase的顯色底物是有Caspase識(shí)別序列及生色基團(tuán)組成,常見(jiàn)的生色團(tuán)有pNA(對(duì)硝基苯胺或4-硝基苯胺),可使用酶標(biāo)儀或分光光度計(jì)在405 nm處進(jìn)行光密度檢測(cè)。
表3. Caspase的顯色底物
底物 | Caspase | 吸收(nm) | 顏色 |
Ac-DEVD-pNA * CAS 189950-66-1 * | 半胱天冬酶3 | 405 nm | 黃色 |
Z-DEVD-pNA | 半胱天冬酶3 | 405 nm | 黃色 |
Z-IETD-pNA * CAS 219138-21-3 * | 半胱天冬酶8,顆粒酶B | 405 nm | 黃色 |
Caspase的熒光底物
Caspase的熒光底物的結(jié)構(gòu)包含與半胱天冬酶識(shí)別相關(guān)的熒光團(tuán),例如7-氨基-4-甲基香豆素(AMC),7-氨基-4-三氟甲基香豆素(AFC), Rhodamine 110(R110)或ProRed™620。R110的Caspase底物比基于香豆素的Caspase底物(例如AMC和AFC)更敏感,但由于兩步裂解過(guò)程,其動(dòng)態(tài)范圍更窄。 建議將R110標(biāo)記的Caspase底物用于終點(diǎn)法測(cè)定,而將AMC和AFC標(biāo)記的 Caspase底物用于動(dòng)力學(xué)測(cè)定。
圖.從左到右,分別是AMC(7-氨基-4-甲基香豆素),AFC(7-氨基-4-三氟甲基香豆素),Rhodamine 110(R110)和ProRed™620的激發(fā)和發(fā)射光譜。
表4.熒光半胱天冬酶底物。
底物名稱(chēng) | 對(duì)應(yīng)的Caspase | Ex(nm) | Em(nm) | ε¹ | Φ² |
Ac-DEVD-AFC * CAS 201608-14-2 * | 半胱天冬酶3、7 | 376 | 482 | 17000 | 0.53 |
Ac-DEVD-AMC * CAS 169332-61-0 * | 半胱天冬酶3、7 | 341 | 441 | 19000 | N / D |
Z-DEVD-AFC | 半胱天冬酶3、7 | 376 | 482 | 17000 | 0.53 |
Z-DEVD-AMC * CAS 1135416-11-3 * | 半胱天冬酶3、7 | 341 | 441 | 19000 | N / D |
Z-DEVD-ProRed™620 | 半胱天冬酶3、7 | 532 | 619 | N / D | N / D |
(Z-DEVD)2 -R110 * CAS 223538-61-2 * | 半胱天冬酶3、7 | 500 | 522 | 80000 | N / D |
Z-DEVD-ProRed™620 | 半胱天冬酶3、7 | 532 | 619 | N / D | N / D |
Ac-IETD-AFC * CAS 211990-57-7 * | 半胱天冬酶8,顆粒酶B | 376 | 482 | 17000 | 0.53 |
Z-IETD-AFC * CAS 219138-02-0 * | 半胱天冬酶8,顆粒酶B | 376 | 482 | 17000 | 0.53 |
注意:
1.ε=在其最大吸收波長(zhǎng)處的摩爾消光系數(shù)(單位= cm -1M -1)。
2.Φ=水性緩沖液(pH 7.2)中的熒光量子產(chǎn)率。
Caspase抑制劑
Caspase抑制劑能與Caspase的活性位點(diǎn)結(jié)合并形成可逆或不可逆的連接,通常,Caspase抑制劑的結(jié)構(gòu)由Caspase識(shí)別序列,諸如醛(-CHO)或氟甲基酮(-FMK)的官能團(tuán)組成。具有醛官能團(tuán)的胱天蛋白酶抑制劑是可逆的,而具有FMK的抑制劑是不可逆的。半胱天冬酶底物和抑制劑都具有較小的細(xì)胞毒性作用,因此,它們是研究半胱天冬酶活性的有用工具。
表5. 可逆和不可逆的Caspase酶抑制劑
抑制劑 | Caspase的種類(lèi) | 是否可逆 | Ex(nm) | Em(nm) |
Ac-DEVD-CHO * CAS 169332-60-9 * | 半胱天冬酶3、7 | 可逆的 | -- | -- |
Ac-IETD-CHO * CAS 191338-86-0 * | 半胱天冬酶8 | 可逆的 | -- | -- |
mFluor™450-VAD-FMK | 半胱天冬酶1,2,3,6,8,9,10 | 不可逆的 | 406 | 445 |
mFluor™510-VAD-FMK | 半胱天冬酶1,2,3,6,8,9,10 | 不可逆的 | 412 | 505 |
FITC-C6-DEVD-FMK | 半胱天冬酶3、7 | 不可逆的 | 491 | 516 |
FITC-C6-DEVD-FMK | 半胱天冬酶3、7 | 不可逆的 | 491 | 516 |
FITC-C6-LEHD-FMK | 半胱天冬酶9 | 不可逆的 | 491 | 516 |
FITC-C6-LEHD-FMK | 半胱天冬酶9 | 不可逆的 | 491 | 516 |
FAM-VAD-FMK | 半胱天冬酶1,2,3,6,8,9,10 | 不可逆的 | 493 | 517 |
SRB-VAD-FMK [磺胺丁胺B-VAD-FMK] | 半胱天冬酶1,2,3,6,8,9,10 | 不可逆的 | 559 | 577 |
多肽熒光標(biāo)記由于沒(méi)有放射性,實(shí)驗(yàn)操作簡(jiǎn)單。因此,目前在生物學(xué)研究中多肽熒光標(biāo)記應(yīng)用非常廣泛,多肽熒光標(biāo)記方法與熒光試劑的結(jié)構(gòu)有關(guān)系,對(duì)于有游離羧基的采用的方法與接多肽反應(yīng)相同,也采用HBTU/HOBt/DIEA方法連接。 在N端標(biāo)記FITC的多肽需經(jīng)歷環(huán)化作用來(lái)形成熒光素,通常會(huì)伴有最后一個(gè)氨基酸的去除,但當(dāng)有一個(gè)間隔器如氨基己酸,或者是通過(guò)非酸性環(huán)境將目的多肽從樹(shù)脂上切下來(lái)時(shí),這種情況可避免在切割的過(guò)程中被TFA切割掉。
人們利用利用熒光標(biāo)記的多肽來(lái)檢測(cè)目標(biāo)蛋白的活性,并將 其發(fā)展的高通量活性篩選方法應(yīng)用于疾病治療靶點(diǎn)蛋白的藥物篩選和藥物開(kāi)發(fā)(例如,各種激 酶、磷酸酶、肽酶等)。
專(zhuān)肽生物能夠提供技術(shù)成熟的各種熒光標(biāo)記多肽。
下面是一些常見(jiàn)的多肽修飾熒光物質(zhì)結(jié)構(gòu):
FITC標(biāo)記
FITC(異硫氰酸熒光素)具有比較高的活性,我們公司可以通過(guò)兩種方式將FITC標(biāo)記于多肽 上:(1) 將FITC標(biāo)記于賴(lài)氨酸(Lys)或被選擇性地脫保護(hù)的鳥(niǎo)氨酸(ornithine)側(cè)鏈氨基 上;(2) 將FITC標(biāo)記于多肽N端氨基。
當(dāng)在N端標(biāo)記時(shí),建議在最后一個(gè)氨基和由異硫氰酸酯與氨基反應(yīng)產(chǎn)生的硫脲鍵之間引入 烷基間隔器(alkyl spacer),如氨基己酸(Ahx)。鏈接切割需要酸性環(huán)境,在N端標(biāo)記FITC 的多肽需經(jīng)歷環(huán)化作用來(lái)形成熒光素,通常會(huì)伴有最后一個(gè)氨基酸的去除,但當(dāng)有一個(gè)間隔器 如氨基己酸,或者是通過(guò)非酸性環(huán)境將目的肽從樹(shù)脂上切下來(lái)時(shí),這種情況可避免??臻g位阻 被認(rèn)為是在熒光染料前使用Ahx的主要原因,而不是為什么FITC不能直接偶聯(lián)在多肽上的原因。
Ahx或b-Ala均可作為間隔器用于FITC標(biāo)記的多肽上。
熒光修飾中文名稱(chēng) | N端 | N端帶有l(wèi)inker |
生物素標(biāo)記多肽 | Biotin- | Biotin-Ahx- |
異硫氰酸熒光素 | FITC- | FITC-Ahx- |
5-羧基熒光素 | 5-FAM- | 5-FAM-Ahx- |
丹磺酰熒光素 | Dansyl- | Dansyl-Ahx- |
5-羧基四甲基羅丹明 | TMR- (TAMRA-) | TMR-Ahx- (TAMRA-Ahx-) |
多肽N端 | 多肽序列中間 | N端帶有l(wèi)inker |
生物素標(biāo)記多肽 | Biotin- | 多肽C端 |
Lys(Biotin)- | -Lys(Biotin)-- | -Lys(Biotin) |
Lys(FITC)- | -Lys(FITC)- | -Lys(FITC) |
Lys(5-FAM)- | -Lys(5-FAM)- | -Lys(5-FAM) |
Lys(Dansyl)- | -Lys(Dansyl)- | -Lys(Dansyl) |
Lys(TMR)- | -Lys(TMR)- | -Lys(TMR) |
Lys(Dnp)- | -Lys(Dnp)- | -Lys(Dnp) |
專(zhuān)肽常做的熒光物質(zhì)的激發(fā)光波長(zhǎng)和發(fā)射光波長(zhǎng)??晒﹨⒖歼x擇:
熒光基團(tuán) | Ex(nm) | Em(nm) | 熒光基團(tuán) | Ex(nm) | Em(nm) |
羥基香豆素 | 325 | 386 | R-phycoerythrin (PE) (489) | 565 | 578 |
丹磺酰氯 | 340 | 578 | Rhodamine Red-X | 560 | 580 |
AMC | 345 | 445 | Tamara | 565 | 580 |
甲氧基香豆素 | 360 | 410 | Alexa fluor 555 | 556 | 573 |
Alexa fluor 系列 | 345 | 442 | Alexa fluor 546 | 556 | 573 |
氨基香豆素 | 350 | 445 | Rox | 575 | 602 |
Dabcyl | 453 | - | Alexa fluor 568 | 578 | 603 |
Cy2 | 490 | 510 | Texas Red | 589 | 615 |
FAM | 495 | 517 | Alexa fluor 594 | 590 | 617 |
Alexa fluor 488 | 494 | 517 | Alexa fluor | 621 | 639 |
FITC | 495 | 519 | Alexa fluor 633 | 650 | 668 |
Alexa fluor 430 | 430 | 545 | Cy5 (625) | 650 | 670 |
5-FAM | 492 | 518 | Alexa fluor 660 | 663 | 690 |
Alexa fluor 532 | 530 | 530 | Cy5.5 | 675 | 694 |
HEX | 535 | 556 | TruRed | 490; 675 | 695 |
5-TAMRA | 542 | 568 | Alexa fluor 680 | 679 | 702 |
Cy3 | 550 | 570 | Cy7 | 743 | 767 |
TRITC | 547 | 572 | Cy3.5 | 581 |
596
|
Basak, S. et al. Biochem. J. 380, 505 (2004).