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多肽產(chǎn)品

杭州專(zhuān)肽生物的產(chǎn)品

Proprotein Convertase Substrate, PC4, Mca - labele

編號(hào):434523

CAS號(hào):

單字母:Ac-KTKQLR-AMC

糾錯(cuò)
  • 編號(hào):434523
    中文名稱(chēng):Proprotein Convertase Substrate, PC4, Mca - labele
    英文名:Proprotein Convertase Substrate, PC4, Mca - labele
    單字母:Ac-KTKQLR-AMC
    三字母:Ac

    N端乙?;舛?/p>-Lys

    賴(lài)氨酸

    -Thr

    蘇氨酸

    -Lys

    賴(lài)氨酸

    -Gln

    谷氨酰胺

    -Leu

    亮氨酸

    -Arg

    精氨酸

    -AMC

    7-氨基-4-甲基香豆素

    氨基酸個(gè)數(shù):6
    分子式:C45H73O11N13
    平均分子量:972.14
    精確分子量:971.56
    等電點(diǎn)(PI):-
    pH=7.0時(shí)的凈電荷數(shù):3
    平均親水性:1.1666666666667
    疏水性值:-2.12
    消光系數(shù):-
    標(biāo)簽:酶底物肽(Substrate Peptide)    AMC修飾肽   

  •  Caspase酶對(duì)應(yīng)的底物,Caspases(半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶,半胱氨酸依賴(lài)性天冬氨酸定向蛋白酶)是一類(lèi)蛋白酶家族,其功能與凋亡(程序性細(xì)胞死亡),壞死和發(fā)燒(炎癥)的過(guò)程密切相關(guān)。

           什么是胱天蛋白酶?

          胱天蛋白酶(Caspases)是含半胱氨酸的天冬氨酸蛋白水解酶,它們是為細(xì)胞凋亡的主要介質(zhì)。多種受體,例如TNF-α 受體,F(xiàn)asL受體,TLR和死亡受體,以及Bcl-2和凋亡抑制劑(IAP)蛋白家族參與并調(diào)節(jié)該caspase依賴(lài)性凋亡途徑。一旦Caspase受到上游信號(hào)(外部或內(nèi)在)刺激被激活,即會(huì)參與執(zhí)行下游蛋白底物的水解作用,并觸發(fā)一系列事件,導(dǎo)致細(xì)胞分解,死亡,吞噬作用和細(xì)胞碎片的清除。

          人Caspases酶

          人的Caspases家族基于序列相似性和生物學(xué)功能等共性主要可分為三大類(lèi):第一類(lèi)由具有長(zhǎng)胱天蛋白酶募集結(jié)構(gòu)域的“炎癥”胱天蛋白酶組成,他們對(duì)P4位上的較大的芳香族或疏水性殘基具有親和力。第二類(lèi)由具有短的前體結(jié)構(gòu)域的“細(xì)胞凋亡效應(yīng)”胱天蛋白酶組成,而第三類(lèi)由具有長(zhǎng)的前提結(jié)構(gòu)域的Pap位置具有亮氨酸或纈氨酸底物親和力的“凋亡引發(fā)劑”胱天蛋白酶組成(表1)。

           表1. 人胱天蛋白酶的功能分類(lèi):

    細(xì)胞死亡途徑 半胱天冬酶類(lèi)型 酵素 物種
    細(xì)胞凋亡 啟動(dòng)器 Caspases 2 人與鼠
    細(xì)胞凋亡 啟動(dòng)器 Caspases 8 人與鼠
    細(xì)胞凋亡 啟動(dòng)器 Caspases 9 人與鼠
    細(xì)胞凋亡 啟動(dòng)器 Caspases 10 人的
    細(xì)胞凋亡 效應(yīng)器 Caspases 3 人與鼠
    細(xì)胞凋亡 效應(yīng)器 Caspases 6 人與鼠
    細(xì)胞凋亡 效應(yīng)器 Caspases 6 人與鼠
    細(xì)胞焦亡 炎性的 Caspases 1 人與鼠
    細(xì)胞焦亡 炎性的 Caspases 4 人的
    細(xì)胞焦亡 炎性的 Caspases 5 人的

           啟動(dòng)器Caspase和效應(yīng)器Caspase酶

          根據(jù)其在凋亡胱天蛋白酶途徑中的作用,胱天蛋白酶可分為兩類(lèi):?jiǎn)?dòng)器和效應(yīng)器Caspase酶。啟動(dòng)器和效應(yīng)器Caspas酶都具有由小亞基和大亞基組成的催化位點(diǎn),Caspase酶的識(shí)別位

          凋亡啟動(dòng)器Caspase酶,例如caspase-2,-8,-9和-10可以啟動(dòng)caspase激活級(jí)聯(lián)反應(yīng)。Caspase-8對(duì)于形成死亡誘導(dǎo)信號(hào)復(fù)合物(DISC)是必不可少的,并且在激活后,Caspase-8激活下游效應(yīng)子Caspase(例如Caspase 3)并介導(dǎo)線(xiàn)粒體中細(xì)胞色素c的釋放。Caspase-8已被證明對(duì)IETD肽序列具有相對(duì)較高的底物選擇性。凋亡效應(yīng)胱天蛋白酶例如Caspase-3,-6和-7雖然不負(fù)責(zé)啟動(dòng)級(jí)聯(lián)途徑,但是當(dāng)被激活時(shí),它們?cè)诩?jí)聯(lián)的中間和后續(xù)步驟中起著不可或缺的作用。Caspase-3(CPP32 / apopain)是關(guān)鍵效應(yīng)器,因?yàn)樗糯罅藖?lái)自啟動(dòng)器Caspase的信號(hào),使用對(duì)Caspase-3有選擇性的DEVD肽序列對(duì)活化的Caspase-3進(jìn)行檢測(cè),可以檢測(cè)Caspase-3的活性。

           Caspase酶底物和抑制劑

          Caspase底物和抑制劑由兩個(gè)關(guān)鍵成分組成:Caspase識(shí)別序列和信號(hào)產(chǎn)生或蛋白酶抑制基序。不同Caspase識(shí)別序列不同,一般由三個(gè)或四個(gè)氨基酸組成(表2)。Caspase酶識(shí)別序列的N端通常有乙?;ˋc)或碳苯甲氧基(Z)基團(tuán)修飾,以增強(qiáng)膜的通透性。對(duì)應(yīng)的Caspase識(shí)別特定的肽序列為其酶促反應(yīng)切割位點(diǎn),釋放產(chǎn)生信號(hào)或抑制信號(hào)的基序。Caspase的顯色和熒光底物均以相似的方式起作用,其中底物的信號(hào)或顏色強(qiáng)度與蛋白水解活性成正比。

           表2. Caspase的底物及其序列

    多肽 氨基酸序列 對(duì)應(yīng)的Caspase的種類(lèi)
    IETD Ile-Glu-Thr-Asp Caspase 8,顆粒酶B
    DEVD Asp-Glu-Val-Asp Caspase 3、6、7、8或10
    LEHD Leu-Glu-His-Asp Caspase 9
    VAD Val-Ala-Asp Caspase 1、2、3、6、8、9或10

             Caspase酶的顯色底物

          Caspase的顯色底物是有Caspase識(shí)別序列及生色基團(tuán)組成,常見(jiàn)的生色團(tuán)有pNA(對(duì)硝基苯胺或4-硝基苯胺),可使用酶標(biāo)儀或分光光度計(jì)在405 nm處進(jìn)行光密度檢測(cè)。

           表3. Caspase的顯色底物

    底物 Caspase 吸收(nm) 顏色
    Ac-DEVD-pNA * CAS 189950-66-1 * 半胱天冬酶3 405 nm 黃色
    Z-DEVD-pNA 半胱天冬酶3 405 nm 黃色
    Z-IETD-pNA * CAS 219138-21-3 * 半胱天冬酶8,顆粒酶B 405 nm 黃色

           Caspase的熒光底物

          Caspase的熒光底物的結(jié)構(gòu)包含與半胱天冬酶識(shí)別相關(guān)的熒光團(tuán),例如7-氨基-4-甲基香豆素(AMC),7-氨基-4-三氟甲基香豆素(AFC), Rhodamine 110(R110)或ProRed™620。R110的Caspase底物比基于香豆素的Caspase底物(例如AMC和AFC)更敏感,但由于兩步裂解過(guò)程,其動(dòng)態(tài)范圍更窄。 建議將R110標(biāo)記的Caspase底物用于終點(diǎn)法測(cè)定,而將AMC和AFC標(biāo)記的 Caspase底物用于動(dòng)力學(xué)測(cè)定。

          圖.從左到右,分別是AMC(7-氨基-4-甲基香豆素),AFC(7-氨基-4-三氟甲基香豆素),Rhodamine 110(R110)和ProRed™620的激發(fā)和發(fā)射光譜。

           表4.熒光半胱天冬酶底物。

    底物名稱(chēng) 對(duì)應(yīng)的Caspase Ex(nm) Em(nm) ε¹ Φ²
    Ac-DEVD-AFC * CAS 201608-14-2 * 半胱天冬酶3、7 376 482 17000 0.53
    Ac-DEVD-AMC * CAS 169332-61-0 * 半胱天冬酶3、7 341 441 19000 N / D
    Z-DEVD-AFC 半胱天冬酶3、7 376 482 17000 0.53
    Z-DEVD-AMC * CAS 1135416-11-3 * 半胱天冬酶3、7 341 441 19000 N / D
    Z-DEVD-ProRed™620 半胱天冬酶3、7 532 619 N / D N / D
    (Z-DEVD)2 -R110 * CAS 223538-61-2 * 半胱天冬酶3、7 500 522 80000 N / D
    Z-DEVD-ProRed™620 半胱天冬酶3、7 532 619 N / D N / D
    Ac-IETD-AFC * CAS 211990-57-7 * 半胱天冬酶8,顆粒酶B 376 482 17000 0.53
    Z-IETD-AFC * CAS 219138-02-0 * 半胱天冬酶8,顆粒酶B 376 482 17000 0.53

           注意:

            1.ε=在其最大吸收波長(zhǎng)處的摩爾消光系數(shù)(單位= cm -1-1)。

          2.Φ=水性緩沖液(pH 7.2)中的熒光量子產(chǎn)率。

           Caspase抑制劑

          Caspase抑制劑能與Caspase的活性位點(diǎn)結(jié)合并形成可逆或不可逆的連接,通常,Caspase抑制劑的結(jié)構(gòu)由Caspase識(shí)別序列,諸如醛(-CHO)或氟甲基酮(-FMK)的官能團(tuán)組成。具有醛官能團(tuán)的胱天蛋白酶抑制劑是可逆的,而具有FMK的抑制劑是不可逆的。半胱天冬酶底物和抑制劑都具有較小的細(xì)胞毒性作用,因此,它們是研究半胱天冬酶活性的有用工具。

           表5. 可逆和不可逆的Caspase酶抑制劑

    抑制劑 Caspase的種類(lèi) 是否可逆 Ex(nm) Em(nm)
    Ac-DEVD-CHO * CAS 169332-60-9 * 半胱天冬酶3、7 可逆的 -- --
    Ac-IETD-CHO * CAS 191338-86-0 * 半胱天冬酶8 可逆的 -- --
    mFluor™450-VAD-FMK 半胱天冬酶1,2,3,6,8,9,10 不可逆的 406 445
    mFluor™510-VAD-FMK 半胱天冬酶1,2,3,6,8,9,10 不可逆的 412 505
    FITC-C6-DEVD-FMK 半胱天冬酶3、7 不可逆的 491 516
    FITC-C6-DEVD-FMK 半胱天冬酶3、7 不可逆的 491 516
    FITC-C6-LEHD-FMK 半胱天冬酶9 不可逆的 491 516
    FITC-C6-LEHD-FMK 半胱天冬酶9 不可逆的 491 516
    FAM-VAD-FMK 半胱天冬酶1,2,3,6,8,9,10 不可逆的 493 517
    SRB-VAD-FMK [磺胺丁胺B-VAD-FMK] 半胱天冬酶1,2,3,6,8,9,10 不可逆的 559 577

    多肽熒光標(biāo)記由于沒(méi)有放射性,實(shí)驗(yàn)操作簡(jiǎn)單。因此,目前在生物學(xué)研究中多肽熒光標(biāo)記應(yīng)用非常廣泛,多肽熒光標(biāo)記方法與熒光試劑的結(jié)構(gòu)有關(guān)系,對(duì)于有游離羧基的采用的方法與接多肽反應(yīng)相同,也采用HBTU/HOBt/DIEA方法連接。 在N端標(biāo)記FITC的多肽需經(jīng)歷環(huán)化作用來(lái)形成熒光素,通常會(huì)伴有最后一個(gè)氨基酸的去除,但當(dāng)有一個(gè)間隔器如氨基己酸,或者是通過(guò)非酸性環(huán)境將目的多肽從樹(shù)脂上切下來(lái)時(shí),這種情況可避免在切割的過(guò)程中被TFA切割掉。
            人們利用利用熒光標(biāo)記的多肽來(lái)檢測(cè)目標(biāo)蛋白的活性,并將 其發(fā)展的高通量活性篩選方法應(yīng)用于疾病治療靶點(diǎn)蛋白的藥物篩選和藥物開(kāi)發(fā)(例如,各種激 酶、磷酸酶、肽酶等)。
            專(zhuān)肽生物能夠提供技術(shù)成熟的各種熒光標(biāo)記多肽。
     

     

    下面是一些常見(jiàn)的多肽修飾熒光物質(zhì)結(jié)構(gòu):




    FITC標(biāo)記
     

     

          FITC(異硫氰酸熒光素)具有比較高的活性,我們公司可以通過(guò)兩種方式將FITC標(biāo)記于多肽 上:(1) 將FITC標(biāo)記于賴(lài)氨酸(Lys)或被選擇性地脫保護(hù)的鳥(niǎo)氨酸(ornithine)側(cè)鏈氨基 上;(2) 將FITC標(biāo)記于多肽N端氨基。

     

          當(dāng)在N端標(biāo)記時(shí),建議在最后一個(gè)氨基和由異硫氰酸酯與氨基反應(yīng)產(chǎn)生的硫脲鍵之間引入 烷基間隔器(alkyl spacer),如氨基己酸(Ahx)。鏈接切割需要酸性環(huán)境,在N端標(biāo)記FITC 的多肽需經(jīng)歷環(huán)化作用來(lái)形成熒光素,通常會(huì)伴有最后一個(gè)氨基酸的去除,但當(dāng)有一個(gè)間隔器 如氨基己酸,或者是通過(guò)非酸性環(huán)境將目的肽從樹(shù)脂上切下來(lái)時(shí),這種情況可避免??臻g位阻 被認(rèn)為是在熒光染料前使用Ahx的主要原因,而不是為什么FITC不能直接偶聯(lián)在多肽上的原因。

     

          Ahx或b-Ala均可作為間隔器用于FITC標(biāo)記的多肽上。

     

     

     



     

    普通熒光修飾

     

    熒光修飾中文名稱(chēng) N端 N端帶有l(wèi)inker
    生物素標(biāo)記多肽 Biotin- Biotin-Ahx-
    異硫氰酸熒光素 FITC-   FITC-Ahx-  
    5-羧基熒光素 5-FAM- 5-FAM-Ahx- 
    丹磺酰熒光素 Dansyl- Dansyl-Ahx- 
    5-羧基四甲基羅丹明 TMR-  (TAMRA-) TMR-Ahx-  (TAMRA-Ahx-) 

    通過(guò)Lys側(cè)鏈氨基連接的熒光修飾

     

    多肽N端 多肽序列中間 N端帶有l(wèi)inker
    生物素標(biāo)記多肽 Biotin- 多肽C端
    Lys(Biotin)-  -Lys(Biotin)-- -Lys(Biotin) 
    Lys(FITC)- -Lys(FITC)-  -Lys(FITC)
    Lys(5-FAM)- -Lys(5-FAM)- -Lys(5-FAM)
    Lys(Dansyl)-  -Lys(Dansyl)- -Lys(Dansyl)
    Lys(TMR)- -Lys(TMR)-  -Lys(TMR)
    Lys(Dnp)- -Lys(Dnp)-  -Lys(Dnp)



    專(zhuān)肽常做的熒光物質(zhì)的激發(fā)光波長(zhǎng)和發(fā)射光波長(zhǎng)??晒﹨⒖歼x擇:
     

    熒光基團(tuán) Ex(nm) Em(nm) 熒光基團(tuán) Ex(nm) Em(nm)
    羥基香豆素 325 386 R-phycoerythrin (PE) (489) 565 578
    丹磺酰氯 340 578 Rhodamine Red-X 560 580
    AMC 345 445 Tamara 565 580
    甲氧基香豆素 360 410 Alexa fluor 555 556 573
    Alexa fluor 系列 345 442 Alexa fluor 546 556 573
    氨基香豆素 350 445 Rox 575 602
    Dabcyl 453 - Alexa fluor 568 578 603
    Cy2 490 510 Texas Red 589 615
    FAM 495 517 Alexa fluor 594 590 617
    Alexa fluor 488 494 517 Alexa fluor 621 639
    FITC 495 519 Alexa fluor 633 650 668
    Alexa fluor 430 430 545 Cy5 (625) 650 670
    5-FAM 492 518 Alexa fluor 660 663 690
    Alexa fluor 532 530 530 Cy5.5 675 694
    HEX 535 556 TruRed 490; 675 695
    5-TAMRA 542 568 Alexa fluor 680 679 702
    Cy3 550 570 Cy7 743 767
    TRITC 547 572 Cy3.5 581

    596

     

  • Basak, S. et al. Biochem. J. 380, 505 (2004).

  • 暫時(shí)沒(méi)有數(shù)據(jù)
  • 暫時(shí)沒(méi)有數(shù)據(jù)