N端氨基：N-terminal amino group。在肽或多肽鏈中含有游離a-氨基的氨基酸一端。在表示氨基酸序列時，通常將N端放在肽鏈的左邊。

丙氨酸：alanine。L-丙氨酸的系統(tǒng)命名為(2S)-氨基丙酸，是編碼氨基酸，也叫L-α-丙氨酸。符號：A，Ala。D-丙氨酸存在于多種細菌細胞壁的糖肽中。β-丙氨酸是維生素泛酸和輔酶A的組分。

L-蘇氨酸：threonine。系統(tǒng)命名為(2S)-氨基-(3R)-羥基丁酸。有兩個手性中心，是編碼氨基酸。是哺乳動物的必需氨基酸。符號：T，Thr。

L-賴氨酸：lysine。系統(tǒng)命名為(2S)-6-二氨基已酸。是編碼氨基酸中的堿性氨基酸，哺乳動物的必需氨基酸。在蛋白質中的賴氨酸可以被修飾為多種形式的衍生物。符號：K，Lys。

丙氨酸：alanine。L-丙氨酸的系統(tǒng)命名為(2S)-氨基丙酸，是編碼氨基酸，也叫L-α-丙氨酸。符號：A，Ala。D-丙氨酸存在于多種細菌細胞壁的糖肽中。β-丙氨酸是維生素泛酸和輔酶A的組分。

丙氨酸：alanine。L-丙氨酸的系統(tǒng)命名為(2S)-氨基丙酸，是編碼氨基酸，也叫L-α-丙氨酸。符號：A，Ala。D-丙氨酸存在于多種細菌細胞壁的糖肽中。β-丙氨酸是維生素泛酸和輔酶A的組分。

L-精氨酸：arginine。系統(tǒng)命名為(2S)-氨基-5-胍基戊酸。在生理條件下帶正電荷，為編碼氨基酸。是幼小哺乳動物的必需氨基酸。符號：R，Arg。

L-賴氨酸：lysine。系統(tǒng)命名為(2S)-6-二氨基已酸。是編碼氨基酸中的堿性氨基酸，哺乳動物的必需氨基酸。在蛋白質中的賴氨酸可以被修飾為多種形式的衍生物。符號：K，Lys。

L-絲氨酸：serine。系統(tǒng)命名為(2S)-氨基-3-羥基丙酸。是編碼氨基酸。因可從蠶絲中獲得而得名。符號：S，Ser。在絲原蛋白及某些抗菌素中含有 D-絲氨酸。

丙氨酸：alanine。L-丙氨酸的系統(tǒng)命名為(2S)-氨基丙酸，是編碼氨基酸，也叫L-α-丙氨酸。符號：A，Ala。D-丙氨酸存在于多種細菌細胞壁的糖肽中。β-丙氨酸是維生素泛酸和輔酶A的組分。

L-脯氨酸：proline。系統(tǒng)命名為吡咯烷-(2S)-羧酸。為亞氨基酸。是編碼氨基酸。在肽鏈中有特殊作用，如易形成順式的肽鍵等。符號：P，Pro。

丙氨酸：alanine。L-丙氨酸的系統(tǒng)命名為(2S)-氨基丙酸，是編碼氨基酸，也叫L-α-丙氨酸。符號：A，Ala。D-丙氨酸存在于多種細菌細胞壁的糖肽中。β-丙氨酸是維生素泛酸和輔酶A的組分。

L-蘇氨酸：threonine。系統(tǒng)命名為(2S)-氨基-(3R)-羥基丁酸。有兩個手性中心，是編碼氨基酸。是哺乳動物的必需氨基酸。符號：T，Thr。

甘氨酸：glycine。系統(tǒng)命名為 2-氨基乙酸。是編碼氨基酸中沒有旋光性的最簡單的氨基酸，因具有甜味而得名。符號：G，Gly。

甘氨酸：glycine。系統(tǒng)命名為 2-氨基乙酸。是編碼氨基酸中沒有旋光性的最簡單的氨基酸，因具有甜味而得名。符號：G，Gly。

L-纈氨酸：valine。系統(tǒng)命名為(2S)-氨基-3-甲基丁酸。是編碼氨基酸。是哺乳動物的必需氨基酸。符號：V，Val。在某些放線菌素如纈霉素中存在 D-纈氨酸。

側鏈3甲基化的賴氨酸

L-賴氨酸：lysine。系統(tǒng)命名為(2S)-6-二氨基已酸。是編碼氨基酸中的堿性氨基酸，哺乳動物的必需氨基酸。在蛋白質中的賴氨酸可以被修飾為多種形式的衍生物。符號：K，Lys。

L-脯氨酸：proline。系統(tǒng)命名為吡咯烷-(2S)-羧酸。為亞氨基酸。是編碼氨基酸。在肽鏈中有特殊作用，如易形成順式的肽鍵等。符號：P，Pro。

L-組氨酸：histidine。系統(tǒng)命名為(2S)-氨基-3-(4-咪唑基)丙酸。其側鏈帶有弱堿性的咪唑基，為編碼氨基酸。是幼小哺乳動物的必需氨基酸。符號：H，His。

L-精氨酸：arginine。系統(tǒng)命名為(2S)-氨基-5-胍基戊酸。在生理條件下帶正電荷，為編碼氨基酸。是幼小哺乳動物的必需氨基酸。符號：R，Arg。

L-酪氨酸：tyrosine。系統(tǒng)命名為(2S)-氨基-3-(4-羥基苯基)丙酸。是編碼氨基酸。符號：Y，Tyr。

C端羧基：C-terminal carboxyl group。在肽或多肽鏈中含有游離羧基的氨基酸一端。在表示氨基酸序列時，通常將C端放在肽鏈的右邊。